联川生物运营部举办第一届“学术分享PK大赛
2019年7月1日下午2点半,运营部第一届“学术分享PK大赛”在公司大会议室拉开帷幕。
为了提升运营部整体的分享交流氛围,同时也提高所有成员的知识水平和解决问题的能力,运营部以各个小组作为单位组织了学术分享PK大赛,重测序线、转录组线、微生物线、miRNA线以及生信研发团队各派出一位主讲人以文献分享的形式参与PK。miRNA线的薛立同学主持了本届PK大赛,运营总监方超担纲比赛的主评委,项目管理部朱琳达担任外部评审,其他评委由各组组长担任。
首先进行分享的是重测序线的韩斐然,学术分享的题目是《基于K-mer的Y染色体序列识别》,为我们介绍了数种以K-mer分析为基础的识别Y染色体序列的算法,包括直接通过特异K-mer识别Y染色体reads之后进行组装以及通过K-mer特征识别Y染色体scaffold的方法,以及获得Y染色体序列之后可以进行的后续分析。
随后开始分享的是微生物线的蒋婷婷,她的分享以《细菌重测序》为题,详细地为我们介绍了细菌重测序的基本思路和技术方法,以及比对参考基因组和从头组装两种典型的分析方法。在介绍完总体的研究思路和方法之后,蒋工还分享了两篇经典的研究文献,分别利用重测序手段对结核杆菌和肠杆菌进行了研究,并对细菌的进化关系以及毒力和耐药相关基因进行了细致的研究,为类似的研究提供了非常可靠的案例。
转录组线的李浩为我们带来的分享是《RIG-I自识别一种诱导型lncRNA反馈抑制天然免疫应答》,这是一篇关于天然免疫如何高效、适度应答以及适时终止的非常系统的机制研究论文,围绕着视黄酸诱导基因蛋白(RIG-I)进行了详尽的功能研究。学霸浩哥为我们详细地介绍了研究的成果,研究证明了RIG-I可以识别诱导产生的自身lncRNA,lncRNA lnc-Lsm3b与病毒RNA竞争结合但稳定非活性RIG-I,lnc-Lsm3b的结构基序对其与RIG-I蛋白的最佳结合至关重要,并且lnc-Lsm3b可以作为RIG-I的诱饵、阻止下游信号,极大地扩展了lncRNA在免疫和炎症中的功能研究。
生信研发团队的吕枫烨围绕着即将在联川生物云平台上线的16s数据分析从基本算法层面进行了内容分享,详细地介绍了16s测序过程中由于各种因素产生的数据分布的误差,并且介绍了在OTU聚类过程中会出现的高维问题、数据过于离散问题、零膨胀问题以及相对应的算法模型层面的解决对策。在核心算法上的学习与积累将会为联川云平台提供坚实的基础。
最后压轴登台分享的是miRNA线的蒋建国,题目是《miRNA-34a介导Per1高表达减少胆管癌细胞生长》。小蒋哥从生物体的节律现象出发,为我们介绍了各种生物机制,尤其是重要的Per1分子随着节律发生周期变化的现象,并且从一篇重要的miRNA研究文献切入,详细地介绍了miRNA-34a如何通过介导Per1这个重要的节律相关分子高表达,来移植肿瘤细胞的生长,为抗肿瘤研究提供了新的思路。
精彩的学术分享持续了近三个小时,丰富多彩的研究内容征服了所有听众,掌声经久不息。在所有的学术分享结束后,通过统计评委打分,学霸李浩最终从一众强劲的竞争对手中脱颖而出,夺得首届学术分享PK赛实至名归的冠军。主评委超哥为冠军颁发了奖品和奖状,实在是羡煞旁人呀!
大家参与学术分享活动的热情充分展示了运营部良好的学习氛围和积极进步的态度,但是仍需百尺竿头更进一步,作为公司可靠的技术力量继续努力。相信下一届学术分享PK赛会同样精彩纷呈、干货满满!
相关阅读
联川培训 | 记2019年第五期新员工培训——六月,我们毕业啦
联川培训 | 记2019年第三期新员工培训——表白认真学习的你们