基于DIA/diaPASEF/PulseDIA 的深度微量高通量蛋白质组学分析服务

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技术简介

△PulseDIA技术（专利号：ZL 2019 1 0231539.0）

diaPASEF技术在DIA（Data Independent Acquisition，数据非依赖性采集)技术的基础上结合了PASEF（Parallel Accumulation Serial Fragmentation）技术，增加了多肽在质谱仪中的分离维度。PASEF的核心是离子淌度技术TIMS (Trapped Ion Mobility Spectrometry)，TimsTOF Pro系统的双TIMS分析器设计，使前一批离子在第二个TIMS分析器中进行淌度分离和释放的同时，后一批离子在第一个TIMS分析器中同步进行累计，带来几乎100%的Duty Cycle。

PulseDIA技术是西湖欧米的专利技术，在传统的DIA技术的基础上，将一个窗口根据质荷比分割成更小范围的多个窗口，并将这些窗口以脉冲的方式均匀分配至不同的质谱方法进行采集。同一个样本分成多次短梯度进样，每次进样方法均有不同的质谱窗口，最后合并分析几次采集的质谱数据，达到更高的多肽和蛋白质鉴定量。

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欧米特色

更高效：单位时间内可鉴定更多的多肽和蛋白质 

高通量：每台质谱每天可以分析10-20个样品

高准确性：定量评估实验，AUC达到0.989-0.994

高重现性，高稳定性：重复采集数据定性定量结果的高相关性

高灵敏度，低样本消耗量：DIA/PulseDIA单针只需250ng多肽，diaPASEF单针只需100ng多肽

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相关成果

1. Guo, T., et al. Rapid mass spectrometric conversion of tissue biopsy samples into permanent quantitative digital proteome maps. Nat Med 21, 407–413 (2015).

2. Cai X, et al. PulseDIA: Data-Independent Acquisition Mass Spectrometry Using Multi-Injection Pulsed Gas-Phase Fractionation. J Proteome Res. 2021 Jan 1;20(1):279-288. 

3. Guo T, et al. Quantitative Proteome Landscape of the NCI-60 Cancer Cell Lines. iScience. 2019 Nov 22;21:664-680.

4.Zhu Y, et al. High-throughput proteomic analysis of FFPE tissue samples facilitates tumor stratification. Mol Oncol. 2019 Nov;13(11):2305-2328. 

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