你可能最需要的箱形图绘制技巧 | 分析技能
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做完高通量测序,需要对每批样本中所有基因表达量(如fpkm、rpkm或TPM值)进行统计,一般我们选择使用箱形图来进行作图。很多小伙伴不会用R语言怎么办?其实用Origin就可以做出想要的箱形图了。对,没有错,又是神奇的Origin!废话不多说,直接进入正题。
1第一步,输入需要作图的数据
这里我们选取了4个测序样本的fpkm值作为示范数据,如下图所示:
2第二步,调试每个样本的四列数据中的标题等属性
双击Y列的四个title改成S1到S4如下图所示:
3第三步,选中数据后做出箱形图的雏形
选中四列数据后,点击Plot -> Statistics -> Box Chart如下所示:
4第四步,修改Y轴的各项指标
双击Y轴后,出现了对话框,我们先对Scale一栏进行修改。From和To修改的是Y轴的最高值和最低值是多少,Type指的是Y轴的刻度是直接按照数字大小还是按照Log10的刻度走,这里我们选择的是Log10,具体操作如下。
完成图如下:
5第五步,对箱形图本身进行美化
选择右边的“Group”选项卡,在编辑模式”Edit mode”中,有两个选项,默认为Dependent模式,表示对所有的箱形图进行编辑。因为我们要对每个箱形图进行不同的编辑,所以在这里我们选择独立Independent编辑模式,如下图所示:
6第六步,颜色文字比例坐标轴等细节调整
接下来我们会对标签,颜色,柱子的大小比例等作出调整,这些内容已经在上次的教程中讲述,小编就不再赘述了,这是最后的效果图:
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