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国家税务总局厦门市税务局12366纳税缴费服务热线（以下简称“厦门12366热线”）数据显示，近期研发费用加计扣除优惠的咨询，占企业所得税类咨询总数的16%。其中，第三季度未申报研发费用加计扣除如何处理的咨询量尤为突出。
现行政策规定，自2021年1月1日起，企业预缴申报当年第三季度（按季预缴）或9月份（按月预缴）企业所得税时，可以自行选择就当年前三季度研发费用享受加计扣除优惠政策，采取“自行判别、申报享受、相关资料留存备查”办理方式。
10月，不少企业会选择在预缴申报第三季度或9月份企业所得税时，提前享受研发费用加计扣除政策红利。实务中，部分企业因未关注重要节点，忘记在10月申报期内享受研发费用加计扣除优惠。因此，这部分纳税人致电厦门12366热线，咨询第三季度未申报研发费用加计扣除该怎么办。在预缴阶段是否享受加计扣除优惠，是纳税人可以自行选择的权利。纳税人可以根据实际情况选择享受优惠的时点——在第三季度预缴时享受前三季度研发费用的加计扣除，或在次年办理汇算清缴时享受全年研发费用的加计扣除。也就是说，符合条件的企业如果未在第三季度预缴申报时，选择享受研发费用加计扣除优惠政策，可在次年办理汇算清缴时一并享受。此外，纳税人应注意，在办理第三季度或9月份预缴申报时，如未选择享受研发费用加计扣除优惠政策，不能在办理第4季度预缴申报或10月—12月预缴申报时追补享受，只能在次年办理汇算清缴时享受。厘清预缴申报的重要节点后，企业如需要在预缴时享受研发费用加计扣除优惠，可在工作日志上设置提醒，在明年预缴申报第三季度或9月份企业所得税时，选择享受研发费用加计扣除优惠。笔者提醒，在预缴阶段享受研发费用加计扣除优惠，应满足申报要求。
具体操作上，根据《国家税务总局关于发布〈中华人民共和国企业所得税月（季）度预缴纳税申报表（A类）〉的公告》（国家税务总局公告2021年第3号）和《国家税务总局关于企业预缴申报享受研发费用加计扣除优惠政策有关事项的公告》（国家税务总局公告2022年第10号，以下简称“10号公告”），企业在预缴申报第三季度或9月份企业所得税时，应在《中华人民共和国企业所得税月（季）度预缴纳税申报表（A类）》（A200000）第7行“免税收入、减计收入、加计扣除”的下级行次填写优惠事项名称和金额。其中，优惠事项名称应依照《企业所得税申报事项目录》所列事项填写。纳税人如果通过电子税务局申报，可从下拉菜单中直接选择。金额应填写税收规定允许加计扣除的金额，并与《研发费用加计扣除优惠明细表》（A107012）保持一致。举例来说，A公司是一家会计核算健全并能够准确归集研发费用的制造业企业，假设2023年开展自主研发项目1个（未形成无形资产），截至2023年第三季度发生：人员人工费用共计5万元；研发活动直接消耗的材料、燃料和动力费用共计22万元；用于研发活动的仪器、设备的折旧费共计9万元；无形资产的摊销费用共计6万元；新产品设计费、新工艺规程制定费共计21万元；其他相关费用10万元。根据《财政部 国家税务总局 科技部关于完善研究开发费用税前加计扣除政策的通知》（财税〔2015〕119号），A公司的其他相关费用扣除限额=全部研发项目的人员人工等五项费用之和×10%÷（1-10%）=（5+22+9+6+21）×10%÷（1-10%）=7（万元）。A公司2022年前三季度的“其他相关费用”实际发生数10万元，大于7万元的限额，应按限额计算税前加计扣除额。即A公司2023年前三季度可享受研发费用加计扣除的金额为5+22+9+6+21+7=70（万元）。2023年10月初，A公司在2023年第三季度企业所得税预缴申报时，应在《中华人民共和国企业所得税月（季）度预缴纳税申报表（A类）》（A200000）第7行“免税收入、减计收入、加计扣除”下，第7.1行填写前三季度研发费用加计扣除金额700000。此外，A公司应根据《国家税务总局关于发布修订后的〈企业所得税优惠政策事项办理办法〉的公告》（国家税务总局公告2018年第23号）规定，留存下列资料以备检查，包括：自主、委托、合作研究开发项目计划书和企业有关部门关于自主、委托、合作研究开发项目立项的决议文件；经科技行政主管部门登记的委托、合作研究开发项目的合同；“研发支出”辅助账及汇总表等。取得科技部门发放的入库登记编码的企业，属于科技型中小企业。根据《科技部 国家税务总局关于做好科技型中小企业评价工作有关事项的通知》（国科发火〔2018〕11号），科技型中小企业一般在6月30日前取得当年度的入库登记号码。据此，在第三季度或9月份预缴企业所得税时，相关主体尚未取得下一年度的入库登记编号，无法判断其是否属于科技型中小企业，进而无法判断能否享受研发费用加计扣除优惠。
为使科技型中小企业及时享受到优惠，10号公告明确，企业在10月份预缴申报时，自行判断本年度符合科技型中小企业条件的，可以选择暂按规定享受科技型中小企业研发费用100%加计扣除政策。年度汇算清缴时，再根据取得入库登记编号的情况，确认能否享受科技型中小企业研发费用加计扣除政策。笔者提醒，科技型中小企业应在每年5月31日前，及时向科技部门提交科技型中小企业自评信息，以便在汇算清缴结束前取得科技型中小企业的入库登记编号，及时、合规享受研发费用加计扣除优惠。版权说明本文来源：国家税务总局厦门市税务局纳税服务和宣传中心，关注【明税】订阅更多内容。