zotero+obsidian+dataview助力文献阅读

大家好，我是BCS！

很早之前，分享了一篇zotero与obsidian联用的一个教程，但现在随着需求的增加，不得不更新了！

1 工作流简介

关于我的文献阅读工作流，之前或多或少都提到了一些

这次根据需要，又做了一些更新，部分流程参考了英文论坛的这个帖子[1]~

• 在Google/CNKI/wof等学术网站检索文献

• 利用zotero connector插件保存文献到zotero library

• 文献阅读

• 建议在阅读之前，可先利用mdnotes插件生成文献模板笔记到Obsidian

• 利用zotero内置的PDF阅读器也可使用第三方阅读器（推荐PDF exchange editor）

• 边阅读边在obsidian中积累笔记和写作素材，通过设置好的快捷方式一键添加文献阅读随想和专业知识元笔记

• 新建一个文献阅读笔记汇总页，利用dataview将文献笔记和文献阅读随想汇总展示（可根据需要补充/修改笔记内容（这里主要利用悬浮编辑）& 回顾笔记 & 知识串联.......）

下图就是一个Reading Notes的汇总预览图，就类似于Notion中的数据库

一键随想（文献阅读随想）和补充新知（专业知识笔记）的演示，请看此推文👉

大致的流程就是这么多~

2 配置教程

对于文献检索与导入zotero的过程我就不再介绍了，研究生生存基本技能~

2.1 Mdnoteos与zotero联用

这一部分之前也有介绍，貌似之前的前程略微繁琐，这次整个更简单的

2.1.1 Mdnotes和Better Bibtex插件安装

可在文末获取这俩插件，然后依次点击zotero---Tools---Add-ons，即可弹出如下界面

此刻你只需要将mdnotes和better bibtex插件拖入此界面，即可完成安装

对于Better bibtex插件，是否安装，主要看你自己需求，如果你使用Latex写论文的话还是很有必要安装的；如果只使用word，那大可不必安装。

2.1.2 配置Mdnotes占位符

为了能够利用dataview汇总文献笔记，我们需要在zotero中利用占位符对字段格式进行自定义，也就是能够让dataview识别到。这个在mdnotes说明文档[2]里也有详细说明。

dataview能识别Yaml区内的字段，且字段后只需要跟一个冒号和一个空格；当然对此文献笔记占位符，我更推荐使用字段+双冒号+一个空格这种方式，emmm，对于dataview的基础知识，请自行了解，网上太多了，本推文不做介绍。

下面咱们就来更改zotero中mdnotes字段的占位符

• 依次点击edit---preference---Advanced---General---config editor

• 在弹出的配置占位符的窗口中输入mdnotes检索一下，如下图

我有必要说一下上图，一共有4列:

• 第一列就是占位符名称（也可理解为ob笔记模板的字段名称），注意看前面一大长串都是相同的，只有后面.url  .tags  .title等有区别，也就是说你需要自定义一个这里没有的占位符，照抄上面的名称就行，第二、三列不用管

• 第四列就是占位符具体的格式，设置具体原理自己看说明文档，这里我只说你怎么改，而且改动非常小，也非常简单。就拿url这个来说吧，只需要将Value这一列，{{field_contents}}前面的内容换为我上图的\nURL:: 即可，注意URL后是双冒号+一个空格。

• 另外publicationTitle就是我新建的，你把下面的名称和value复制粘贴过去就行，名称：extensions.mdnotes.placeholder.publicationTitle；值：{"content":"\npublicationTitle:: {{field_contents}}","zotero_field":"publicationTitle","link_style":"wiki"}

当然，你可能不知道如何新建一个占位符？

右键标题栏（就是preference name那一栏）----New----String

然后就是输入名称和值

配置完之后，关闭即可。

2.1.3 在Obsidian中新建文件夹和笔记模板

• 新建文件夹。打开Obsidian，新建一个文件夹(名称自定义，例如Reading Notes)，用于存放文献笔记，在我的开箱即用库中B-科研笔记/Reading Notes已新建此文件夹。

• 新建笔记模板。新建一条笔记，将其名称命名为Mdnotes Default Template（必须是此名称，不可自定义），然后将此笔记（模板）放在模板文件夹下，当然你想放在任意文件夹下都是可以的。在本人分享的开箱即用库中，此模板存放于Z-附件/@Templates文件夹下。

关于mdnotes笔记模板，这里我需要强调一下，mdnotes的模板有好几种：

1. Mdnotes Default Template.md

2. Standalone Note Template.md

3. Zotero Metadata Template.md

4. Zotero Note Template.md

   我采用的是第一种，这种会创建一条包含文献元数据的空白笔记文件（也就是说不会将你标注的内容提取出来）；如果你需要提取PDF标注内容，请使用3和4，具体配置参见mdnotes说明文档[2]

emmm，我的最新文献笔记模板，在V1.5版本的开箱即用库中获取。

2.1.4 Mdnotes偏好设置

安装好插件之后，点击Tools，便会看到mdnotes preference，点击它

在弹出窗口（见下图）中要设置模板文件和笔记存放文件夹路径

我不喜欢将citekey设置为标题，因为不方便我在ob中检索，我偏向于将笔记名称设置为年+文献title。

前缀设置为‘-’是为了在其前面输入年份，看个例子：

mdnotes的配置完成。

2.1.5 Better BibTex的配置

配置它的目的是将其导出的Bib引用格式设置为google学术导出的bib引用格式。

依次点击Edit---preference---选中Better BibTex，按下图配置

配置完毕。

2.2 在Ob中设置一键随想和补充新知

在阅读文献的过程中，难免会遇到各种问题和产生各种想法，此时便需要方便快捷的记录它。当然你可以直接写在obsidian文献笔记里，但这样不适合引用和汇总。

另外，根据我自己的工作流，我希望将遇到的新知识（主要是概念，原理等）都添加到专业知识这个文件夹中，方便日后补充和引用。

下面说一下具体配置教程

用到的插件是QuickAdd和page header以及Ob模板

2.2.1 设置模板

在模板文件夹新建两个模板，模板名称随意，在我的开箱即用库中就命名为文献阅读随想模板和专业知识模板，模板里的内容自定义，下面是我的模板（放在开箱即用库里了）

模板的内容根据自己的需要随便填。要强调的一点是，为了能用dataview查询到不在yaml区的字段，在字段后要跟两个冒号和一个空格。

2.2.2 配置QuickAdd

我就以一键随想为例，演示如何设置，【quickadd的简介和原理我就不介绍了，帖子很多】

• 打开Quickadd选项页，按下图输入

• 点击add choice，然后点击右边的配置一键随想

• 在弹出的窗口中，按下图配置

按上图配置，当你运行一键随想命令，便会在@Inbox/ZK Box文件夹创建一条以日期+时间为名称的笔记，且此笔记的双链会被添加到当前文献笔记的光标处。此功能倒是与我之前分享的这篇推文类似👉

• 然后在Quick窗口，点击一下闪电形状的图标，为了将其添加到命令，按ctrl+P可以检索到它

• 接下来就是利用page header插件将一键随想命令添加到文档标题栏，方便我们点击

打开page header选项，点击Add Command，添加一键随想命令即可

补充新知（专业知识模板）也是按上述步骤配置，唯一不同的是，在点击命令后，会弹出一个输入窗口，我们可以直接输入问题，并将此问题会自动变为笔记名称，具体配置方式，在我的开箱即用库里，打开quickadd选项即可看到，这里我就不多说了。

2.3 DataView汇总文献笔记和一键随想

前面配置好了，这个就很简单了。安装好dataview，然后设置好语句，就可以汇总了，最简单的语句如下，直接复制粘贴过去就能用。

• 文献笔记汇总

``` dataview
table 一句话描述,tags,publicationTitle,authors,topics,PDFAttachments,DOI
from "B-科研笔记/Reading Notes"
```

这个在开箱即用库V1.5的Home笔记中都配置好了，只要Reading Notes文件夹中有笔记，就会被检索汇总到Home笔记中。

• 一键随想汇总

``` dataview
table tags, aliases, source, Notes
from "@Inbox/ZK Box"
```

这个是在@Inbox/ZK Box文件夹，已配置好，开箱即用。

3 写在最后

拿到开箱即用库V1.5版，文末获取。

开箱方式（Ob新手指南）👉

https://flowus.cn/hust1037/share/1c977c13-d3eb-4c52-a93f-d77f56e4923e

实现上述工作流，只需要做下面两件事

• 安装mdnotes插件，配置mdnotes，就是2.1.4，设置模板和笔记存放路径等

• 修改占位符2.1.2和2.1.5

有问题，欢迎加入维客笔记交流群交流，特别欢迎你分享好玩且有趣的工具等，入群方式在公众号后台右下角（群人数大于200人，只能通过邀请入群），

4 Reference

[1] 英文论坛帖子：

https://forum.obsidian.md/t/zotero-zotfile-mdnotes-obsidian-dataview-workflow/15536

[2] mdnotes说明文档:

https://argentinaos.com/zotero-mdnotes/docs/quick-start-guide

插件与开箱即用库获取方式：关注维客笔记微信公众号，后台回复20220626