小姐姐教你下载史上最全信号通路基因列表 | 生信快闪

最近我们推出了一系列小姐姐专题微信稿，在后台收获了很多留言。在开始今天的专题之前我们先来介绍我们的小姐姐——吕枫烨同学。

她于2016年加入联川生物，从事生物信息分析工作已经超过3年，目前是联川生物云平台的负责人之一。擅长R语言和各种统计做图分析。日常工作除了搭建云平台和售后外，还是R语言培训的主力讲师之一，编写各种教材和培训材料有几万字。你们现在拿到的结题报告里，95%的图都是用她写的代码画的，是不是很厉害呢？

今天她为大家带来的是，联川生物云平台的一项黑科技产品——各种通路和功能对应的基因列表。例如免疫、神经、肿瘤代谢等功能对应的基因列表，在联川生物云平台统统都能下载到！是不是很神奇呢？接下来话不多说，进入今天的主题吧。

分析需求

标准分析主要是通过阈值筛选基因来进行下游分析的。
但是前期，如何筛选到感兴趣的基因，实现真正的“精准打击”，需要提前准备好对应的基因列表。

这时候对于我们后台的同事，要实现精准的售后服务，需要客户提供感兴趣的基因列表来进行，但是这就需要客户前期做大量的收集工作。例如已报道的相关基因，一般需要阅读大量文献等。例如我们知道m6A甲基化需要额外重点关注一些基因列表，如METTL3、FTO、ALKBH5、YTHDF1等。

那么有没有一种好的方法不用那么辛苦，一篇一篇地阅读文献去把这些基因挑出来呢？答案当然是Yes！

大家很好奇，存储在联川生物云平台这些对应的通路和基因具体介绍是什么呢？其实我们上一期在分享GSEA的稿子时，已经给大家带来了非常详细的介绍。今天由于篇幅关系不再重复展开，具体请点击 常规分析找不到差异基因？GSEA分析了解一下 | 学习专栏 。

关键词搜索云工具地址： http://www.lc-bio.cn/overview/33?tools=MSigDB_V1.3

结果下载

结果解读

信息来源

MSigDB：http://software.broadinstitute.org/gsea/msigdb/collections.jsp

是不是很简单呢？还没注册的朋友们赶紧来注册联川生物云平台吧，具体方法请查阅 2020年又有大动作，联川生物云平台开放注册！！！。注册完毕，下载专属于自己感兴趣的基因列表。

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