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【学习】杭州六天学习:DTI、DKI、TBSS、基于白质纤维的网络构建等



第9期小班:DTIDKITBSS基于

白质纤维的网络构建以及VBM


2020.11.24-2020.11.29(周二~周日)

主办单位:杭州脑海科技有限公司

协办单位:杭州师范大学心理科学研究院

                  杭州拾睿科技有限公司


1. 简要说明


1) 本期培训班在杭州举办为期6天(11月24日-11月29日)

2) 内容涵盖:

  • VBM原理以及数据分析介绍

  • 脑结构Meta分析原理及介绍

  • DTI原理及入门

  • TBSS分析方法介绍及实操

  • DKI成像原理及分析实操

  • 确定性纤维追踪原理及网络构建(理论+实操)

  • 概率性纤维追踪原理及网络构建(理论+实操)

  • DTI数据的统计分析及结果呈现

3)本课程适合对VBM、DTI以及DKI分析感兴趣的学员



2. 课程说明


      弥散张量成像(DTI),是一种无侵入性的活体大脑结构成像技术,该技术可以通过检测水分子在大脑不同区域内的扩散特性,从而无创的评估大脑的白质纤维束走向信息。近年来,越来越多的研究中使用DTI技术,国内的许多研究表明弥散张量成像对阿尔茨海默病、慢性中风、抑郁症、癫痫以及精神分裂症等疾病的病理特异性研究起到了非常重要的作用。对于纤维束的研究,可能为脑疾病的早期诊断提供有效的技术手段。

      为了协助大家更快速的了解大脑结构成像技术,我们拟举办一期专门针对大脑结构数据分析的培训班,内容涵盖,基于体素的形态学分析(VBM)、弥散张量成像技术介绍(DTI)、TBSS、确定性纤维追踪、概率性纤维追踪以及基于白质纤维的网络构建,此外我们还增加了DKI技术原理及数据分析操作。

      本次培训希望协助刚刚接触磁共振成像的科研工作者快速了解DTI、DKI以及VBM的相关原理及数据分析操作,比如各个科室的临床医生,神经内科、精神科(心理科)、放射科、康复科、消化科、儿科等科室,以及各大高校从事脑科学的研究人员:生物医学工程、计算机、数学专业等。


    注:请提前一天到会场2020年11月23日(13:30 - 20:00)安装软件、熟悉场地、拷贝资料等。


3. 课程安排

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上午贾熙泽
  • 课程总论以及重要概念介绍

臧玉峰
  • 静息态功能磁共振概述及其在认知与脑疾病的应用前景

下午贾熙泽
  • VBM原理以及介绍

  • VBM数据分析实操练习

  • VBM统计分析

  • 脑影像Meta分析原理及介绍

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上午贾熙泽
  • 不同Meta分析软件的区别

  • 脑结构Meta分析的文献检索及注册

  • 基于ALE的脑结构Meta分析实操

下午张韬
  • DTI数据整理及注意事项

黄国峰
  • Linux入门及操作

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吕亚婷
  • DTI基础原理

  • DTI数据分析基本流程以及FSL初步使用

吕亚婷
  • TBSS分析方法介绍

  • TBSS数据分析实操以及结果呈现

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刘小征
  • DKI成像原理

  • DKI数据采集的扫描参数

  • 基于DKI模型的数据重建

  • DKI不同参数的物理意义

刘小征
  • DKE的图形界面处理

  • 基于DKI模型的纤维追踪

  • DTI/DKI的纤维束分析方法

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仲苏玉
  • 确定性纤维追踪原理介绍及应用现状

  • 概率性纤维追踪原理介绍及应用现状

  • 脑白质网络原理介绍及应用现状介绍

仲苏玉
  • 脑网络节点定义(上机操作)

  • 基于DiffusionToolkit的确定性纤维追踪(上机操作)

  • 确定性纤维追踪的结果显示及统计(上机操作)

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仲苏玉
  • 确定性网络构建(上机操作;panda)

  • 基于fsl的概率性纤维追踪的数据分析一:BedPostX(上机操作)

仲苏玉
  • 基于fsl的概率性纤维追踪的数据分析二:纤维追踪;(上机操作)

  • 概率性纤维追踪的结果介绍

  • 概率性网络构建(上机操作



备注:请各位学员自带笔记本电脑,建议电脑配置:windows 64位系统、8G以上内存、80G以上剩余硬盘空间。请尽量携带Windows电脑,如果只能使用苹果MAC电脑,请提前使用Bootcmap安装windows 64位系统


4. 授课老师


臧玉峰:医学博士。杭州师范大学心理科学研究院执行院长。1984年于河北医学院获医学学士学位、1991年于天津医学院获神经外科学硕士学位、2002年于北京大学精神卫生研究所获儿童精神卫生博士学位。曾经从事临床神经外科工作14年,之后在中科院自动化所模式识别国家重点实验室、北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室以及杭州师范大学工作。近年来主要从事静息态功能磁共振影像的计算方法学及其在认知与脑疾病的应用研究。与同事提出“局部一致性”和“低频振幅”等方法。带领研究团队开发了REST、DPARSF、RESTplus等软件。合作发表英语论文100多篇,Google Scholar数据库引用21319次(h指数64)。2014到2018年连续5年入选Elsevier“中国高被引学者”(神经科学),2017、2018年入选Clarivate 高被引学者(神经与行为科学)。


仲苏玉、:博士,现为北京邮电大学人工智能学院特聘副研究员。2016年6月于北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室获得博士学位;2016年6月至2020年8月期间,在北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室从事博士后工作。目前主持国家自然科学基金青年项目1项,完成博士后面上项目1项,并作为主要参与人参与多项国家自然科学基金项目。主要从事基于弥散磁共振成像的人脑白质连接组学的方法学及其应用研究。目前已在相关领域国际权威期刊共发表SCI论文21篇,其中包括以第一作者身份在Cerebral Cortex, Human Brain Mapping等期刊发表论文8篇,以共同作者的身份在the Journal of neuroscience等主流SCI期刊发表论文13篇。参与开发了“弥散磁共振人脑图像的并行处理平台”(软件著作权登记号:2011SR091748;主要开发者),该软件的相关论文目前已被引用150余次。PANDA软件工具包已在国际神经影像工具共享平台上(http://www.nitrc.org/projects/panda)被下载20000余次,被国内外同行广泛使用,得到了非常好的反馈和评价。


刘小征:博士,温州医科大学附属第二医院脑功能研究所,研究方向为大脑白质成像方法和精神类疾病的发病机制和早期诊断。DTI分析软件,DTI   BrainImageScope主要开发人员。发表SCI文章30多篇,其中第一和通讯作者15篇。算法会议MCCAI文章三篇。在MICCAI,神经科学学会(SFN)年会获得口头报告三次。近5年,发表精神类疾病SCI文章13篇,被Neurobiology of Aging,Journal of Alzheimers Disease等杂志引用83次,获得浙江省医药卫生厅科学进步奖二等奖一项。Scientific reports,frontiers in neurology,brain and behavior审稿人。


吕亚婷:博士,现任杭州师范大学认知与脑疾病研究中心臧玉峰教授课题组担任副研究员,硕士毕业于中国科学院自动化研究所模式识别与智能系统国家重点实验室,2013年博士毕业于德国马克思普朗克人类认知与脑科学研究所。共发表SCI论文21篇。其中,以第一或通讯作者(含共同)在Annals of Neurology、Journal of Neurology、Human Brain Mapping等权威期刊发表SCI论文11篇。申报人研究成果具有较高的临床应用价值,得到了多个项目支持,目前主持1项科技部国家重大慢性非传染性疾病重点研发计划课题,2项国家自然科学基金项目及1项杭州市创业创新项目,共计取得科研经费近200万。目前担任国内神经科学顶级期刊Neuroscience Bulletin(影响因子4.246)的青年编委;Frontiers in Neuroscience的Review Editor;并担任Neuroimage, Neuroimage: Clinical, Science Bulletin, Frontiers系列等国内外刊物的审稿人。


贾熙泽:杭州师范大学助理研究员,臧玉峰教授课题组成员,杭州脑海科技有限公司创始人。具有计算机、心理学及神经科学交叉背景。目前主持国自然青年基金项目1项,并作为主要参与人参与多项国自然科学基金项目。主要研究方向为静息态功能磁共振方法学、脑影像Meta分析以及静息态数据分析软件开发。2013年起负责维护REST系列工具包,并开发了RESTplus,该软件的论文目前已发表到Science Bulletin(影响因子 9.5分)。静息态功能磁共振论坛(http://www.restfmri.net)管理员。合作发表SCI文章14篇(引用91次),其中主要作者5篇(第一作者或通讯作者)。Frontiers in Neuroscience杂志的Review Editor,Journal of Magnetic Resonance Imaging、Neural Plasticity、Scientific report等多个杂志的审稿人,曾多次受邀在国内外重要学术会议介绍静息态磁共振数据分析。


张韬:脑海科技高级数据分析工程师


黄国峰:脑海科技高级数据分析工程师


5. 培训说明


      培训班限额招生20人,报满截止。我们会按照缴费顺序安排座位,为方便会务安排,报名敬请从速。考虑到疫情原因,本次培训每名学员每天发1个口罩。学员需要提供杭州健康码(支付宝首页搜索‘杭州健康码’)。


6. 培训费用


      费用包括培训费、资料费、培训期间提供快餐、饮品以及点心,交通及住宿费用自理,每人3500元。本培训班开具可以报销的正式发票。可以现场刷公务卡,培训期间谢绝录像。可以银行卡转账或支付宝付款,支付宝账号:19941364880,杨会云


7. 培训地点


      培训地点:浙江省杭州市萧山区城厢街道金城路39号紫橙国际创新中心3号楼10楼,脑海科技第3会议室。


8. 报名方式


请将报名回执以及缴费回执发送至brainnews@163.com,我们会联系您。


9. 联系方式


网络学习班报名

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留言:杭州DTI


电话咨询:15829301719 (brainnews琪琪)

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报名回执表

单位名称(发票抬头,纳税人识别号)


发票类型(会议费/培训费)


姓名


性别


电话号码


微信


科室/专业


研究方向


银行信息

户名:杭州脑海科技有限公司

账号:3301040160015883146

开户行:杭州银行萧山支行

汇款备注

第9期小班

10. 在线支持服务


       脑海科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持以及合作服务,确保学员能够熟练掌握脑影像数据处理的相关方法。



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课程名称课程时间线上/线下
光遗传/膜片钳/钙成像技术网络学习班 2020年12月5日-6日线上
脑结构、功能磁共振数据处理混合基础实操班2020年11月27日-29日深圳
基于脑影像数据的机器学习初级实操班2020年12月4-6日深圳
脑电数据处理初级实操班-基于自主研发界面化简易操作2020年12月9-13日深圳
脑电图/脑磁图数据处理研讨班2020年11月27日-30日成都
脑功能磁共振数据处理培训班2020年12月26日至30日北京
基于多模态磁共振成像的脑网络数据处理分析2020年11月27日-29日北京
如何申请医学相关专利2020年12月12-13日线上 
单细胞测序数据挖掘、课题设计与基金写作学习班 2020年11月23日-27日线上 
2021年国自然课题设计与标书写作及预评审学习会2020月11月21日-22 日广州
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