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4种检测正在翻译的mRNA的方法 | 翻译组
马上要周末了，我们说些不烧脑的。来说说在翻译组学研究领域的大牛课题组——The Ingolia Lab。
图1 The Ingolia Lab, University of California, Berkeley[1]
左一即为带头大哥Nicholas T. Ingolia，2006年博士毕业于哈佛大学
这位Ingolia NT兄在翻译组学研究领域有多牛，大家往下看。从2009到现在，共发表翻译组相关文章46篇，其中29篇分数在10分以上，这其中15篇发表在CNS上（标颜色的都是分数10分以上的）；共发表4篇综述，其中1篇发表在Cell（PMID:27015305），1篇发表在NatRev Genet（PMID:24468696）。以后会为大家解读这位大牛的代表性研究，找到翻译组的研究招式（跟着大牛做，感觉自己也变牛了呢）
Ingolia NT的实验室一直聚焦在基因的翻译调控研究。他认为，mRNA翻译成蛋白质是基因表达的核心步骤，翻译影响蛋白质水平与转录一样多。翻译调控存在于从细胞应激反应到突触可塑性这些不同的过程中。然而，目前对翻译调控的认识还存在很多空白。
研究翻译调控的第一步就是更精确地测量它。为此，Ingolia NT开发出了目前被广泛使用的Ribosome Profiling（Ribo-seq），可以精确定量分析全基因组范围的体内翻译过程（图2）[2]。Ribosome Profiling是在翻译水平上测定表达，打开了研究体内翻译的新窗口。它还报告了翻译中的核糖体的确切位置。这使得研究者能够在复杂的基因组和转录组中注释实际的蛋白质编码序列（这些是怎么做到的，以后都会给大家详细说明）。
图2 Ribosome Profiling实验流程
Ingolia NT课题组正在关注以下问题（你也在关注这些问题吗？）：
mRNA的潜在起始位点是如何影响其翻译的。
在启动过程中蛋白质的变化是如何与这些不同的位点相互作用。
当细胞改变起始密码子用法，会带来什么影响。
下一期我们来说说翻译组的一些重要概念。
参考文献
1. http://www.ingolia-lab.org/index.html
2. Ingolia NT, Ghaemmaghami S, Newman JR, et al. Genome-wide analysis in vivo of translation with nucleotide resolution using ribosome profling. Science, 2009, 324(5924): 218-223.