散点图的正确打开方式 | 分析技能

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还记得前几期我们的分析技能小教程吗？还记得那一期不一样的散点图吗？当时我们说一般Excel做出来的散点图并不是那么美丽。当然，那是一般的Excel，今天小编忍痛大放送，大神级别的Excel高级作图秘籍免费传授，教你如何用Excel做出美美哒的散点图~

首先，我们来复习一下什么是散点图，它是用来评价测序的两个样本或者两组数据之间的差异性和一致性，从图中我们可以看出基因的差异表达情况及样本相关性关系。怎么样，散点图是不是很厉害？

接下来，就是画散点图的正确方式啦~小编在这里举个例子来演示一下~

第一步：打开做图所需文件

打开summary文件夹中的3_2_transcript_differential_expression，进入样本组合文件夹*VS*，打开Gene_differential_expression。

第二步：将样本中的数据拷贝到Excel中

.将样本的fpkm,regulation,significant四列数据拷贝到新excel中，如下：

得到一个新的excel，如下：

第三步：对样本fpkm值进行归一化

对样本fpkm值进行归一化，即分别取log10(fpkm+1)，具体操作如下：在E列第2行内写入公式=LOG10（A2+1），敲击enter键，就会得到结果，然后将鼠标置于该单元格的右下角，双击左键，下面的单元格会自动填充，其中A2代表第A列第2行。

第四步：筛选数据

接下来就是对数据进行筛选了，将significant一列的数据按yes，no进行筛选，如下：

先将significant一列为no的数据筛选出来将【yes】前的√去掉：

这时，C-F列的数据就是significant一列为no的数据了，将C-F列复制到H-K列，如下：

然后，将significant一列为yes的数据筛选出来，并将C-F列复制到M-P列，如下：

接下来，我们需要将significant一列为yes的数据按上调和下调筛选出来，即对M列按up和down筛选，方法类似上面，如下：

先筛选down的数据并将M-P列数据复制到R-U列，再筛选up的数据并将M-P列数据复制到W-Z列，然后再将M-P列数据删除，得到如下数据：

第五步：做图

以上是数据的筛选过程，接下来就是做图过程了：

选中E、F两列数据，点击【插入】，点击【散点图】，如下：

初步生成了下面这张图：

第六步：图片修整

下面便是图片修整的过程了：

接下来我们首先查看significant为no的数据的行数，所以无显著差异的数据行数为2-129635行

用同样的方法查看表达量下调的数据，为2-530行

表达量上调的数据为2-710行

然后，鼠标右键单击图中点，会出现如下对话框

点击【选择数据】，出现如下对话框：

单击【添加】，编辑【系列名称】-【x轴系列值】-【y轴系列值】，如下所示为无差异显著的数据系列：

采用相似的方法添加下调和上调的数据，如下：

单击确定后，出现如下对话框：

然后将第一行数据【log10(N_fpkm+1)】前的√去掉，变成如下所示:

单击确定，生成如下图片：

接下来调整点的大小，选中散点，单击右键，再选择【设置数据点格式】，如下：

此时右边会弹出如下对话框：

选择【填充与线条】-【标记】-【数据标记选项】-【内置】，即可修改点的大小，选择【填充与线条】-【标记】-【边框】-【颜色】即可修改点的颜色，如下：

接下来对坐标轴和图例等进行修改，单击【设计】-【添加图标元素】就可以编辑坐标轴标题和图例了：

 图例的位置可以根据需要放置在不同位置，图例和轴标题设置好后，出现下图：

我们还可以给图片添加网格线，使图片视觉效果更好，单击【设计】-【添加图标元素】-【网格线】如下：

最后生成图片：

这周我们的分析技能小课堂就结束啦~想知道更多分析技能小文章吗？想了解更多详情吗？长按下方二维码，回复“分析技能”，马上获取常用数据分析技能。

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