静息态fMRI功能连接入门
静息态是一种大脑不执行具体认知任务、保持安静、放松、清醒的状态,是大脑所处的各种复杂状态中最基础和最本质的状态,是普遍采用的一种基线状态。静息态有睁眼和闭眼两种状态,根据研究目的和手段的不同,一些研究者以睁眼状态为基线,而另一些研究者则以闭眼状态为基线。静息态功能连接反映了大脑内在的、固有的活动模式,是组成所有认知、感知和行为活动的核心。而且静息态脑功能连接分析是近年来脑研究的一个热点问题,对于某些脑疾病的诊断及成因理解具有重要意义。
内容简介
《静息态fMRI功能连接入门》是一本关于静息态功能磁共振成像(fMRI)功能连接分析的入门工具书。《静息态fMRI功能连接入门》分为6章,分别对fMRI功能连接、静息态fMRI的数据采集、静息态fMRI的数据预处理、基于体素的连接分析、基于节点的连接分析、fMRI功能连接分析的结果阐述等内容进行了详细的讲解。《静息态fMRI功能连接入门》可供静息态fMRI和功能连接领域的初学者、从事功能磁共振研究的研究生、医学院校高年级本科生及心理学、神经科学、放射学、神经病学、统计学、生物信息学和生物影像学等领域的研究人员学习参考。
作者简介
作者: (英)贾宁· 比杰斯特博什;(英)斯蒂芬· 史密斯;(英)克里斯蒂安· 贝克曼 著
马国林;尹建忠;杨旗 译
马国林, 医学博士,中日友好医院放射科主任医师、博士后合作导师,北京大学医学部、北京协和医学院及首都医科大学博导、教授。曾在美国加州大学圣地亚哥分校做访问学者并从事博士后研究工作。先后挂任陕西省安康市卫生计生局副局长、陕西省卫生计生委副主任。兼职中国生物医学工程学会医学影像工程与技术分会常务副主任委员、中国医学装备协会CT工程技术/CT应用专委会副主任委员/常委、中国医学救援协会影像分会常委、中华医学会放射医学与防护学分会委员、中国生物医学工程学会医学人工智能分会委员、中华医学会放射学分会磁共振专委会委员。国家科技部重点研发计划“数字诊疗装备研发”重点专项专家组成员。国家自然科学基金委重点和面上项目函评/会评专家。国家和北京市科技奖评审专家。《国际放射医学杂志》名誉主编,Artificial Intelligence in Medical Imaging副主编,《中华医学杂志》、《中华放射医学与防护杂志》、《中国CT和MRI杂志》、Frontiers in Oncology、Brain Imaging and Behavior、International Journal of Oncology等多种杂志编委及审稿人。主持国家课题6项(基金委3项、科技部3项),获省部级一等奖1项、三等奖2项,发表论文100余篇,SCI论文50余篇。主编医学专著3部,主译2部。擅长头颈和神经精神疾病影像诊断,主要研究方向为头颈、神经及精神疾病功能、网络和代谢研究;医学影像大数据人工智能定量研究;新型材料生物医学成像研究。
书籍目录
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第1章· 简介 1.1 从神经活动到功能连接 文本框1.1:神经活动与局部场电位 1.2 静息态脑网络是什么? 1.3 静息态脑功能研究能得到什么? 1.4 静息态fMRI信号特性 1.5 绘制人脑连接组图 总结 延伸阅读 第2章· 数据采集 2.1 重复时间、体素大小和扫描范围 2.2 多频带EPI序列 2.3 多回波EPI序列 2.4 变形、匀场和场图 2.5 扫描时间 2.6 睁眼与闭眼 2.7 运动和生理干扰 总结 延伸阅读 第3章· 数据预处理 3.1 结构噪声的来源 3.2 常规预处理步骤 3.3 低通滤波 3.4 滋扰变量回归 3.5 全脑信号回归 3.6 生理噪声回归 3.7 图像删减 3.8 独立成分分析 示例框:个体受试者ICA 通用统计框:多元线性回归分析(与一般线性模型GLM) 总结 延伸阅读 第4章· 基于体素的连接分析
4.1 基于种子点的相关性分析
示例框:基于种子点的相关性分析
4.2 独立成分分析
文本框4.1:ICA模型
文本框4.2:ICA如何进行“分解”工作?
示例框:不同数据的组水平ICA网络
4.3 采用双重回归获得受试者的ICA
示例框:双重回归组分析结果的显示
4.4 低频振幅
4.5 局部一致性
4.6 基于体素的组水平分析方法
通用统计框:多重比较校正
总结
延伸阅读
第5章· 基于节点的连接分析
5.1 节点的概念
5.2 定义节点
示例框:节点分割的示例
5.3 提取时间序列
5.4 定义脑网络的边线
5.5 网络模型分析
示例框:计算受试者和组水平网络矩阵
5.6 图论分析
5.7 动态因果模型
5.8 动态和非稳定分析方法
5.9 基于体素与基于节点分析方法的选择
总结
延伸阅读 第6章· 结果阐述
6.1 心理学影响
6.2 BOLD的生理学影响
6.3 方法学选择的影响
6.4 互补型连接研究
6.5 结论
总结
延伸阅读
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本书内容不仅包括功能磁共振成像规范化数据采集步骤和影响因素、功能连接分析的原理,还全面详尽地介绍了功能连接后处理分析的相关方法与结果阐述中的注意事项。本书也提供了数据处理示例,以引导读者学习,使读者基本掌握磁共振功能连接的处理与分析方法。目前国内关于磁共振功能数据后处理分析的书籍还较少,本书作为神经影像入门丛干之一,可以帮助到不同层次的读者,特别是对初学者。——高家红 北京大学
本书是牛津出版社《神经影像入门系列》中的一本,详细介绍了rs-fMRI功能连接分析的各个方面,涉及静息态脑网络的基本概念,rs-fMRI的信号特征,数据采集的参数选择和注意事项,数据预处理流程,两种常用的功能连接分析方法:基于体素和基于节点的分析方法,以及如何显示和阐述所得到的结果,这些都是rs-fMRI研究的关键环节。相信这本入门书能够为从事静息态脑功能研究的人员,特别是初入神经精神影像领域的研究生,熟悉和掌握rs-fMRI的数据处理分析方法和策略,辨别和避免常见的问题,提供很好的帮助。——于春水 天津医科大学
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