新格元家族再添新品 || 新格元全长TCR解决方案
缘起 · 背景
近代免疫学已经超越了仅仅抗感染的范畴,免疫一词也更多地被定义为对抗原性异物的识别和清除。人类的免疫系统可以在不同的外界刺激下触发“特异性“免疫反应,保护我们的身体免受外来抗原的侵害。其中,T淋巴细胞在我们的免疫系统中起到重要作用,而T细胞(抗原)受体(T cell receptor ,TCR)是位于T细胞表面的一种异二聚体蛋白,是T细胞表面特异性识别抗原和介导免疫应答的分子。
由于细胞发育过程中TCR存在复杂的V(D)J重排机制,导致TCR基因序列多样性极为丰富,是人类基因组中多态性最高的区域之一。在单细胞水平同时检测转录组基因表达和TCR多样性,不但可以了解TCR克隆型,还可以联合转录组数据深入挖掘生命机理,为免疫组学研究提供更高效的平台,进而在肿瘤微环境、感染性疾病、自身免疫疾病等研究领域拥有广泛的应用前景。
成环 · 技术原理
新格元单细胞全长TCR测序是一个提供基于灵活高效的Singleron单细胞技术的专业技术支持和服务的平台。利用GEXSCOPE®微流控芯片分离单细胞,将数百万个携带独特细胞标签(Cell Barcode)的Barcoding Beads加入到芯片微孔中,通过捕获 mRNA 上的 poly(A)尾区域,对细胞进行标记以及对mRNA进行定量。在通过收集芯片微孔中的Barcoding Beads ,将Barcoding Beads捕获的mRNA反转录为cDNA并扩增。
接下来将获得的cDNA分成两份,第一份cDNA经过片段化、连接接头等步骤后构建适用于 illumina 测序平台的测序文库,获得3'单细胞转录组文库。
另一部分cDNA先进行环化处理,然后进行反向PCR,将环化的cDNA序列线性化的同时,将CDR序列中最为重要的V(D)J序列进行方向转化。这一转化巧妙地将本来位于cDNA3'端的V(D)J序列转化到cDNA的5'端,后续再对全长的V(D)J序列进行两轮富集,再将产物经过片段化、连接接头等步骤构建适用于illumina测序平台的测序文库,最终获得全长的TCR测序文库。
傲娇 · 技术优势
2020年3月30日,国际奥委会、东京奥组委、日本政府联合宣布,受新冠肺炎疫情影响被迫推迟的2020东京奥运会于2021年7月23日至8月8日举行 。2021年7月21日,2032年夏季奥运会主办城市为澳大利亚布里斯班 。
01
高通量
基于Singleron单细胞平台单通道可实现最多30000+个细胞的免疫组库多样性检测
02
信息全面、高分辨率
可获得单个细胞免疫组库信息和3'端基因表达信息
03
捕获效率高
基于3'端Ploy A的捕获较5'端有更高的捕获效率,不仅可高效获得配对的T细胞的α链和β链信息,而且与单细胞转录组匹配率更高
04
经验丰富
已累计超350余种组织类型、8000多万个单细胞测序经验
05
强大的生信分析
全方位展示免疫组特征、实现单细胞免疫组库和基因表达联合分析,提供多样化的个性化分析内容
有用·应用方向
单细胞水平的全长TCR信息的获得,进一步扩展了免疫受体研究的范围,使得免疫学家可以高通量、多维度的视角来研究免疫分子、免疫细胞、免疫器官。
肿瘤免疫方向
肿瘤细胞具有免疫原性,会引起T淋巴细胞的浸润,而免疫治疗的疗效与淋巴细胞的浸润有着密切的关系。单细胞免疫组库测序可揭示浸润T细胞的克隆多样性,发现起关键免疫作用的T细胞亚型,捕捉免疫微环境的变化,寻找免疫治疗的靶点,从而提高免疫治疗疗效。
在移植和免疫重建上的应用
器官或者骨髓移植时,经常会伴随着宿主排斥反应的发生,从而发生慢性移植抗宿主病。单细胞免疫组库测序技术可以检测移植后T细胞库,根据T细胞的克隆增殖情况,发现承担主要免疫作用的T细胞亚型,也可进一步识别移植后感染或者复发的高危人群。
在自身免疫性疾病和感染相关疾病中的应用
自身免疫免疫性疾病是由于机体对自身抗原发生免疫反应而导致自身组织损害所引起的疾病。因此,利用免疫组库技术可根据T细胞的克隆增殖情况,发现异常的T细胞,不仅可以探索免疫系统在自身免疫中的机制,也可挖掘新的优于现有标准临床诊断的标志物,从而为疾病的诊疗提供依据。
在其他方面的应用
在一些感染性疾病中可根据T细胞的克隆增殖,找到起关键作用的T细胞亚群。在免疫治疗疗效的评估中,可对用药前后的外周血样本进行评估,确认药物是否激活T细胞发生免疫反应及其功效。
新格元全长TCR测序分析服务已经全面开启,欢迎与我们的当地销售或技术支持联系,我们将第一时间与您取得联系,全面为您的全长TCR测序保驾护航,联系电话见文章末尾。
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新格元秉持“格物致知,识微通元”的创新性理念,致力于发展简便可靠的单细胞组学技术,使之成为新一代细胞病理及血液检测手段,让单细胞组学以传统方法无法比拟的精确度、灵敏度和分辨率服务于精准医疗和健康管理等领域。
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