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多个实例填补研究空白,单细胞组学大数据研究这样做!

华大时空 华大时空 2023-07-02

日前,由生物谷与上海市免疫学研究所联合主办的“2021(第四届)单细胞多组学研究与临床应用峰会”,在上海顺利举行。深圳华大生命科学研究院刘传宇博士受邀出席大会,并作《细胞组学新技术及规模化应用》专题报告,分享单细胞新技术开发进展和规模化应用案例,并阐述基于国产自主测序系统的时空组学技术相关进展。


报告干货



单细胞测序技术是生命科学史上的重大里程碑,高通量、低成本的细胞组学测序工具自主可控是开展细胞组学大数据研究的重要前提。过去10年来,单细胞测序技术不断升级,灵敏度、通量都在不断上升,这些突破正带来发育、疾病、脑科学、生命演化等研究领域的全面变革。


本次报告,刘传宇博士系统介绍了基于液滴微流控的自主单细胞建库系统DNBelab C4,与传统的Drop-seq平台相比,C4-scRNA-seq v2技术可将细胞回收率提高至30%-60%,PBMC标准数据分群情况与市场其他多项平台一致性较高。


同时,报告还介绍了基于C4平台的单细胞染色质可及性测序技术scATAC-seq和单细胞多组学测序技术scCAT-seq-HT的研发进展。基于自主的单细胞测序技术,报告介绍了多个研究方向的规模化应用,包括细胞数超过100万的食蟹猴单细胞转录组图谱的绘制,填补了非人灵长类物种单细胞图谱的研究空白;以及新冠与甲流患者外周血免疫细胞应答病毒感染过程的差异研究。报告还介绍了新冠疫苗注射后的机体免疫机制应答过程,通过对多人多时间点的样本采集,构建了超过60万单细胞的数据集系统研究了疫苗应答过程



此外,刘传宇博士还对华大时空组学测序技术Stereo-seq进行了技术介绍和文章摘要解读。Stereo-seq是全球领先、能同时实现“纳米级分辨率”和“厘米级全景视场”的原位捕获空间全转录组测序技术,可以全面应用于生老病死、意识起源、万物生长、生命起源等重大问题研究,推动生命科学和医学领域的发展,带来生命科学领域第三次科技革命。



特别关注

11月25日下午15:00-16:30,深圳华大生命科学研究院顾颖副院长和中科院遗传发育所吴青峰研究员,针对模式动物脑部研究的成果及时空、单细胞技术在脑科学研究中的应用进行专题介绍。


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