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MS入门手册(31):Materials Studio纳米结构模型搭建:纳米管

Ravi MS杨站长 2022-11-21

本文为杨站长技术团队制作的《Materials Studio入门手册》第30篇,共约100篇。本教程旨在从零开始带大家入门MS软件,文末可下载更多学习资料。紧跟杨站长,学会计算,拿下顶刊!
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MS入门手册(4):Materials Studio文件和目录的建立、打开、关闭、命名/重命名、拷贝、移动和删除【建议收藏,方便日后查看】

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MS入门手册(10):Materials Studio从无到有建立晶体结构
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MS入门手册(13):Materials Studio晶体点缺陷建模:空位
MS入门手册(14):Materials Studio晶体点缺陷建模:取代与间隙
MS入门手册(15):Materials Studio建模:超晶胞、晶格常数预测
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MS入门手册(18):Materials Studio表面建模:切表面、六方晶系、真空层、带根号表面
MS入门手册(19):Materials Studio表面吸附分子模型的建立

MS入门手册(20):Materials Studio表面建模之吸附位置的精确控制

MS入门手册(21):Materials Studio表面建模之分子位置的精确控制

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MS入门手册(23):Materials Studio建模 — 界面模型中原子的固定

MS入门手册(24):Materials Studio建模 — 晶格失配度较大的界面:超胞模型

MS入门手册(25):Materials Studio建模 — 晶格失配度较大的界面:根号模型

MS入门手册(26):Materials Studio建模 — 六方晶系晶体界面

MS入门手册(27):Materials Studio建模界面模型的原子堆叠问题

MS入门手册(28):Materials Studio建模 — 孪晶界面的建立

MS入门手册(29):Materials Studio孪晶界面模型,建模小工具集锦
MS入门手册(30):Materials Studio纳米结构模型搭建:零维结构
大家好,我们继续上次的纳米结构之旅。上次的课程中我们对于零维纳米材料,特别是纳米团簇模型的建立进行了讲解,不知道大家有没有很好的掌握,又有些什么疑问呢?
有小伙伴问到之前没有使用过的一些功能和选项,这里稍作解答。Vacancy concentration表示空位浓度,当我们设置为0.1时可以明显看到出现的空位,浓度为0.1。Cap broken bonds表示的是表面悬挂键的处理,比如对于下面的碳团簇,可以用H对表面的悬挂键进行饱和。
含有空位和悬挂键被饱和的碳纳米团簇
团簇中也可以直接进行原子的取代,在Substitution选项卡中,选择取代分布Distribution,有沿某一特定晶轴(仅对于某些形状有该选项)以及沿所有方向(径向)两种分布函数。
接下来可以选择函数形式和取代比例,下图所示即为沿径向分布,从中心开始以P原子取代C原子,取代比例从0%到50%以线性函数形式递增,得到的碳纳米团簇,比起自己建立取代模型看起来要方便很多了。
P取代部分C原子的团簇
对纳米团簇进行了进一步说明之后,接下来我们对于一维纳米结构进行介绍。一维纳米结构,即在一个维度方向上具有较大尺度,而另外两个维度上处于纳米尺度范围内的材料,包括空心的纳米管(单壁、多壁、碳管束)、实心的纳米线、纳米棒/纳米针、具有长方形截面条带状的纳米带、纳米带缠绕形成的纳米环等。
这次的课程我们主要对碳纳米管的建模方法进行说明。
理想碳纳米管可以视作是由石墨烯片层卷成的中空管体,由一层石墨烯卷成的为单壁碳纳米管,由多层石墨烯卷成的叫做多壁碳纳米管,分别可以通过在菜单栏Build-Build Nanostructure中的Single-Wall Nanotube和Multi-Wall Nanotube选项建立模型,下图中前两个选项就是用来实现该功能的。
多个碳纳米管平行排列可以组成碳纳米管束,可以利用Nanorope选项实现,也就是下图中的第三个选项。可以看出来,纳米管在纳米材料研究中占有非常重要的地位。
关于建立纳米管模型的选项
为了理解碳纳米管模型搭建时的参数,我们首先要介绍一下关于纳米管的理论知识。纳米管是由石墨烯卷成的圆筒状结构,但是石墨烯可以沿着不同方向卷曲,因此碳纳米管的截面会有不同的形貌。
可以用手性矢量Ch=na1+ma2描述石墨烯卷曲的方向,其中a1a2为单位方向矢量,m、n是整数,通常可以用(m, n)来表示碳纳米管的结构。另外,也可以用直径dt和手性角/螺旋角θ(手性矢量与a1之间的夹角)表示,这两个量m、n之间有对应的换算关系。
根据m、n之间的关系,可以将单壁碳纳米管分为三类:
  1. m=n时(此时θ=30°),扶手椅形纳米管(Armchair);
  2. m=0或n=0时(此时θ=0°),锯齿形纳米管(Zigzag);
  3. 其他情况(m≠n且m·n≠0,此时0°<θ<30°),手性纳米管(Chiral)。
手性矢量与不同类型的碳纳米管(图片来源Wilder J G, Venema L, Rinzler A, et al. Electronic structure of atomically resolved carbon nanotubes [J]. Nature. 1998, 391: 59-62.)
现在就可以打开单壁纳米管搭建对话框,对其中的参数进行调整,首先是N、M值,和我们上面说到的m、n是同样的概念,默认N=M=6(m、n具体值是控制直径的,改变时可以看到直径变化,比如N=M=6时直径8.14 Å,如果N=M=5时直径就变成6.78 Å了),是扶手椅形纳米管。
Type中可以选择碳纳米管和氮化硼纳米管两种,键长可以自行设定,也可以使用默认。周期性纳米管如果选中,则是沿z轴无限延伸的,否则可以设定重复单元以及是否用氢键进行饱和。按下Build按钮,就可以看到搭建好的单壁纳米管结构。
单壁纳米管搭建对话框
但是这样的显示方式可能看不出来沿z方向不断延伸,可以改变一下显示方式,增加在z方向上显示的晶胞数,并取消晶格的显示,看起来就好看多了。
改变显示方式
不过我们看到的很多图片上的碳纳米管是近大远小的,具有一定的透视性,看起来非常好看。这样的设置是怎样实现的呢?
可以通过显示选项来达到这个效果,在结构文件空白区域右击,菜单中选择Display Options选项打开对话框,Graphics选项卡中Projection部分选择Perspective(透视),可以调整透视角,并使用快捷工具栏上的工具进行方向的调整,产生下图所示的显示效果。
纳米管的透视显示效果
分别建立N=M=6(扶手椅形),N=6/M=0(锯齿形)和N=1/M=6(手性)的碳纳米管结构,从侧面看一下有什么不同。
不同类型的碳纳米管
可以看到纳米管的结构是类似于螺旋上升的。好的,现在我们就完成了对于单壁碳纳米管结构的搭建,那么这次我们就到这里啦。祝大家多多发高影响因子paper,我们下次再见。

Materials Studio

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