全新上线 || 分子波函数性质数据库iMolS，所有客户免费用！免费用！

分子波函数性质数据库iMolS简介

由于近年来计算化学的重要性广为人知，科研工作者对计算化学的需求和热情也逐年高涨。这反映在越来越多的文章倾向于包含计算工作上。 这无疑是一件好事：即使是十分简单的计算，也时常可以给研究者带来启发。在计算化学的指导下，越来越多的研究人员能够更加有的放矢地进行其研究工作。这点变化从谷歌学术检索到的发表文章数量就可见一斑：

近年来包含“HOMO LUMO”的文章发表数量

另一方面，这也带来了许多问题。不少先前缺乏计算化学工具使用经验的研究者为了得到一些十分基础的数据而开始学习使用计算化学工具。这一方面带来了学习成本，另一方面也使得计算结果的可靠性难以得到保证。此外，一些热门分子的基本性质经常被不同研究者反复计算，从而造成了人力物力的浪费。

搜索包含诺氟沙星和DFT的文献，就可以得到约1700条结果，其中相当大一部分都是对几何结构、前线轨道等的反复计算。

唯理计算建立开放式数据库

为了解决这些问题，我们建立了开放的分子计算性质数据库iMolS (internet Molecular databaSe)

网址：https://imols.shiyanjia.com/

它旨在为每个研究者提供一个能方便获取到已知分子的基础计算化学数据的平台。通过建立这类基础数据的共享数据库，我们希望节约研究者的时间，使得每个人都能轻松得到高质量的计算结果。

iMolS目前包括了几何结构、前线轨道、静电势、一些重要的原子电荷、Fukui函数的信息，并支持原始文件的下载。

iMolS的使用界面，在其中可以通过CAS、SMILES、系统命名等进行检索，也可以绘制结构式检索。

目前，iMolS中的数据均由我们在M06-2X/ma-def2-TZVP//PBE0-D3BJ/6-31+G(d,p)水平下得到，所有分子均使用GFN2-xtb进行过构象搜索，以确保得到了较为合理的构象（这一搜索算法并不完美，特别是很多带有羧基的化合物中羧基仍然采取了s-trans构象，提请注意）。在第一批数据的生成过程中。我们使用了PubChem上收录的分子，对每个分子均在上述水平进行了构型优化并得到构型和前线轨道，以此为基础使用M06-2X/ma-def2-TZVP水平得到了Hirshfeld、NPA、RESP三种原子电荷，分子表面静电势，以及Fukui函数。

数据库使用方法

点击详情界面，即可看到分子的基本信息。

接下来点选各栏目，即可十分直观地展示该分子的基本计算化学性质。

所有计算结果的原始文件（fchk）均可下载，如需在此基础上进一步计算或处理也非常方便。

截至目前，该数据库已对外开放的数据约有5000条，然而我们的数据远不止于此，目前在我们的服务器上已有约1.5万条数据，它们会在经过格式转换等进一步处理后陆续上传，同时每天也有约500条新数据在不断生成中。随着功能的进一步完善，我们会开放用户注册和自行上传数据的功能，这样任何人都可以为这个众人皆可获取的数据库贡献一份力量。

这是PubChem目前收录的全部数据，我们的目标同样是百万量级！我们希望待它最终建成时，当任何人想到任何分子，需要这些基础计算化学数据时，都能不费吹灰之力地从这里找到，这样或许能成为广大科研工作者的福音。

=科研很苦，坚持很酷=

---

动动小手加星标，浏览文章不迷路！不用每天花费时间刷信息流也可以随时看到自己喜欢的内容啦！

往期推荐
万事屋告示牌


关注我们

点了“在看”的小哥哥小姐姐

今年发IF>10一作