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MS入门手册(3):Materials Studio软件中所有的输入输出文件及其作用【建议收藏,方便日后查看】
MS杨站长团队
MS杨站长
2022-10-05
收录于合集 #MS入门手册
5个
【MS入门捷径】
建模,DFT/分子动力学,吸附与催化,正负极材料,固/液态电解质,反应/迁移能垒,CO2RR/OER/HER
本文为杨站长技术团队制作的《Materials Studio入门手册》第三篇,后续内容将会持续更新。
MS入门手册(1):Materials Studio全模块功能介绍!
MS入门手册(2):量子力学、分子力学、介观模拟方法,各模块重点介绍!
这篇教程为大家介绍Materials Studio(MS)中常见的文件格式和它们的作用。
Materials Studio软件可以对很多文件做很多操作,希望使用MS软件做分子模拟的同学们做在计算过程中看到某种文件,就能知道这种文件存储的内容是和用途,这样就不会在计算过程中把操作对象弄错,例如不能把处理轨迹文件的操作用于结构文件。
强烈建议大家收藏此文,以便于在今后计算过程中查看。
MS支持将多种格式数据导入工程文件中,也可以从工程文件中导出数据。文件类型按照存储内容分类,共分11类,分别是普通结构和轨迹文件、介观结构文件、图表和工作表文件、格点数据文件、与Kinetix功能模块相关的文件、脚本文件、文本文件、力场文件、设置文件、图像和视频文件。接下来以表格形式列举这些文件的扩展名、在计算中属于输入还是输出文件(或在软件中支持导入还是导出)、存储内容。
表一 普通结构和轨迹文件
表二 介观结构文件
表三 图表和工作表
表四 格点数据文件
表五 Kinetix功能模块文件
表六 脚本文件
表七 文本文件
表八 力场文件
表九 设置文件
表十 图像和视频文
补充说明:
1. Materials Studio中定义了七种基于可扩展标记语言的文件格式,.msd、.xsd、.xcd、.xgd、.std、.xkc和.xkp,文件中包含了配置、材料性质等很多信息,仅能在Materials Studio中可视化,但均可使用Windows系统下文本阅读程序如写字板、记事本或浏览器打开。
2. 此文中未列举的其他格式的文件,如.hessian(Hessian矩阵数据)、.outmol(DMol
3
模块计算结果输出文件)、.castep(CASTEP模块计算结果输出文件)等,它们并不是专门的文件格式,其本质都是txt文本文件。
3. 有些文件可以存储多种信息,例如cube文件中既包含分子结构信息,又包含格点数据信息,而csv、grd、xgd文件中仅包含格点数据信息。
4. MS的工程文件扩展名为.stp,打开MS时必须打开或新建一个工程文件,它既不是输入文件,也不是输出文件,且不能另存为一个工程文件。
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