前言
首先,让我们重温一下Pango命名法的一些冷知识和热知识。
针对新冠病毒,现在有四套命名法(其实不止):
第一套是大伙儿最熟悉的WHO希腊字母系统,受众是新闻媒体和普通围观群众,优点是朗朗上口,缺点…除了上述优点之外其他都是缺点。并且现在这套体系也已经处于半荒废状态了,不提也罢;
第二套是reference strain系统,受众是病毒学家。优点是精确,缺点则是……这玩意儿是针对每个分离毒株命名的,而不是对整个株系命名的,所以没法建立起单个毒株之间的系统发育学意义的相互关联,并且reference strain名字通常都巨长无比,实在不适合大众传播;
第三套是nextstrain搞的clade系统,受众是病毒学家、流行病学家和大众通吃,优点是大家都能用,缺点则是针对不同变异株、不同分支的细分程度可能不够(当然这个其实也不算是缺点);
第四套就是咱这边最经常用的pango系统。pango系统跟nextstrain clade系统其实理念挺接近,相互之间也有一定的可互换性。只不过区别在于,pango系统的细分程度更高,但相对地,分支数量也就更庞大。
举个例子,最早检出、分离并上传GISAID数据库的Omicron:
按照WHO希腊字母系统叫做Omicron;
按照reference strain系统叫做hCoV-19/Hong Kong/VM21044713-1/2021(是不是真的很难记…);
按照nextstrain clade系统叫做21K;
按照pango系统则叫做BA.1。
——下面咱们简单复习一下pango系统的命名逻辑,请品鉴:
——一图秒懂:
↑ 手绘系统发生树,别嫌弃……以上是从B到AY.4.2.1的演化之路
——再举个更新鲜的例子得了:
以上是前几天刚刚得到命名的德国限量专供版BE.1.1变异株:
它的全称是B.1.1.529.5.3.1.1.1;
如上所述,每一个小节,都代表一次有显著流行病学意义的演化分支事件;
其中B.1.1.529就是元祖版Omicron;
然后为了避免名称冗长,B.1.1.529.5改名叫BA.5(其中"BA"代表"B.1.1.529");
再然后,又是为了避免名称冗长,BA.5.3.1.1改名叫BE.1(其中"BE"代表"BA.5.3.1.1");
综上,BE.1.1是BE.1下面的第一个子进化枝;
最后,BE.1.1的子毒株也已经提交了……新的字母称号可以说指日可待了
就问各位一句啊,卷不卷?卷不卷?
除了二师弟BA.2.75之外,还有大师兄BA.2.74和三师弟BA.2.76。
单纯看造型的话呢,BA.2.74和BA.2.76跟BA.2.75差远了,
各自只有两个额外氨基酸变异而已(为啥要说“只有”……)
但是,让我们再次插播一篇老文章~
——请品鉴: