把 corrplot 颜色条改成文献里那样？

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小故事

可视化相关性矩阵的 R 包有好几个,例如 ggcor、ggcorrplot、corrplot 等，我们也可以用 heatmap、pheatmap、complexheatmap 等包绘制，不过前面几个是专门针对于相关性矩阵进行可视化的，会方便一些。

有个老板给我一个 文献里的相关性图 ，想要绘制成里面的那种 颜色条样式 的：

老板使用是的 corrplot 这个包。

安装

# 安装
install.packages('corrplot')
# 加载
library(corrplot)

使用

corrplot 有很多参数，使用教程网上也有很多，大家感兴趣自行探索学习一下，需要输入 相关性矩阵数据 ，这里简要绘制一个：

# 加载数据
data("mtcars")

# 计算相关性
cor_da <- cor(mtcars)
# 默认绘图
corrplot(cor_da)

type 参数可以改变样式：

# 改变样式
corrplot(cor_da,
         # 上三角
         type = 'upper',
         # 文字颜色
         tl.col = 'black')

method 参数可以调整形状，有 circle、square、ellipse 等：

# 改变形状
corrplot(cor_da,
         # 上三角
         type = 'lower',
         # 文字颜色
         tl.col = 'black',
         # 方形
         method = 'square')

col 参数可以改变颜色：

# 改变颜色
corrplot(cor_da,
         # 上三角
         type = 'upper',
         # 文字颜色
         tl.col = 'black',
         col = rainbow(20))

感觉颜色条有一点文献里的颜色了。

改变颜色条

我们可以使用 colorRampPalette 这个函数来改变颜色的色阶个数，这样就可以表现出颜色的块状形式：

# 颜色条
corrplot(cor_da,
         # 上三角
         type = 'upper',
         # 文字颜色
         tl.col = 'black',
         col = colorRampPalette(c("#1E3163", "#00C1D4", "#FFED99","#FF7600"))(10))

记得多试试颜色 色阶个数 和不同 颜色的数量，这样就会有不一样的效果。

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