MS入门手册（55）：Materials StudioBuild Analogs中连接点组的分配方式
MS入门手册（4）：Materials Studio文件和目录的建立、打开、关闭、命名/重命名、拷贝、移动和删除【建议收藏，方便日后查看】
MS入门手册（41）：Materials Studio有机环状结构的绘制与均聚物模型的搭建
MS入门手册（42）：Materials Studio等规度的概念
MS入门手册（49）：Materials Studio无规共聚物的增殖方法—概率
MS入门手册（50）：Materials Studio无规共聚物的增殖方法——竞聚率
MS入门手册（51）：Materials Studio树枝状大分子模型的建立
大家有什么想法，可以进群讨论：
看到很多小伙伴在卸载、安装MS之后都会出现若干问题，比如显示之前的版本还没有卸载干净，或者新的版本不能打开、不能运行计算等等问题。我们在卸载旧版本和安装新版本之后，使用上没有出现任何问题，这里稍微分享一点经验。
首先打开设置中的添加或删除程序，找到与MS相关的几项（就是BIOVIA开头的四个程序），包括BIOVIA License Pack的两项，先把这两项进行卸载，之后卸载Materials Studio Gateway Service，最后卸载Materials Studio主程序，程序卸载部分就完成了。
添加或删除程序
接下来是删除相关文件夹，在C:\Program Files (x86)中的BIOVIA文件夹，如果是早期版本，会有Accelrys文件夹（2017版本的就有），这个（或者这两个）文件夹也是要彻底删除的。
BIOVIA和Accelrys文件夹（如果有）也要删除
最后就是处理注册表项，按住键盘上的win+R，打开运行对话框，输入regedit，单击确定，打开注册表编辑器。
运行对话框
删除“计算机\HKEY_LOCAL_MACHINE\SOFTWARE”和“计算机\HKEY_CURRENT_USER\SOFTWARE”目录下的BIOVIA和（或）Accelrys文件夹（如果有），就把注册表项删掉了。
删除注册表项
总之，经过这几个操作，就能彻底删除了2017版本的MS，再安装2019版本时没有提示任何错误，并且可以进行后续计算。
工欲善其事，必先利其器，有了更高版本、功能更丰富的Materials Studio作为利器，进行模型搭建和计算分析一定会更加便捷（特别的，MS2021新版本已经发布，针对催化计算开发了新模块FlexTS，对原有模块增设新功能（比如Forcite为锂电池增加了新力场参数），另外支持GPU并行计算，大大提高了计算速度，大家可以先睹为快~【催化&电池计算福音！Materials Studio重大更新全曝光， 2021版本震撼发布！】：https://mp.weixin.qq.com/s/c5BLWrCSZvbX7nFRV4rU2w）。
我们接着上次的内容，接着说关于Build Analogs工具的使用。上次说到，在Fragments选项卡中有三个关于连接点组分类方式的选项，我们首先对这三个选项进行说明，分别是：
所有组分开（All groups separate）：每个内核上的每个连接点组都将分开列出，并且可以与不同的片段集相关联。
跨内核组匹配（Match groups across cores）：不同内核上具有相同名称的连接点组将一起列出，并与同一组片段相关联。
匹配所有组（Match all groups）：每个内核上的所有连接点组将一起列出，并与同一组片段相关联。这是最简单的设置，对于快速设置枚举非常有用。
我们仍然以之前所建立的苯和乙烷结构作为核心，在苯上设置了连接点组R1和R3（为了方便后续操作，之前已将苯的R2连接点组删除），在乙烷上设置了连接点组R1和R2，如下图所示。
苯和乙烷分子上设置的连接点组
分别使用三个连接点组匹配选项进行匹配，得到的匹配结果有差异。使用All groups separate选项时，左侧连接点组列表中将包含苯R1、苯R3、乙烷R1、乙烷R2四个组，可以分别连接不同的片段，也就是按照内核和连接点组进行分类，所有内核的所有连接点组分别显示。这里已选片段均为Amino Acids目录下的结构，不同连接点的已选片段分别为：苯R1——ala和arg、苯R3——asn、乙烷R1——asp、乙烷R2——cys。上次教程中也有提到，添加片段可以双击连接点组列表的连接点组，也可以双击已添加片段列表中的任何一个片段（如果还没添加过，双击列表空白处也可以的），打开Choose Fragments对话框，在左侧选择片段，并通过“>”按钮添加或“<”按钮移除，选择完毕后单击OK按钮进行确定。
Choose Fragments对话框
所得到的结构如下，其中苯连接支链有两种可能，分别是R1连ala/arg、R3连asn，乙烷连接支链仅一种可能，R1连asp、R2连cys。
All groups separate选项
如果使用Match groups across cores选项，会把即使是内核不同，但是连接点组相同的项目合并（也就是按照连接点组进行分类，把同编号连接点组分在一起，即使内核不一样也进行合并），比如这里“苯R1&乙烷R1”就被分成了一个项，另有连接点组编号不同的乙烷R2和苯R3两项，一共有三个组了。由于刚才设置了一些连接片段，会自动把原来的苯R1和乙烷R1的三个已选片段整合到“苯R1&乙烷R1”项的已选片段下。单击Build按钮将产生6个类似结构，即对于苯连接支链的结构，苯R1为ala/arg/asp，苯R3均为asn，对于乙烷连接支链的结构，乙烷R1为ala/arg/asp，乙烷R2均为cys。
Match groups across cores选项
如果选择Match all groups选项，就不区分内核和连接点组的任何信息，把所有这些组全部放在一起，如果在之前设置的已选片段列表下，直接修改匹配方式为Match all groups，所有的已选片段将都在列表中出现，就会有5个片段，每个连接点都可能连接这5个片段中的任意一个，从而产生很多结构（一共有50个），因此这里只保留ala和arg两个片段在列表中。此时单击Build按钮将产生8个不同的结构，对于苯连接支链的结构，R1/R2可以为ala/arg，对于乙烷亦然。
Match all groups选项
如果最初选择了All groups separate，之后改变为另两个选项，或选择了Match groups across cores，之后改变为Match all groups（向下选择），对于已选片段的重新分配还是比较智能的，可以把片段合并到相应的组里。但是，如果之后重新选择原始选项（想上选择），片段分配将不会更改，原始设置将不会恢复。因此，在开始选择要添加到连接点组的片段之前，最好先确定要使用的分配方案。
凡事预则立，不预则废，希望大家都不要废了哈哈。我们这次就到这里，下次别忘了继续跟着小MS一起学习建模知识哦。
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