光刺激下miRNA对土豆次级代谢的影响如何？| 用户文章

亲耐的们，由于小编的疏忽，昨天的微信稿《光刺激下miRNA对土豆次级代谢的影响如何？| 用户文章》中，甘肃农业大学张金文老师，误写成孙金文老师，请张金文老师及课题组成员谅解。特此将原稿删除，重新发布，求原谅

1

研究背景

光是影响土豆代谢途径和刺激其产生次生代谢物的一个重大的环境因素。光诱导马铃薯引发的代谢途径和生理功能的自适应改变，在一定程度上反应了基因表达的变化。土豆转录水平上的次生代谢途径一直受到广泛的研究，但microRNA（miRNA）转录后调控机制的研究却少之又少。

2

研究目的

甘肃农业大学张金文课题组，运用miRNA测序、转录组测序技术，研究土豆经红光照射后叶片和块茎中miRNA及其靶基因表达情况，并通过实时定量RT-PCR技术，探究miRNA在次生代谢中的调控作用。

3

研究结果

小RNA文库结果表示，叶片中共发现有31个差异表达miRNA，块茎中有48个差异表达miRNA。

转录组测序结果表明，红光刺激下，土豆叶片中有1353个基因上调表达，1595个基因下调表达；块茎中有1841个基因上调表达，897个基因下调表达。

富集分析显示，土豆叶片和块茎中，与MVA通路、生物碱类、苯基丙烷、黄酮类化合物和类胡萝卜素代谢相关的基因显著上调表达，而与CHO新陈代谢相关的基因表达受到抑制。

图 光刺激下马铃薯叶和块茎中的初级和次级代谢途径

miRNA及其靶基因研究结果显示，光响应miRNA在生物碱代谢，UMP salvage，脂类的生物合成和纤维素分解代谢中发挥重要的调控作用。

此外，一些miRNA可能通过茉莉酸信号传导途径，尿苷二磷酸葡糖生物合成和羟基化反应，参与糖苷生物碱代谢调控。

4

研究意义

这项研究提供了土豆应对光刺激的较全面的miRNA及其靶基因表达谱。结果表明，miRNA在次生代谢途径，尤其是在糖苷生物碱的生物合成中可能发挥重要的作用。

5

用户文章

Qiao Y,et al.(2016)Integrated RNA‑seq and sRNA‑seq analysis reveals miRNA effects on secondary metabolism in Solanum tuberosum L.Mol Genet Genomics.doi:10.1007/s00438-016-1253-5.

本文的miRNA测序、转录组测序由联川生物协助完成

回复“转录组测序”，查看联川最新转录组测序文章。

回复“小RNA测序”，查看联川最新小RNA测序文章。

需要文章的小伙伴，欢迎回复文章题目至公众号，并留下您的邮箱，向小编免费索要哦~

等等，还没完哦~前天的微信问卷大家有去填过么，100元的话费在等着你哟~再次告知一下参与方式哦，没办法，谁让小编这么主动呢~

参与方式：

关注“联川生物”微信公众号，回复“问卷”，点击弹出的问卷链接，填写完毕提交。

1.我们将从提交的有效问卷中抽取幸运星，获100元话费，共3名；

2.在原微信稿（这里有话费，速来填问卷~）底部“写留言”(结尾右下角)处，留言集赞，从点赞数最多的前20名小伙伴中选取10位，各获30元话费。