本文为杨站长技术团队制作的《Materials Studio入门手册》第41篇，共约100篇。本教程旨在从零开始带大家入门MS软件，文末可下载更多学习资料。紧跟杨站长，学会计算，拿下顶刊！杨老师B站链接：https://space.bilibili.com/669166168关于MS软件、答疑等，可加入QQ交流群提问：915466022MS入门手册（35）：Materials Studio建模 — 纳米结构模型搭建：从纳米棒到纳米线
MS入门手册（36）：Materials Studio建模周期性相关问题
MS入门手册（37）：Materials Studio组合模型的搭建（1）
MS入门手册（38）：Materials Studio组合模型的搭建（2）
MS入门手册（39）：Materials Studio组合模型的搭建（3）
MS入门手册（40）：Materials Studio有机物分子结构模型的绘制
上节课我们说到了有机物分子的绘制，如何利用绘制草图的各种工具，绘制一个链状或包含苯环的有机物分子，以及将分子定义为片段Fragment，从而实现分子片段的批量绘制和连接，不知道大家还是不是记得，如果忘记了，一定要再操作一下哦。学而时习之，不亦乐乎。接下来我们对环的问题进行一些小说明，上次说到，我们可以直接利用六元环的结构绘制苯环，只要按住Alt键并单击鼠标左键，否则的话画出的实际上是环己烷的结构（也就是都是单键）。那如何画出共边或者共角点的两个苯环（或者其他环状）结构呢？只需要使用画环工具在共用的边或者角点上（此时被选中的部分是蓝色的）单击就可以了，比如在一个苯环上共边连接另一个苯环，只需要按住Alt并在这条边上单击，就在这个位置上连接了另一个环状结构。以及，对于环状结构也可以和其他结构一样进行原子的取代，例如我们这里画一个吡咯环C4H5N，首先画一个五元环，接下来选择其中一个C原子，改成N原子↓↓接下来把一些键改成双键，用小铅笔单击化学键就可以改变类型。最后利用加氢工具进行加氢，并利用清理工具使得结构更加规整，现在就画出了一个吡咯环的结构，如果我们有4个吡咯环，再加上一些简单的绘制原子的操作，就可以画一个卟啉分子了。这是一个比较简单的COF分子绘制的例子，对于比较复杂的例子的绘制，欢迎来参加MS初级课程哦，笔者在课堂上学到了很多关于COF分子模型绘制的知识呢（当然最后还是脑子觉得会了，手说“我不行”）。接下来我们开始绘制高分子聚合物，首先我们学习如何建立一个高分子均聚物模型，在菜单栏中Build-Build Polymers-Homopolymer就可以开始构建均聚物模型，所谓均聚物就是由同一种重复单元（单体）聚合而成的高分子，而由两种或两种以上单体聚合而成的高分子叫做共聚体（共聚物）。就会弹出建立均聚物对话框，在Polymerize（聚合）选项卡中有这样的几个选项，前两个选项是选择单体的，在某个文件夹下的某个文件名，实际上就是structure文件夹中的单体文件夹的内容，比如我们选定了一个单体结构（尼龙66）。后两个选项分别是Chain length（链长），也就是有多少个单体聚合，以及画多少条分子链，我们这里选择默认值，10个单体聚合成1个链，仅画一个分子链，单击Build按钮，就得到了一个长长的Polynylon66分子。下次我们再通过一篇文献讲等规度（tacticity）的选项，这是比较复杂的概念。即使名称相同，单体和片段（绘制工具中的Fragment Browser）有时还是有区别的，比如说对于Pyrole的单体，键的类型就有些细微区别。Advanced选项卡中第一个选项为取向（Orientation），设置的是两个单体是通过哪两个原子进行聚合，如果我们还记得上节课讲过的设置单体的内容，就会记得让我们定义头部和尾部原子。所以就可以通过头碰头（下图左边的图即为头碰头的取向）和头碰尾（下图右图）的两种方式进行聚合，图中的黄色点为两个单体之间的连接键。接下来就是Initiator和Terminator功能，分别表示聚合物链的首端和末端是否要连接某个官能团，下图中间的部分为聚合物链，首段连接了amino（氨基），末端连接了benzal（苯亚甲基）。好啦，我们今天就先说到这里，下次我们涉及到的是等规度的概念，希望小伙伴们能够不断进行练习和尝试。为了让科研党尽快上手Materials Studio并发表高档次文章，华算科技杨站长原创设计并经过多次迭代优化，推出了MS系列课程。结合案例深入浅出，带大家从入门到进阶，手把手带你扎扎实实、快速入门DFT理论计算！学员利用课上所学已发表Angew.、AM、AEM、Nature子刊、New Journal of Chemistry、Applied Surface Science等顶刊文章。报名方式：识别下方二维码报名，或者联系手机：18126387652。