其他
一、基本原理分子动力学模拟将体系中的每个原子视为遵守牛顿第二定律的粒子,根据分子的势能函数,得到作用在每个原子上的力,给定初速度和演化的步长,利用牛顿运动定律求解运动方程,便得到原子在势能面上的运动轨迹。在一定的时间内,通过对体系中分子、原子运动状态的模拟,从而以动态方式观察体系随时间演化的行为。21世纪的科学已经不再是实验与理论平分秋色,而是实验、模拟、理论三分天下,模拟是联系理论与实验的纽带,在解释实验现象,预测理论结果中起着关键作用,对于研究分子的学科,无论从事哪个领域的研究,理解并实践分子模拟都够增强你对新问题的分析力和洞察力。分子动力学模拟是分子模拟中最接近实验条件的模拟方法,能够从原子层面给出体系的微观演变过程,直观的展示实验现象发生的机理与规律,促使我们的研究向着更高效,更经济,更有预见性的方向发展,因此,分子动力学模拟在生物,药学,化学,材料科学的研究中发挥着越来越重要的作用。二、计算项目固态(金属,非金属,半导体等)液态(水,溶液)软物质(高分子,DNA,蛋白质)粗粒化物质三、文献报道图3