本文为杨站长技术团队制作的《Materials Studio入门手册》第八篇,本教程旨在从零开始带大家入门MS软件DFT计算,文末可下载更多学习资料。
MS入门手册(1):Materials Studio全模块功能介绍!
MS入门手册(2):量子力学、分子力学、介观模拟方法,各模块重点介绍!
MS入门手册(3):Materials Studio软件中所有的输入输出文件及其作用
MS入门手册(5):Materials Studio制作高质量科技论文图片!
大家好,从前面几次的课程中大家有没有一些收获呢?上次我们讲到每个计算方法所包含的模块,其中有一个叫做CASTEP的模块,不知道大家还有没有一点印象呢。大家可能还记得,CASTEP模块仅可以计算具有周期性结构的模型,现在我们就来导入一个晶体结构吧。请大家打开您的Materials Studio,开始我们第一次计算旅程。关于软件、答疑等,可加入QQ交流群提问:915466022您的Visualizer界面有没有Project(项目)区、Properties(性质)区和Jobs(任务)区呢?如果没有的话,还记得怎么调出这些区域吗?这是我们再上节课学习的内容,提示一下,可以从View菜单中,然后还记得吗,是的,在Explorers选项里,您想要的内容我们都有。MS预置了很多晶体结构模型,这些都可以从结构文件中找到。我们有两种方式导入结构文件,可以通过右击工程名称,选择Import...,也可以从File菜单中选择Import选项,均可以打开“导入文件”对话框。在Structure文件夹中有大量的结构模型,包括催化剂、陶瓷、玻璃、金属氧化物、金属、矿物、分子晶体、纳米管、有机物、高分子、重复单元、半导体、分子筛等不同的分类,我们要打开的是陶瓷文件夹下的金刚石结构模型,这是我最喜欢的结构啦,博士生涯全部献给这种具有各种极端性质的bulingbuling的晶体。当我们导入了晶体结构之后,就会在Project区域多出一个3D结构文件(后缀为.xsd),而在右侧的界面中打开这个金刚石晶体结构文件。这个结构好像和我们平时看到的晶体模型不太一样?那您通常看到的晶体模型是什么样子呢?球棍模型?那我们一起更改一下显示方式吧,通过在晶体结构旁边的部分右击,就可以在菜单中选择Display Style进行更改了。这里原本使用的是Line(线状显示)模式,可以修改成Ball and stick(球棍状)或者CPK(最密堆积)模式,原子的颜色也可以进行修改,如果选中若干原子,也可以仅对选中的原子的相应显示性质进行更改。计算的时候原子数量太多,计算量比较大怎么办呢?MS里有原胞和惯用胞的选项,原胞是可以表示晶体周期性的最小结构单元,而惯用胞则是包含晶体所有对称要素的最小单元。从Properties区域可以看出,对于金刚石晶体,原胞仅包含两个原子,而惯用胞则包含8个原子。今天我们说到了晶体结构的引入以及显示方式的修改,除了打开MS自带的一些结构文件,我们也可以从各种外部数据库下载相应的晶体结构文件导入MS。MS也提供了建立晶体的方法,可以通过晶格常数和原子坐标建立自己的晶体结构,下一次我们就来说说这个话题,并且建立一个Y0.15Zr0.85O2形式的晶体模型。《MS入门手册》针对完全零基础的学员设计,约100篇文章,紧跟杨站长,学会计算,拿下顶刊!配合杨老师录制的MS视频食用,效果更佳!共120+视频,关注量10000,包含建模与计算特训营(长)+官方教程指导(长)+新手避坑指南100讲(短),并依大家需求不断更新。3分钟解决一个计算难题,1小时搞定一张SCI插图!扫描下方二维码或点击B站链接:https://space.bilibili.com/669166168同时杨站长提供了大量学习资料,大家可以学习和下载,包括官方手册以及对应视频教程等。Materials Studio
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