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箱线图万能模板,输入数据,立刻自动出图、出统计学结果P值,都不要自己分析,简直太方便!

小小同学 科研部 2022-11-30
免费资源:

1、3000张 PPT 科研绘图素材(点击下载)

2、2021历年国自然已中标书全文(点击下载)

3、35GB国自然申报培训课程(点击下载)

4、Graphpad科研作图视频(点击下载)

5、全国生物医学科研相亲交友群(点击进入)

6、GraphPad作图万能模板(点击下载)

7、AI 科研绘图矢量素材(点击下载)

8、教你Origin做300张科研图(点击查看)

9、Excel做各种统计分析万能模板(点击下载)

10、15套生信自学视频(含代码,点击下载)

11、58套SCI实验操作视频,PCR、测序、敲低、过表达、crispr、IP、流式等都在这里了!


01箱线图万能模板,输入数据,自动出图、出统计学结果!


给大家看这个图:



从左边的表格看,第一列是样本号,第二列是该样本属于疾病的第几期。第三列是WNT4基因的表达量。那么,你只要有这个数据,R语言的万能代码就能给你做出右边这样美美的图,根本不用自己再去计算P值、设置颜色等等,非常方便。


只要你把这个输入文件(input.txt)替换成你自己的数据,如下:



然后如下四步,运行代码即可(这里强调一点,万能代码是包括统计学的,所以大家再也不用什么打开SPSS软件,打开graphapda软件进行统计分析了,绝对非常方便):



然后就可以看到图片了(还有组间比较的P值):



好了,我将这一份资源放到百度云了,大家可以试试,简直太方便了,特别是统计学处理,再也不要什么软件一个一个点了,也不用考虑配色了。



“箱线图万能模板及万能代码(原价599元)”

如下免费获取:

第一步:长按识别二维码

第二步:回复关键词:箱线图


0215套肿瘤/非肿瘤数据挖掘实操课程免费送!


之前听老板说过好多次,我有位大师兄很厉害,发了很多SCI。后来有机会和他一起吃饭,才得知他发的 SCI 的主要是生信分析、数据挖掘。医院认可的,不用做实验就可以完成。


于是我也闭门造车的自学起来,起初学习起来并不顺利,走了不少的弯路。因为心疼钱,没有报培训班,在网上找学习资源,都是零零散散的。


慢慢的我写了 2 篇纯生信,向中文期刊投,通通被拒


后面我去请教大神师兄,他说我的学习不够系统,要我不要去百度,要报学习班,系统性的学习,跟着老师实操。于是便分享了几份纯生信实操的视频课程给我,我从头系统的学习了一遍,花了一周的时间。


终于在前几天,收到了第一篇文章接收的消息,虽然只是2.7 分的入门级杂志,但是心中还是满满的成就感。


我相信很多人也在自学生信,都是公众号这里看一点,那里看一点,知识非常零散。所以,大家一定要系统化的学习,我把我系统学习的:


【15套肿瘤/非肿瘤数据挖掘实操课程】


免费发送给大家

这里面都是按照范文套路进行实操降解


比如5分的套路、3分的套路

一步一步零基础入门到精通!


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反正也是免费发送给大家的,有了这些系统化学习的视频教程,任何一套视频都能发一篇 3、5分的SCI论文。这15套课程的目录如下(建议大家按照我的自学顺序,我觉得有用):


资源截图如下:

GEO数据挖掘ceRNA机制(19节课,适用于肿瘤非肿瘤)

01、数据库简介

02、下载数据

03 ID转换

04 添加基因属性

05 差异表达

06 热图绘制

07 GPL转fasta

08 重注释比对结果

09 比对结果ID转换

10 基因属性

11 基因表达和火山图

12 绘制热图

13 lncRNA结合的miRNA

14 miRNA靶基因的预测mp4

15Cytoscape输入文件准备

16CeRNA网络构建

17基因名称转换为基因ID

18GO分析

19KEGG分析

20 课程数据文件及万能代码


二、

TCGA数据lncRNA共表达网络构建(8节课,肿瘤)

01.共表达方法预测lncRNA靶基因简介_ok

02.基因矩阵文件加上基因属性_ok

03.LncRNA共表达分析_ok

04.基因名字转换成基因id_ok

05.靶基因的GO富集分析_ok

06.靶基因的KEGG富集分析_ok

07.富集结果中的id转换成symbol_ok

08 课程数据文件及万能代码


TCGA数据挖掘视频教程一(15节课,挖掘差异基因)

01、数据库简介

02、网页下载数据

03、命令行下载数据

04、生成矩阵

05、id转换成基因名

06、差异表达介绍

07、edgeR差异表达

08、DESeq差异表达

09、miRNA数据下载与整理

10、miRNA差异表达

11、共表达数据合并

12、WGCNA

13、生存分析介绍

14、生存分析数据准备

15、R做生存分析

16、课程数据及万能代码


TCGA数据挖掘视频教程二(挖掘差异miRNA)

01、课程简介

02、Rstudio重点配置与报错排除

03、最新TCGA-RNA表达数据下载与整理

04、RNA差异表达分析

05、ROC曲线

06、TCGA临床数据下载与整理

07、基因表达与临床因素相关性

08、临床分组表达量分析

09、生存分析

10、COX分析

11、列线图模型

12、基因表达拷贝数甲基化

13、成熟体miRNA表达数据下载与整理

14、miRNA差异表达分析

15、靶基因分析

16、基因与miRNA表达相关性分析

17、miRNA生存分析

18、GSEA分析

19、cBioPortal分析复现

20、课程数据及万能代码


TCGA数据挖掘视频教程三(挖掘转录因子网络)

01、简介

02、TCGA数据下载

03、TCGA命令行下载

04、TCGA数据整理

05、TCGA的id转换

06、mRNA提取

07、mRNA差异表达

08、IncRNA提取

09、IncRNA差异表达

10、转录因子富集分析

11、转录因子数据整理

12、cytoscape下载和安装

13、cytoscape构建转录因子调控网络

14、课程数据及万能代码


TCGA数据挖掘视频教程四(挖掘ceRNA网络)

01、TCGA数据库简介

02、软件安装

03、数据下载提取

04、差异分析

05、差异lncRNA与差异miRNA比对

06、DEmiRNA靶基因预测

07、网络构建数据准备

08、构建ceRNA网络

09、生存分析

10、课程数据及万能代码


批量挖掘TCGA miRNA

01、课程介绍

02、批量获取TCGA miRNA

03、辞选差异的miRNA

04、单因素Cox回归数据准备

05、单因素Cox回归

06、lasso回归数据格式准备

07、lasso回归

08、多因数Cox数据准备

09、多因素Cox回归分析

10、绘制列线图

11、绘制校准图

12、绘制ROC曲线

13、课程数据及万能代码


TCGA数据甲基化差异分析生存分析

01、TCGA甲基化简介

02、甲基化数据下载

03、甲基化数据提取

04、差异甲基化

05、热图

06、基因甲基化与表达相关性

07、位点甲基化与表达相关性

08、生存分析

09、甲基化和表达联合生存分析

10、课程数据及万能代码


TCGA甲基化驱动基因高级课程

01、甲基化驱动基因简介

02、甲基化驱动基因数据准备

03、甲基化驱动基因MethtylMix数据分析

04、甲基化驱动基因MethtylMix绘制图形

05、甲基化驱动基因热图绘制

06、甲基化驱动基因ConsensusPathDB分析

07、课程数据及万能代码


TCGA数据库SNP突变数据分析

01、TCGA数据库SNP突变分析简介

02、突变数据下载

03、突变数据整理和统计

04、瀑布图输入文件准备

05、瀑布图

06、带临床性状瀑布图数据准备

07、绘制带临床数据的瀑布国

08、突变和表达关系数据准备

09、绘制突变和表达关系图

10、提取生存时间

11、生存分析文件准备

12、生存分析

13、SNP位点数据整理

14、位点矩阵和表达矩阵合并

15、位点突变和基因表达关系

16、位点生存分析文件准备

17、位点生存曲线

18、课程数据及万能代码


11

TCGA数据库CNV拷贝数变异分析

01、CNV简介

02、数据下载

03、基因注释

04、数据整理合并

05、卡方检验输入文件准备

06、正常和癌症的CNV差异

07、圆圈输入文件准备

08、CNV绘制

09、提取差异基因的CNV矩阵

10、差异CNV基因和表达数据合并

11、CNV和表达水平的相关性检验

12、CNV和表达水平的可视化

13、基因名字转换成ID

14、GO富集分析

15、KEGG通路富集分析

16、课程数据及万能代码


12

TCGAimmune免疫细胞浸润

01、肿瘤免疫侵润简介

02、TCGA数据下载

03、数据整理

04、提取mRNA

05、数据矫正

06、CIBERSORT运行.

07、CIBERSORT结果整理

08、柱状图绘制

09、热图绘制

10、相关性热图绘制

11、小提琴图绘制

12、临床数据下载

13、临床数据整理

14、免疫细胞矩阵和生存时间合并

15、免疫细胞批量化生存分析

16、免疫细胞矩阵和临床性状合并

17、批量临床相关性分析

18、批量临床相关性

19、课程数据及万能代码


13

生信分析+免疫,妥妥上5分!

01、下载TCGA数据

02、计算样本免疫微环境评分

03、免疫微环境评分与各个临床特征的关系

04、免疫微环境评分高低与预后的关系.

05、免疫微环境评分高低样本的基因表达差异

06、这些差异基因与预后的关系,筛选预后显著相关

07、外部数据集验证这些基因.

08、课程数据及万能代码


以上是13套视频的内容,资源一共是15套,任何一套都有实操视频和课程资料:


(任何一套都是完整的)



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