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代码分享|将neauscan自带软件scan导出的.avg格式文件导入matlab画图
大家好,我是茗创科技的周翊,近日在给一位朋友绘制论文用图时,客户提供的是neauscan的avg文件,我们知道使用neauscan提供的scan软件分析的脑电数据叠加平均以后会得到一个avg格式的文件,如果想要导出到matlab里面画图貌似并没有现成的方法,差点就把我难倒了
虽然eeglab界面并没有提供一个现成的选择框载入.avg文件,但是可以使用函数eeg_load_scan4_avg获得,这是本脚本的核心代码如下;
函数:eeg_load_scan4_avg
用法:[f,fid] = eeg_load_scan4_avg(filename)
变量介绍:
f:这是一个结构体,里面包含了avg数据的所有内容,类似于读cnt的那个函数的输出变量,这个结构体里面包含
f.header - general header parameters
f.electloc - channel specific parameters
f.data.header - small channel data header
f.data.samples - channel data (not uV)
f.variance - channel variance
f.tag - scan4.1 file tags
fid: 文件的一个指针,这里基本没啥用
filename:文件名,和loadcnt当中的file一样。
完整代码如下,分享给各位
%% 首先清空工作区的变量,以免对我们接下来的操作造成影响
clear all;clc;
load('EEG.mat');
%% 载入数据 ERP的绘制
% 在这里为了方便查看,我导出了PDF图,又为了方便后期编辑与修图,我同时导出了eps格式的图片,这样就能够导入AI进行精修作图了
fig_path = 'D:\Docu\Project\draw_pic\data\ERP';cd(fig_path);
% 读取所有的avg格式文件;
fig_files = dir([fig_path,filesep,'*.avg']);
% 对每个文件进行读取
for fig_No = 1:length(fig_files)
exp_con_name = fig_files(fig_No).name(1:end-4)
% 每个avg文件生成一个文件夹
mkdir([fig_path,filesep,exp_con_name]);cd([fig_path,filesep,exp_con_name]);
% 读取avg文件
[f,fid] = eeg_load_scan4_avg(['D:\Docu\Project\draw_pic\data',filesep,fig_files(fig_No).name]);
% 将avg文件内的数据转为数组形式
for i = 1:65
EEG_avg(i,:)=(f.data(i).samples)';
end
% 每个通道电极点
for chan_point = 1:65
% chan_point = 28;
% 因为不可知的原因,数据需要除以20才能得到真实的幅值
mean_data = squeeze(EEG_avg(chan_point,:))./20;
figure;
plot(EEG.times, mean_data,'linewidth', 1.5); %% plot waveforms for different conditions
set(gca,'YDir','reverse','XAxisLocation','origin','YAxisLocation','origin','LineWidth',2.0,'box','off');
axis([-200 1000 -4 12]); %% define the region to display
title(['Group level data at',EEG.chanlocs(chan_point).labels],'fontsize',16);
xlabel('Latency (ms)','fontsize',16);
ylabel('Amplitude (uV)','fontsize',16);
print(gcf,[exp_con_name,'_',EEG.chanlocs(chan_point).labels],'-dpdf','-r600');
print 1.eps -depsc2 -r600;
% 由于不知道如何设定合适的文件名,所以保存以后再使用下面的函数进行修改文件名
movefile('1.eps',[exp_con_name,'_',EEG.chanlocs(chan_point).labels,'.eps']);
close all;
end
end
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