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宏基因组与代谢组/脂质组学R软件数据可视化研讨会(10月29日 腾讯在线会议)

医药加 岚翰生命科学 2023-03-10



来源︱医药加

责编︱方以一

制版︱杨彬薇


宏基因组与代谢组/脂质组学R软件数据可视化研讨会

2022年10月29日  腾讯会议网络会议室


会议背景

微生物是自然界中分布最广、种类最多、数量最大的生物类群。以肠道微生物为例,人体内微生物的总数量约是人体细胞总数的10 —— 越来越多的研究发现,肠道微生物与人体健康有着密切的关系,而微生物产生的代谢物是调控过程中最主要的中间递质之一。


宏基因组研究包括16s测序和宏基因组测序,可以获得微生物群落丰度以及组成。通过分析可以获得关键菌群以及功能,为疾病治疗提供研究基础。


代谢组学和脂质组学是基于LC-MS液质联用技术对生物样本中的小分子代谢物/脂质分子进行定性和相对定量分析。严格来讲,脂质组也是代谢组的一种。


宏基因组-代谢组/脂质组的联合分析能够从多个维度阐释一个科学问题,可以用来解释差异菌群与差异代谢物的关联性,从而帮助建立微生物-代谢物-表型之间的逻辑关系。

基于以上原因,医药加推出“宏基因组+代谢组/脂质组联合分析”R软件实操课程,带您充分挖掘数据,掌握生信高级分析能力。


【主要内容】详细内容见课表

1.宏基因组生信文章解读与报告解读。

2.R和Rstudio软件安装,宏基因组与代谢组/脂质组学联合分析实操。

3.生信SCI文章实用数据处理与图片导出。


【会议预期】

通过一天的时间学习数据处理分析及可视化作图,得到SCI水平的图片。


【讲师简介

宋伟博士

成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。


研究方向:有近十年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perlR等编程语言。

培训经历:在上海、北京、广州、沈阳、南京等城市举办过几十场现场培训班。


基础要求

R语言可以零基础,但是要求能熟练操作电脑,可以正常的跟上讲师步骤进行操作。


以下为课程详细课表



示例图展示


示例图 箱线图


示例图 PCoA图


示例图物种组成柱状图


示例图热图


示例图 venn图


示例图 circos环状图


示例图 PCA分析


示例图桑基图


主办方上海循掘生物科技中心

会议时间2022年10月29日

会议地址:线上:腾讯会议网络会议室

收费标准:会务费:1500元/人 直播学习+录屏复习


优惠政策:

1.提前确认报名及转账的,可以提前拿到学习材料

2.三人组团报名,每人优惠100

3.四人组团报名,每人优惠200元,

4.六人组团报名缴费,可免1人会务费! 

可以开正规会务发票,纸质邀请函(盖红章)。 

注意事项:携带windows系统的电脑,安装最新版本R和Rstudio


交费方式:

A:银行转账

账户名称:上海循掘生物科技中心    账户号:1001064709100016561

开 户 行:中国工商银行上海市永泰路支行 

B:支付宝转账

收款人:yonghong1028@126.com     户  名:金永红

C:公务卡支付


报名方式:

王思珍

电  话:15108204441

微信号:Wang_Sizhen

邮  箱:lt_neuroscience@126.com


方以一

电  话:15889657169

邮  箱:fangyii2020@163.com


发回报名邮件后若24h内未收到回复,请及时电话联系确认


优质科研培训课程推荐【1】单细胞测序与空间转录组学数据分析研讨会(10月29-30日 腾讯在线会议)【2】膜片钳与光遗传及钙成像技术研讨会(2022年10月15-16日 腾讯会议)


本文完


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