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WeBrain:基于web的EEG大数据分析计算脑信息平台

茗创科技 2021-11-24
有态度 有深度 有温度你的科研小伙伴

随着云神经科学的发展,大规模的EEG应用也需要快速处理不断增加的EEG数据。为了应对云平台寻求解决EEG大数据分析的云计算这一挑战,WeBrain云平台被设计成一个基于web的脑信息平台和计算生态系统。利用云端高性能计算(HPC)实现大规模EEG数据存储、探索和分析。

 

网址:https://webrain.uestc.edu.cn/


WeBrain平台首页


My Monitor版块。不同颜色的方框中显示了所有计算任务的基本信息(任务名称、使用的工具、选择的数据和创建者)(绿色:成功;红色:失败;蓝色:终止;灰色:其他)


My Project版块。列出了用户操作中的所有计算任务。用户可以通过单击“+new task”,设置任务名称和描述,选择工具,设置参数,选择数据文件,然后单击“执行”按钮来运行任务,从而轻松创建新的计算任务。


My File版块。列出了所有用户上传的数据文件(蓝色)或在WeBrain平台计算的结果文件(绿色)。用户可以通过web界面过滤、管理、删除和下载数据文件。

 

My Statistic版块。显示了当前用户在一段时间内的使用记录。包括计算任务数、上传文件数、文件大小等基本信息。


在WeBrain平台上对某课题的样本EEG原始数据进行预处理。上图为原始EEG数据的波形图,下图为REST参考下干净数据的EEG波形图。采用“WB_EEG_prepro”EEG预处理工具,在WeBrain平台上对原始数据进行预处理。

 

计算相对功率指数的WeBrain示例结果。前3行分别显示了WeBrain和local personal computers 1和2(行1-3)计算的不同频率段的参与者平均相对功率指数。最后一行显示了WeBrain和本地个人计算机运行的相对功率指数的ICC值。


WeBrain将不同领域的研究人员与EEG和多模态工具连接起来,后者已成为该领域的标准,并具备处理大规模EEG数据集所需的云处理能力。这个平台为新手用户(即使没有计算机编程技能)提供了一个易于使用的系统,并为IT管理员和工具开发人员提供了令人满意的可维护性、可持续性和灵活性。在https://webrain.uestc.edu.cn/上还可以找到一系列资源,包括文档、手册、与WeBrain相关的示例数据集,以及打开EEG数据集和工具的链接。用户或管理员不需要安装任何软件或系统,只需要一个现代的网络浏览器,这就减少了使用或管理WeBrain所需的技术专业知识。

 

参考来源:

WeBrain: a Web-based Brainformatics Platform of Computational Ecosystem for EEG Big Data Analysis. From: Li Dong, Jianfu Li, Qiunan Zou, Yufan Zhang, Lingling Zhao, Xin Wen, Jinnan Gong, Fali Li, Tiejun Liu, Alan C. Evans, Pedro A. Valdes-Sosa, Dezhong Yao.

https://webrain.uestc.edu.cn/
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