不懂就问 || MS建模精品免费公开课答疑第一弹~
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MS建模公开课
课后解答第一期
终于来啦!
公开课上的内容都会了没
不会也没关系
往下看
老师带着答案走来了
提问!
回答!
1 XSD文件名字怎么设置的??
答:随意设置,别乱改文后缀名就好。
2 请问隐藏的文件那个怎么设置来着?
答:随意打开一个文件夹。
3 计算成功了但没有outmol文件怎么办?
答:如果是可以尝试右击jobs窗口里的任务重新下载试试。或者直接去服务端jobs保存文件夹下去找。
如MS2019windows服务端在
安装目录\BIOVIA\MaterialsStudio19.1x64Server\etc\Gateway\root_default\dsd\jobs
MS2019linux服务端在
安装目录/BIOVIA/MaterialsStudio19.1/etc/Gateway/root_default/dsd/jobs
4 请问怎么搭建合金的超晶胞?
答:建议先建立合金再进行扩胞。可以使用disorder脚本枚举建立,也可以通过手动替换原子得到。
5 请问下配位数怎么求呢?
答:建议查阅相关文献或者书籍,这个并没有一个肉眼看就能确定的标准。
6 是根据什么计算化学键数量的呀,能量吗?
答:进行键级分析才可以知道。做计算化学请忘记脑海中关于形式键级那些概念。
7 这一步操作的时候出现的问题
答:仔细检查是不是将project建立在了含有中文的路径下。
8 质子化后的胍基咋画电荷每个N分配1/3?
答:计算后做原子的布居分析后才知道。
9 forcite可以优化有机药物吗?
答:选择正确的力场就可以准确优化结构,如果要研究电子相关性质需要用量子力学为基础的相关理论工具,而不能使用Forcite。
10 聚合物放入P1晶胞后,晶格大了怎么处理呢?
答:不清楚这个情况具体发生细节,不过建议回看第三讲界面吸附模型的讲解,尤其注意我对聚合物非晶胞的搭建简易。
11 COD数据库网址可以发一次吗?
答:http://www.crystallography.net/cod/
12 问一下MS里的建模然后力场优化与chem3d里建模优化有什么区别?
答:Chem3D里面的优化与动力学功能支持的理论方法很少,建议不要做为计算工具。
13 chem3D粘贴到MS能演示一下吗?
答:Chem3D保存结构为PDB然后将PDB文件拖入MS的project窗口中就可以。
14 金属氧化物cif里氧原子多了怎么办?
答:分情况来看,如果是分数占据导致的错误,可以看“模拟计算联盟”公众号关于分数占据体系的讲解。如果单纯就是搭建时候手画导致的,直接删掉就好,删掉时候注意一下,留心其他位置氧原子是否也因为对称性被同时删去。
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2021-01-18
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