小白最想拥有的神器，点点鼠标一分钟就能做炫酷的热图！

Heatmap （热图）最大优点就是信息量大却一目了然。你会惊奇地发现，本来看似杂乱无章高高低低变化的数据做成热图后竟然一下子就简单了。文章里如果放个热图，顿时逼格确实提升了不少！

目前绘制热图的工具很多，像MATLAB、MeV (Multiple ExperimentViewer)、GraphPad Prism、R 语言等等。但是对于初入科研大门的小伙伴，我们一般都会推荐简单易上手的工具，强烈安利！这里有两款超级简单的热图绘制软件。

一、Heatmap Illustrator

网址：http://hemi.biocuckoo.org/down.php

安装包可以在官网中直接下载。

①下载完成后，打开软件。

②点击 File-Load或LOAD将原始数据 txt 或 Excel 版本导入。

③选择数据文件。

④有多个Sheet的表格一次只能导入一个sheet，选择要导入的sheet。

⑤选择Auto select以及y-axis title、x-axis title（选择y-axis title、x-axis title坐标轴会有文字显示），再选择finish。

⑥如果对于热图的颜色不满意，可以点击set更换颜色。

⑦设置完成后，点击“REFRESH”更新热图。

⑧对热图展示形式不满意，还可以点击DEMO，选择喜欢的色系和展现形式。

注意：选择合适的热图展示形式后，需要在导入一次数据，目前Heatmap Illustrator有以下5种展现形式。

⑨导出热图。

选择choose保存格式，可以保存png、jpg和tiff三种格式。

二、Matrix2png

网址：http://www.chibi.ubc.ca/matrix2png/bin/matrix2png.cgi

Matrix2png是一个简单却实力强大的矩阵数据可视化工具，用于将txt格式的文件转化为png格式的图片，其特点包括：

1）仅支持PNG输出格式，需要的输入文件只能是制表符分隔的txt文件。

2）支持本地绘图、在线绘图及linux命令行绘图多种方式。

3）可以人为界定绘图的数值范围。

4）可以方便的从调色板和流行色图（color maps）中选择设置的颜色。

5）自动生成scale bars、row labels和column labels。

6）支持有缺失值以及离散型数据的矩阵。

①点击“选择文件”导入数据文件。

②此工具需要先调整参数，在进行绘制。

对图片进行基本设置：包括图片大小、矩阵是否标准化、显示的数值范围、数值切割范围以及是否用圆形代替方形。

设置颜色：修改最普遍的部分，包括背景色、缺失值颜色以及热图主体颜色（有三种方式进行选择）。

选择添加小工具，包括是否画颜色标尺、行名称及位置、列名称及位置、每个点之间的分隔。

设定输入矩阵中用作画图的行列范围。

③设置完成后，点击“submit”提交画图任务。

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