活菌制剂原则上不与抗生素合用以免影响疗效。若需同时应用抗生素以控制严重感染，可错开服药时间，或考虑应用死菌制剂（如乐托乐）或酵母菌制剂（如亿活胶囊），该类药物不受抗生素的影响。