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CUT&Tag 数据处理与分析教程 七：差异分析
https://academic.oup.com/nar/article/43/7/e47/2414268[3]2012-Differential
2020年9月29日
狮山生信
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CUT&Tag 数据处理与分析教程 六：数据可视化
$projPath/peakCalling/SEACR/${histName}_${repName}_seacr_control.peaks.summitRegion.bed
2020年9月29日
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CUT&Tag 数据处理与分析教程 五：Peak calling
命令==##seacr="/fh/fast/gottardo_r/yezheng_working/Software/SEACR/SEACR_1.3.sh"histControl=$2mkdir
2020年9月28日
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CUT&Tag 数据处理与分析教程 四：Spike-in 对 CUT&Tag 数据的校正 对数据的校正
>$projPath/alignment/bed/${histName}_bowtie2.fragments.bed评估重复性为了研究重复之间和不同条件下的可重复性，基因组被分成
2020年9月20日
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CUT&Tag 数据处理与分析教程 三：BAM 文件统计（CUT&Tag 不建议去重不去重不去重）
\METRICS_FILE=$projPath/alignment/removeDuplicate/picard_summary/${histName}_picard.dupMark.txt##
2020年9月12日
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CUT&Tag 数据处理与分析教程 二：质控（不需要修剪 reads！不需要修剪 reads！不需要修剪reads！）和数据比对
$projPath/alignment/sam/bowtie2_summary/${histName}_bowtie2_spikeIn.txtseqDepthDouble=`samtools
2020年8月29日
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CUT&Tag 数据处理与分析教程 一（官方手把手教学）
==##projPath="/path/to/project/where/data/and/results/are/saved"H3K27me3：SH_Hs_K27m3_NX_0918
2020年8月23日