BSA（集团分离分析法）简介 | BSA专题

今天开始，小编将定期为大家讲解BSA（Bulked Segregant Analysis，集团分离分析法）相关知识，包括BSA简介，分子标记技术，质量、数量性状和作图群体，基因、QTL定位，BSA性状定位研究思路及常见问题及解答等，每天5分钟，轻松学习BSA相关知识~

话不多说，进入今天的专题——BSA简介。

集团分离分析法（bulked segregant analysis，BSA）是1991年由R. W. MICHELMORE在莴苣上首次应用的一种快速定位控制目标性状基因的方法。方法是取F2群体中具有极端表型的12~14个单株，等量pooling其DNA形成两个DNA池，然后在亲本和两个池之间进行标记多态筛选，如果某个标记在亲本和池之间具有一致的多态，则该标记很可能和性状连锁，通过F2群体对这些筛选到的多态标记进行基因型分析，即可完成对目标基因的定位，而不需要对每个标记都在群体里进行基因型分析。原理是由于与性状连锁的标记会在两个池间表现出多态性，而与目标基因距离较远或不连锁的标记会在两个池间表现出随机的杂合型。这种方法可较快的得到与性状连锁的分子标记。一般用于质量性状基因或由少数（2-3个）主效QTL控制的数量性状位点的定位。

传统BSA法通常是利用目标物种中已发表的遗传图谱中的SSR标记进行全基因组范围的多态筛选，基因组大物种常常需要筛选数百个标记，耗时耗力，而且有时SSR标记在基因组中由于分布不均，某些区域会筛选中遗漏。相比于SSR标记，SNP在基因组的密度和分布都要更大和更广，高通量测序是在全基因组范围内鉴定SNP最为高效的手段。BSA-seq的基本思路，通常是指从作图群体中挑选极端个体，然后等量混合样本构成两个DNA池，对亲本和池进行高通量测序，鉴定在亲本和两个池中共有的SNPs，计算两个混合DNA池中相同变异位点的基因型频率及其差值，以差值来体现标记在池间的多态性，从而实现候选基因的定位。

BSA分析的遗传基础

BSA-seq技术流程

参考文献

1.Michelmore R W, Paran I, Kesseli R V. Identification of markers linked to disease-resistance genes by bulked segregant analysis: a rapid method to detect markers in specific genomic regions by using segregating populations. Proceedings of the national academy of sciences, 1991, 88(21): 9828-9832.

2.Singh V K, Khan A W, Saxena R K, et al. Next‐generation sequencing for identification of candidate genes for Fusarium wilt and sterility mosaic disease in pigeonpea (Cajanus cajan). Plant biotechnology journal, 2016, 14(5): 1183-1194.

今天的内容分享完啦，大家记得收藏好慢慢学习哦~

扩展阅读推荐