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港中大开发AI研基因致癌成因
【大公报讯】癌症成因与基因变异有关,为助治疗癌症,香港中文大学提出用人工智能技术研究多种基因调控机制,发现可同时研究多种调控机制对基因表达的影响,突破以往只考虑单一或少量机制的传统研究模式。中大研究团队表示,该方法是探索基因调控的一个全新发明,盼协助医学界找出癌症成因,从而开发出更有效的预防和治疗方法。有关论文已刊登於国际权威科学期刊《Nature Machine Intelligence》。
中大近日开发崭新的“嵌入式基因表现框架”(Gene Expression Embedding frameworK,简称GEEK)来研究多种基因调控机制。GEEK利用人工智能领域的机器学习和自然语言处理技术,把基因当作文字看待,再选取重要数据分析。研究团队建立的GEEK框架,可同时研究基因表达和多种调节机制之间的关係,包括在三维基因组架构中不同DNA的互为接触、蛋白质之间的相互作用、基因组邻域、染色质的广泛可及性等。结果显示,当所有数据在GEEK框架下运算,整合多种基因机制,所显现出的基因调控规律,跟採用单一或少量机制的运算效果比较,明显更全面及完整。
主导是次研究的中大计算机科学与工程学系副教授叶旭立教授(图)表示:“团队将联同医学专家继续研究,套用GEEK去了解诱发肝癌的成因,之后再扩展至其他癌症研究上,盼协助医学界找出癌症的成因,从而开发出更有效的预防和治疗方法。”
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