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miRNA在大豆感染SMV病毒中的作用 | 用户文章

2017-08-15 联川生物

题目:Downregulation of genes coding for core RNAicomponents and disease resistance proteins via corresponding microRNAs might becorrelated with successful SMV infection in soybean


1.研究背景

植物通过几种不同的防御机制保护自己免受病毒感染。RNA干扰(RNAi)是一个突出的抗病毒机制,需要AGO(Argonaute)和Dicer/ DCL(Dicer-like)蛋白的参与。效应物触发免疫(ETI)是由抗性(R)基因介导的抗病毒机制,其中大部分编码NBS-LRR家族蛋白。microRNAs(miRNAs)在植物中发挥着非常重要的调节作用,包括调节宿主防御机制等。

 

2.研究方法

SMV(大豆花叶病毒)是大豆中最常见的病毒,本研究利用miRNA芯片技术分析并鉴定了SMV易感大豆品系中数十种SMV响应的miRNA,并通过后续qRT-PCR及Northern blot验证。

取材:SMV易感大豆三叶期叶片接种SMV,每隔三天取样(共取样5次),设置两个生物学重复

 

3.研究结果

芯片检测SMV感染组与对照组,共检测到44个差异表达miRNAs,其中上调29个,下调15个。在上调的miRNAs中,miR168a,miR403a,miR162b和miR1515a可能调控AGO1,AGO2,DCL1和DCL2的表达;miR1507a,miR1507c和miR482a可能调控几种NBS-LRR家族疾病抗性基因的表达。通过瞬时表达测定和RLM-RACE实验验证了这7种miRNAs对其靶基因表达的调控作用。SMV感染后不同时间点,AGO1,DCL1,DCL2和5个NBS-LRR家族基因的转录水平被抑制,而相对应的miRNA水平上调。通过STTM技术抑制miR1507a,miR1507c,miR482a,miR168a和miR1515a活性,可减缓SMV感染效率。

图 miRNA芯片鉴定分析SMV响应的miRNA


4.研究结论

本研究结果表明,通过诱导其相对应的miRNA的积累,SMV可以通过下调几种RNAi通路基因和NBS-LRR家族抗性基因来阻碍大豆防御反应。

 

5.参考文献

Bao Duran,et al.(2017)Downregulationof genes coding for core RNAi components and disease resistance proteins viacorresponding microRNAs might be correlated with successful SMV infection insoybean.Molecular Plant Pathology.doi: 10.1111/mpp.12581


本研究中的miRNA芯片由联川生物提供

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