近红外干货 | NIRS_SPM单被试激活分析过程

是新朋友吗？记得先点蓝字关注我哦～

请点击上面“茗创科技”四个字，选择关注我们，茗创科技专注于脑科学数据处理，涵盖（EEG/ERP, fMRI,结构像,DTI,ASL, ,FNIRS）等，欢迎留言讨论及转发推荐，也欢迎了解茗创科技的课程，数据处理服务及脑科学工作站销售业务，可添加我们的工程师（微信号MCKJ-zhouyi或17373158786）咨询。

茗创科技往期给大家提供了脑电数据处理的方法及手册

也有核磁数据处理的干货

今天给大家整理了基于NIRS_SPM近红外一阶分析中单被试的激活分析过程~对于近红外课程感兴趣的朋友可以点击下面这条链接报名

🤞🤞🤞🤞🤞🤞🤞🤞🤞🤞

NIRS_SPM单被试激活分析的过程主要包括下面这几个步骤

1. 格式转换

2. 通道定位

3. 一阶分析：声明模型信息

4. 估计模型参数

5. 查看结果

在讲解具体操作前，我们先确认一下我们的操作环境。

Matlab版本：2013b（不要用太新的，不确定会不会有bug）

SPM版本：SPM8

NIRS_SPM

一、格式转换

不同的近红外设备采集的信号存储格式迥异，在用MATLAB分析前需要对数据格式进行标准化。也就是说要把数据格式转换成MATLAB能够识别的.mat文件，转换完的文件必须包含频率、通道、脱氧血红蛋白、氧合血红蛋白、总血红蛋白这五个数据。

下面讲解下具体的数据转换的流程：

（1）慧创数据格式转换：

NIRS_SPM并没有提供慧创近红外数据格式转换的功能，慧创的HC_Calculate示例脚本提供了数据格式转换参考，大家可以找我们的工程师索要哦~（2）使用NIRS_SPM对数据进行格式转换
Matlab命令框输入NIRS_SPM，弹出界面，找到Convert

示例：

岛津数据转换（shimadzu）：原始数据为txt文件

依次点击如下

显示加载进度

直到弹出显示采样频率的界面，再点击save，选择好文件的保存路径，这时候就完成了数据转换。

日立数据转换（HITACHI）：日立的数据主要由csv文件组成

点击load后，依次加载氧合血红蛋白浓度，脱氧血红蛋白浓度，总血氧蛋白浓度，完成后出现如下结果，再点击保存。

NIRS数据转换

先导入通道信息再导入数据信息，最后保存save

2、通道定位

再点击Project MNI Coordinate toRendered Brain才会弹出通道定位图，再点击OK。弹出：直到下图出现表示通道定位完成。
保存通道定位好的文件。

3、一阶分析：声明模型信息

我们只做个体水平的分析，选择Specify st Level。这里只分析氧合血红蛋白浓度所以就只选Oxy-Hb就可以，如果你想分析脱氧的可以点选Deoxy-Hb。下面弹出的界面参数设置一般点选下列选项就可以了。下面需要根据自己的实验范式填写参数。
  最后会弹出一阶分析的结果。

在结果路径会生成：

4、估计模型参数

即

结果文件：

5、查看结果

4设置对比矩阵
得到激活图

篇幅有限，

想要进一步学习近红外相关知识的朋友，

欢迎报名我们茗创科技的近红外课程

🤞🤞🤞🤞🤞🤞🤞🤞🤞🤞🤞🤞🤞🤞🤞🤞🤞🤞🤞🤞

现在报名有巨额优惠哦~

茗创科技

有态度 有深度 有温度 专注于脑科学扫描二维码 关注我们

球分享

球点赞

球在看