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一种基于芯片合成的人源单链抗体文库构建方法 | 新研究
在此项研究中,研究人员采用一种人工合成抗体互补决定区(CDR)多样性的新型设计方法,构建和验证了一个人源单链抗体文库。该抗体文库的优势在于设计中对框架序列、氨基酸和密码子优化以及CDR多样性方面具有可控性。
通常在合成CDR序列多样性时,采用寡核苷酸随机组合的方法会产生许多非天然序列和/或非预期修饰。为了解决这些问题,研究人员设计和构建了一个新型的半合成的人类单链抗体文库,期间采用了非组合性、预先设计的CDR多样性,并在重链、kappa和lambda链的可变区域使用了天然的人抗体框架区序列。二代测序分析显示该文库包含的抗体具有与天然CDR高相似度的序列,且翻译后修饰的发生被控制到最小化。该文库可以分离到针对多种目标抗原并具有纳摩尔级别亲和力的单克隆, 这一结果验证了该文库构建策略的可行性。
这项研究结果说明通过低组合性或非组合性的人工合成CDR多样性方法来构建有功能的抗体文库是可能的,并且提供了一种新的设计抗体文库的思路,以适应具有更多要求的应用。
本项目中模拟的CDR序列是基于联川生物微流体芯片平台进行合成
致谢:研发部李璐璐博士对此项研究内容的编译
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参考文献
Bai X, Kim J, Kang S, Kim W, Shim H. (2015) A Novel Human scFv Library with Non-Combinatorial Synthetic CDR Diversity. PLoS ONE 10(10):e0141045. doi:10.1371/journal.pone.0141045