LAMMPS小班课 || 常用性质计算、MD建模、吸附动力学计算
The following article is from 模拟计算联盟 Author 唯理计算
分子动力学模拟(Molecular Dynamics)主要依靠牛顿力学来模拟分子体系的运动。通过模拟微观粒子的运动来计算宏观性质,更加直观地展示实验现象发生的机理与规律,因此在生物、材料、化学、药学等多个学科中的研究中,发挥着越来越重要的作用。
可以进行分子动力学计算的软件也非常多,比如Gromacs,LAMMPS等等。我们之前针对Gromacs软件的使用,开发过相关的培训课程,Gromacs主要针对生物体系,同时也兼顾一些化学体系的计算研究,感兴趣的小伙伴可查看相关课程介绍(点击链接跳转)
本次,我们主要介绍一款更适合材料体系进行分子动力学研究的软件-LAMMPS。
LAMMPS(Large-scale Atomic/Molecular Massively Parallel Simulator)即:大规模原子分子并行模拟器,主要用于分子动力学的一些计算和模拟工作。
LAMMPS可以模拟液体中的粒子,固体和汽体的系综,也可以采用不同的力场和边界条件来模拟全原子、聚合物、生物、金属、粒状和粗粒化体系。LAMMPS软件可以用来建立原子/介观/连续尺度物质的体系,并计算模拟其在热、力、化学条件下的性质。
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