查看原文
其他

SCI必备|高分文章中颜值爆表的circos图不用代码也能画|OmicStudio开挂绘图

运营部-LSH 联川生物 2022-06-07

想要展示样本的基因/物种丰度,除了可以绘制热图和柱状图外,circos图也可以实现哦,联川生物云平台可以只需要上传一张丰度表格即可轻松绘制,还有其他更多应用场景供您探索。

云平台网站:https://www.omicstudio.cn/tool/50

为了让大家能够更加更快的上手这一神器,画出颜值爆表的circos图,我们在B站还有详细的直播讲解哦!(扫描下方二维码可以观看circos图绘制视频哟~)

https://www.bilibili.com/video/BV15z4y1Q79f?from=search&seid=14044982069939523661



咱们已经在B站进行了30多场的直播了!内容丰富多彩,收获众多好评!咱们的直播有Marker基因可视化工具、细胞鉴定结果分析、单细胞tSNE图等等......8月12日(周三)晚上7:30,上B站还有联川小哥哥带你走进绘制网络图的奇妙世界!大家快来B站搜索联川生物关注我们吧~


图片展示介绍


 工具使用方法

1.打开云工具

首先打开联川生物云平台circos云工具:

https://www.omicstudio.cn/tool/50,选择cirocs绘图-丰度表类型



2.上传数据

打开工具是默认使用示例数据,如果需要使用自己的数据进行图片绘制,需要取消使用示例数据,然后点击上传文件,上传的文件必须是 xlsx 格式



示例表格格式如下,可以点击下载图标查看示例数据格式。



3.完成绘图

点击开始绘图按钮,稍等片刻即可完成图片绘制。



4.细节调整

输入表格的行和列分别对应着cirocs图的左右两侧,参数框内,可以选择分别修改左右文本的字号、方向和位置。

(1)字号调整:例如可以选择将左侧文本字号调大,然后点击开始绘图。



(2)文本方向调整:例如可以将左侧文本修改为垂直方向,点击开始绘图,条目过多时水平文本或许会出现文字遮挡,此时建议选择垂直方向。




(3)文本位置调整:例如可以将右侧文本与外圈距离调大,点击开始绘图。



输入表格的行和列分别对应着cirocs图的左右两侧,参数框内,可以选择分别修改左右的配色进行调整。

例如将左侧配色调整为红色系,右侧配色调整到绿色系,然后点击开始绘图。



可以在左侧参数框内选择是否显示图例、上下左右移动图例、及修改图例标题。



如果由于文本过长等原因出现文本超出图片边界的情况,如下图,部分文本没能完全展示,例如下图。


可以修改图片边距(上下左右),将上下边距调大,将文本完全展示。



5.图片下载

图片调整完毕后,可以点击工具右上角下载图标,选择需要的图片格式,点击图片下载即可。




下期预告

联川生物circos图工具还有另一块功能,即绘制基因组类型的circos图,一般应用于展示基因组不同位置上的突变情况,之后会重点介绍,敬请期待。



相关阅读
原来tSNE图还可以这样做?!联川花钱请大家来做高大上的生信图了!小姐姐教你基因ID转换 | 生信快闪跟着小姐姐学做热图 | 生信快闪跟着小姐姐一起学习如何做GO和KEGG基因功能富集分析 | 生信快闪

您可能也对以下帖子感兴趣

文章有问题?点此查看未经处理的缓存