Nature紧急呼吁:理性看待发表关于武汉新型冠状病毒的论文
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这两天网络上关于2020年12月中旬出现人传人的论文引起广泛关注。
2020年1月30日nature杂志再次为该事件发声China coronavirus: how many papers have been published?
nature杂志只是客观的给出了一些数据,并未做出评论。小编给大家梳理一下武汉新型冠状病毒的研究轨迹。
1.早期研究集中在病毒的结构或基因组
2020年1月7日国内实验室通过病原检测认为这是一种新型冠状病毒,获得该病毒的全基因组序列。
1月9日,Science杂志发表文章Scientists urge China to quickly share data on virus linked to pneumonia outbreak 认为中国科学家应该共享病毒信息。
2020年1月10日, 悉尼大学Edward C. Holmes和复旦大学张永振教授共同公开武汉新型冠状病毒的第一个基因组序列数据。研究人员在virologic.org网站和GenBank等在线平台上发布了有关病毒的基因组数据。
这些信息可用于识别药物靶标或开发疫苗,也为研制快速诊断的试剂盒提供了重要序列信息。
2020年1月11日Science杂志再次发表文章Chinese researchers reveal draft genome of virus implicated in Wuhan pneumonia outbreak对中国科学家迅速公布武汉新型冠状病毒的信息这一行为点赞。
2020年1月14日加拿大多伦多大学Kamran Khan团队在journal of travel medicine首次在线发表Pneumonia of Unknown Etiology in Wuhan, China: Potential for International Spread Via Commercial Air Travel 通过武汉出入境国际旅客流量,以预测这种疾病爆发后疾病扩散的方式。当时还称为不明性肺炎。
2020年1月15日复旦大学上海医学院基础医学院姜世勃教授在journal of medical virology 杂志上发表综述Recent advances in the detection of respiratory virus infection in humans.关注常见的呼吸道病毒的检测方法,其中提及武汉新型冠状病毒。
从2020年1月19日开始一些论文估计了病毒传播的速度、潜伏期的长短、被病毒感染后人们会开始出现症状的时间。
1月19日厦门大学公共卫生学院陈田木助理教授在预印网站bioRxiv上在线发表A mathematical model for simulating the transmission of Wuhan novel Coronavirus通过提出简化版的Bats-Hosts-Reservoir network数学模型预测新型肺炎的传播,并未做出实际的预测。
真正引起国人广泛关注的是在2020年1月21日中国科学院上海巴斯德研究所郝沛研究员在CIENCE CHINA Life Sciences发表文章揭示武汉新型冠状病毒属于Beta冠状病毒属(Betacoronavirus),在进化树的位置上,与SARS病毒和类SARS(SARS-like)病毒的类群相邻,但并不属于SARS和类SARS病毒类群。并进一步发现武汉新型冠状病毒突刺蛋白与人血管紧张素转化酶2(ACE2)蛋白作用并介导传染人的分子作用通路。
从这个时候起我们开始逐步认识武汉新型冠状病毒的认识。
2.武汉新型冠状病毒的宿主问题
2020年1月22日国内多家联合团队在医学病毒学杂志《 Journal of Medical Virology 》上发表文章揭示蛇可能是武汉新型冠状病毒的中间宿主,这项研究结果一度引起热议。但很快遭到质疑,批评者认为基于信息学数据就简单的得出蛇可能传播这种病毒的结论并不可靠。
2020年1月22日中科院武汉病毒研究所石正丽研究团队在生物学预印本bioRxiv网站上发表文章证明武汉新型冠状病毒的动物宿主最可能是蝙蝠,其同源性高度96%。并且进一步发现2019-nCoV和当年SARS病毒入侵人体细胞的结合受体都是血管紧张素转化酶2。
2020年1月24日Nature杂志发表Why snakes probably aren’t spreading the new China virus文章,他们认为蛇不会传播这种病毒。目前尚未存在证据表明爆发后的病毒可以感染哺乳动物和鸟类以外的物种。
2020年1月24日北京大学工学院生物医学工程系副主任朱怀球研究团队在生物学预印本bioRxiv网站上发表Host and infectivity prediction of Wuhan 2019 novel coronavirus using deep learning algorithm文章揭示采用深度学习算法对武汉新型冠状病毒的宿主和传染性进行预测,认为从传染性方式来看蝙蝠和水貂是武汉新型冠状病毒的潜在宿主。
2020年1月24日意大利和巴西研究团队同样在生物学预印本bioRxiv网站上发表The 2019-new coronavirus epidemic: evidence for virus evolution的文章对武汉新型冠状病毒的早期进化和分子流行病学分析他们认为认为武汉新型冠状病毒是与SARS病毒不同的冠状病毒,可能是从蝙蝠或其他宿主传播的,在这些宿主上进行的突变赋予了它感染人类的能力。
尽管宿主“嫌疑犯”很多,目前研究证据更加支持蝙蝠最可能是此次新型冠状病毒的自然宿主。
3.武汉新型肺炎的临床症状和流行病学特点
2020年1月24日当天更是在柳叶刀、新英格兰医学杂志等临床医学顶级杂志上八连发,密集报道武汉新型冠状病毒,这是很罕见的。这些文章揭示了武汉新型肺炎在同一家庭中的人际传播特点,也详细报道了早期41名武汉新型肺炎患者的临床特征和流行病学特点。
也有一些文章关注于治疗新型肺炎的药物筛选,开发新的抗体。
蒋华良院士和饶子和院士领衔的抗2019-nCoV病毒感染联合应急攻关团队利用虚拟筛选和酶学测试相结合的方法,发现候选药物包括蛋白酶抑制剂茚地那韦(Indinavir)、沙奎那韦(Saquinavir)、洛匹那韦(Lopinavir)卡非佐米(Carfilzomib)、利托那韦(ritonavir)等12种抗HIV药物,2种抗呼吸道合胞病毒药物,1种抗人巨噬病毒药物,1种抗精神分裂症药物,1种免疫抑制剂以及2种其他类药物可能是治疗新型肺炎的候选药物。
2020年1月27日science杂志发表文章Can an anti-HIV combination or other existing drugs outwit the new coronavirus? 讨论抗艾滋病药物和其他药物是否存在抗武汉新型冠状病毒的作用,他们认为抗艾滋病药物和Remdesivir可能是目前最具有潜力的治疗武汉新型冠状病毒的药物。
复旦大学上海医学院基础医学院医学分子病毒学重点实验室应天雷教授团队2020年1月28日在生物学预印bioRxiv网站上发表文章Potent binding of 2019 novel coronavirus spike protein by a SARS coronavirus-specific human monoclonal antibody首次发现SARS-CoV(SARS-冠状病毒)特异性人单克隆抗体CR3022可与2019-nCoV(2019新型冠状病毒) 受体结合域有效结合。此外,CR3022的抗原决定簇不与2019-nCoV RBD中的ACE2结合位点重叠。
我们为这些奋斗在一线的科研者感到骄傲,这些文章确实对我们了解新型冠状病毒提供了很有利的信息,为防控疫情提供了科学决策。
我们为中国速度感到自豪!
但是这个时候,一篇学术论文改变了这种局势。
2020年1月29日中国疾控中心主任领衔的团队在新英格兰医学杂志上发表了Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus-Infected Pneumonia.文章通过对425名确诊的患者分析发现2020年1月1日前发病的患者中有55%与武汉华南海鲜市场有关,而之后的病例仅8.6%与海鲜市场有关。他们认为2019年12月中旬武汉新冠病毒已有人传人证据。
正是这篇文章让大家认为在这些专家不顾疫情,只关注论文的发表,一度引起高度关注。
随后中国疾控中心发表声明称这是回顾性研究,12月中旬还不清楚是什么病,病原不清,2019年12月中旬武汉新冠病毒已有人传人传播这个结论是通过对这些病例的流行学调查后才发现。
这个时候这篇论文得出这样的结论确实引起广泛关注,大家也在质疑为什么12月中旬已经存在人传人的证据,一直未公开。
其实冷静认真想想,我们对新型冠状病毒的认识确实是一步一步的加深的,这也是为什么我会整理大部分的发表的文章,梳理一下认识的轨迹。可能后面还会存在一些让我们震惊的关于武汉新型冠状病毒的信息,我们必须保持客观冷静的态度面对,因为这个病毒真的很新。
参考文献:
1.Xiaolong Tian, Cheng Li, Ailing Huang, Shuai Xia,Potent binding of 2019 novel coronavirus spike protein by a SARS coronavirus-specific human monoclonal antibody
2.China coronavirus: how many papers have been published?
3.Jon Cohen,Can an anti-HIV combination or other existing drugs outwit the new coronavirus?
4.simon A. Babayan1,2, Richard J. Orton3, Daniel G. Streicker. Predicting reservoir hosts and arthropod vectors from evolutionary signatures in RNA virus genomes. Science, 02 Nov 2018, 362(6414):577-580,
5.Qian Guo, Mo Li, Chunhui Wang, Host and infectivity prediction of Wuhan 2019 novel coronavirus using deep learning algorithm;
6.Domenico Benvenuto, Marta Giovannetti, Alessandra Ciccozzi; The 2019-new coronavirus epidemic: evidence for virus evolution
7. Evolution of the novel coronavirus from the ongoing Wuhan outbreak and modeling of its spike protein for risk of human transmission,SCIENCE CHINA Life Sciences,2020
免责声明:封面图片和文章图片均来源于网络
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