MS入门手册（56）：类似物结构的显示与命名方式
MS入门手册（4）：Materials Studio文件和目录的建立、打开、关闭、命名/重命名、拷贝、移动和删除【建议收藏，方便日后查看】
MS入门手册（41）：Materials Studio有机环状结构的绘制与均聚物模型的搭建
MS入门手册（42）：Materials Studio等规度的概念
MS入门手册（49）：Materials Studio无规共聚物的增殖方法—概率
MS入门手册（50）：Materials Studio无规共聚物的增殖方法——竞聚率
MS入门手册（51）：Materials Studio树枝状大分子模型的建立
大家有什么想法，可以进群讨论：
MS作为一个应用程序，大家不用害怕在尝试什么功能的时候，就把整个系统弄崩了（顶多是程序重启），因此，可以最大限度地进行尝试。比如这几次教程所讲解的Build Analogs工具，就是小MS在写教程前几天刚刚试出来的新功能，于是就分享给大家。MS学习有一个好帮手，就是MS Help文件，Help按钮无处不在，任何一个功能几乎都能够用Help按钮找到相应的讲解。Help文件中的英文比较简单，基本上大家都是能够读得懂的，或者用百度翻译，很容易就能够理解，希望大家在遇到英文的时候，克服恐惧情绪，就会发现比起文献，这里的英语解释简直是太通俗易懂了。
Help无处不在，提示文字也很简单
上次的Build Analogs工具还剩了个小尾巴，这次我们就不继续课前闲聊了。为了简化之后的操作，在Core列表中仅保留苯，不同连接点的已选片段：苯R1——ala和arg、苯R3——asn，作为一个简单的例子对Option选项卡的内容进行说明。
Build Analogs参数设置
Option选项卡主要涉及结果显示方式、结构命名和后续处理等选项。返回结果方式（Return results as）选项可以在下拉列表中选择类似结构序列的输出格式，包括Study table only（仅研究表），类似物的结构将在研究表文件（.std）中列出，之前我们输出的结果就是显示在研究表中的，例如
打开研究表中的一个结构
另一个结果呈现方式为Trajectory only（仅轨迹），类似物的结构将在3D原子轨迹文件（.xtd）中呈现，如
.xtd文件的第一帧和第二帧
如果选择了“Study table and trajectory”选项，则会同时产生研究表.std和轨迹.xtd文件。项目中的类似物存储在一个隐藏的.sdf文件
“Study table and trajectory”选项
结构命名依据（Name structures by）：从下拉列表中选择用于标记类似物的命名系统，基于用于构建它们的内核和片段。可用选项包括：序列号，例如core1_1、core1_2等；内核与片段编号，例如core1_1_1、core1_1_2、……、core1_2_1、core1_2_2等；内核与片段名称，例如core1_core1_F、core1_core1_Cl、……、core1_core2_F、core1_core2_Cl等。在所有情况下，类似物的名称总是以“内核”选项卡上列表中列出的第一个内核结构的名称开始，而不管生成的类似物所基于的实际内核结构是什么。
从上至下命名方式分别为：序列号、内核与片段编号、内核与片段名称
结构清理（Clean structures）：选中时，表示将使用Materials Visualizer中的clean功能
加了clean功能，好像结构也没什么大区别
添加氢（Add hydrogens）：选中时，表示将使用Materials Visualizer中的加氢功能重新计算并相应更新每个模拟结构上氢原子的数量和位置。当然，clean和加氢功能可以在建模结束之后再对某个所需要的结构手动进行，在工具栏上进行选择即可。
至此，关于类似物分子结构的搭建方式就介绍完了，利用该选项，可以由枚举方法，建立一系列结构相似的分子的模型，比如一系列卤代物结构，方便模型搭建。
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