生信小白学习记

其他

R语言笔记13:模拟线性模型和随机抽样

y)可以看到,x是二元变量,y依旧是连续的,符合正态分布从复杂模型中模拟取值假设结果y服从于一个平均值为μ的泊松分布,log(μ)服从一个截距为β0,斜率β1的线性函数,x是其中的自变量>
2018年4月11日
其他

R语言笔记11:两个重要函数——用来分解数据框的split和用来查看对象的str

写在前面(~(^_^)~)清明小长假休息了三天,回来发现粉丝数破了200,感动嘤嘤嘤(含泪鞠躬感谢大家的关注)。公众号开了一个月,初衷就是分享一只实验狗转生信小白的学习笔记,每天学了啥就发点啥,回头看看真的很乱,有R,有ggplot2,有Linux,对不起大家T.T,有时间了我会把它们整理起来,方便一起学习。内个,真的谢谢大家的支持还有小伙伴的留言and鼓励(文章虽然没有留言功能但是大家可以直接在后台发消息,我看到会回复的^^),希望大家多多提建议,希望我们可以一起坚持下去~~-----------
2018年4月9日
其他

R语言笔记10:循环函数apply、tapply、mapply

昨天学习了循环函数lapply和sapply,今天继续看看他们的姊妹篇。applyapply函数是另一个循环函数,它可以把一个函数应用在一个数组的各个维度上,应用对象是矩阵的行和列。(矩阵是最常见的数组类型,是二维数组)在命令行中apply比for循环相对更好用一些,因为输入较少。apply函数长这样:>
2018年4月4日
其他

R语言笔记8:functions——词法作用域

R作用域(scope,或译作有效范围)是名字(name)与实体(entity)的绑定(binding)保持有效的那部分计算机程序。什么是作用域规则?作用域规则(Scoping
2018年3月22日
其他

ggplot2读书笔记12:第九章 数据分析

ec2不是ggplot2中自带的数据集,无法直接加载出来,通过万能的Google找到了加载ec2的方法,在此之前我们需要再多安装一个用于时间数据处理的r包
2018年3月15日
其他

ggplot2读书笔记11:第八章 主题设置、存储导出

theme_grey(),用来把所有主题元素协调一致。举例,如下图表,(变量cty和hwy:城市和高速公路行驶记录每加仑行驶的英里数)base
2018年3月14日
其他

R语言笔记5:控制结构

else}Else不是必须的,如果只需要在某条件成立时执行某个任务,那么只要使用if语句就可以了if()
2018年3月13日
其他

ggplot2读书笔记10:定位(分面和坐标系)

dir等参数设置排列。如下例:library(ggplot2)##
2018年3月12日
其他

ggplot2读书笔记9:第六章 标度(二)

coord_trans()中,此时变换将在统计量计算完成后进行,详见第七章日期和时间值基本上属于连续型,但在标注坐标轴时处理方式稍有不同。我们使用
2018年3月9日
其他

ggplot2读书笔记7:第五章 通过图层构建图像

分享零基础生信小菜鸟日常学习笔记。欢迎批评,交流和鼓励~O(∩_∩)O
2018年3月7日
其他

ggplot2读书笔记6:语法(一)基础理论

geom_point()不同,因为它不显示原始数据,而是显示数据的统计转换。所以,这个过程的形成是在将数据映射到美学之后,传递到统计转换(stat)加以处理。
2018年3月6日
其他

ggplot2读书笔记5:工具箱——误差线、加权数、展示数据分布

ggplot2中,四类几何对象可以用于这项工作,这取决于x的值是离散型还是连续型,以及我们是否想展示区间中的中心值:
2018年3月6日
其他

ggplot2读书笔记4:图层的使用(二)群组几何对象和曲面图

举例:纵向数据集Oxboys(nlme包)记录了26个男生(subject)在9个不同时期(occasion)中测定的身高(height)和中心化年龄(age)。
2018年3月4日
其他

R语言笔记4:向量化运算

分享零基础生信小菜鸟日常学习笔记。欢迎批评,交流和鼓励~O(∩_∩)O
2018年3月3日
其他

R语言笔记3:提取R对象的子集

[:“双方括号”仅可用于提取单一元素,并且用来提取列表或者数据框中的元素,但是,由于列表或者数据框中的元素类别不唯一,因此它返回对象的类型不一定是列表或者数据框
2018年3月2日
其他

R语言笔记2:读写数据所需的主要函数、与外部环境交互

传递dump参数,包含对象的名字,以及另一个文件名,即将这些对象储存在这个文件中
2018年3月1日
其他

ggplot2笔记1:认识ggplot2

坐标系(Coordinate,缩写是coord)主要控制坐标轴和网格线,描述的是数据如何映射到图形所在平面。通常使用笛卡尔坐标系
2018年3月1日