g:Profiler 基因富集利器

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1引言

今天介绍一款在线富集分析的好工具! g:Profiler, 话不多说,直接上干货。

2介绍

主页面:

富集分析

左边我们可以输入基因名或者其它 id,也支持混合 id:

然后点击 Run query 即可。

右边选择物种,支持多个物种:

高级选项可以进一步细化标准或者阈值等:

有多个富集数据库可以选择,默认全选,除了常规的 GO,KEGG 等,还有 转录因子, 蛋白, 表型等:

还可以上传自己的注释文件:

富集结果:

默认出图,点击上方可以下载图片:

点击 Detailed Results 可以下载富集结果或者查看具体富集结果的展现形式:

点击下载 csv 弹出选项,可以选择包含或者不包含哪些数据框的结果:

下面是下载结果:

id 转换

还支持各类 ID 转换:

同源基因查找

支持同源基因查找:

SNP 映射

可以将 SNP 位点映射到基因名:

大家可以去试试哦!

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