如何做环状RNA的引物设计（上）？ | 跟我学

今年以来，国内环状RNA（circRNA）的研究热潮不断升温，越来越多的circRNA如春笋般涌现出来。由于circRNA的结构特殊性，如何采用定量PCR技术对circRNA平行验证成为当下一个热点问题。今天，小编邀请技术部的刘建宁老师继续为大家实例讲解circRNA的引物设计。由于内容丰富，circRNA的引物设计将分上下两篇呈现给大家。

言归正传，我们以环状RNA数据库circbase（http://circbase.org/）中收录的hsa_circ_0063162为例，为小伙伴详细介绍从circRNA序列获取到引物设计的全过程。马上动手试试吧！

• CircRNA信息查找

1. 首先访问circbase数据库（http://circbase.org/），如下图所示。

2. 在Search上方的框中输入：hsa_circ_0063162，点击Search进行查找，查找结果如下图示。

• CircRNA序列下载

3．点击
项目下的“chr22:36889679-36889850”，操作界面会跳转至UCSC数据库，界面如下图所示。

4．点击界面左方
按钮，会打开新的界面，如下图所示。

5．点击
按钮，进入序列下载界面，如下图所示。

6．按照默认参数，点击
按钮获取序列，进入界面如下图所示。

7．将序列复制粘贴至记事本（.txt）中即获取了所需的circRNA序列信息。

小伙伴你会了吗？试试获取其他的circRNA序列吧！

明天刘老师会接着讲解如何使用Primer 5进行circRNA引物设计。

点击下方”阅读原文“，查看”如何做环状RNA的功能验证？“

还不知道环状RNA是什么？！

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