【Genome Medicine】迄今为止首个将肠道微生物数据用于类风湿性关节炎的预后研究,有望成为未来治疗的关键!
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作者:Liz Zee
导读: 过去十年的快速进步已经表明肠道微生物群的失调是类风湿性关节炎(RA)的一个重要标志。然而,肠道微生物群与RA疾病活动的临床改善之间的关系尚不清楚。这项研究的研究结果表明改变肠道微生物群以提高临床疗效将有望成为RA的一种未来治疗方法。
梅奥诊所(Mayo Clinic)个体化医学中心的一项新研究表明,RA患者在病程中是否会有所改善的一个重要指标可能在一定程度上取决于他们的肠道。
这项研究发表在《Genome Medicine》上,论文名为“Gut microbial determinants of clinically important improvement in patients with rheumatoid arthritis”。
该研究发现,通过关注寄生于胃肠道的数万亿细菌、病毒和真菌(即肠道微生物群),预测患者RA未来的病情发展是有可能的。研究结果表明,肠道微生物与RA患者的预后有关。
“这是迄今为止第一个利用肠道微生物数据预测RA临床改善状况的研究,而不是依赖于对其病情的初步检测或先前的治疗。”梅奥诊所个体化医学中心的计算生物学家、这项研究的共同资深作者Jaeyun Sung博士说。
RA是一种慢性疾病,其特征是关节炎和关节疼痛,最终会导致骨骼和软骨糜烂、关节畸形、行动能力丧失。这种复杂的疾病影响着美国近130万人。
在这项研究中,研究小组用一种称为“鸟枪法宏基因组测序”的方法对32名RA患者的粪便样本进行了全面且精确的基因组分析。经过分析,研究小组发现肠道微生物群的几个特征与RA的预后有关。
梅奥诊所的临床风湿病专家John M. Davis III,是这项研究的共同资深作者,对炎症性关节炎特别有兴趣,他说:“通过观察患者的基线肠道微生物群剖面图,我们观察到最终有好转迹象的患者和那些没有好转迹象的患者之间的微生物群特征明显不同。”
“令人惊讶的是,我们的数据表明,根据最终的临床结果,肠道微生物群不仅开始于不同的生态状态,而且生长和发育也不同。”Sung博士补充说。
接下来,通过使用深度学习人工智能(AI),研究人员检验了他们是否能够预测患者能否取得临床改善。总体上,预测结果的准确率达到90%,从而证明了肠道微生物群和人工智能技术的结合在理论上可以成为预测RA病程的手段。
Davis博士说:“随着进一步的发展,这种生物指标预后可以鉴定出那些通过特定的疗法能够及早改善病情的患者,从而使他们免于其他不太可能有效的疗法的治疗费用和治疗风险。相反,这些工具可以检测出疾病症状不太可能改善的患者,或许还可以让临床医生更密切地针对和监测他们。尽管还有很多工作要做,但我们正朝着推进我们对这种疾病的理解的正确道路前进,以便对RA患者有针对性地用药。”
一段时间以来,科学家们一直怀疑肠道微生物群在治疗RA以及许多其他炎症和自身免疫性疾病中起着一定的作用。大量的微生物有助于消化食物、调节免疫系统,防御致病细菌。
研究人员强调,每个人的微生物群都是独一无二的,由遗传、饮食和环境影响混合而成。这些差异揭示了RA患者之间症状差异很大的原因,这反而使得治疗和预测临床结果变得困难。
这项研究是Sung博士和Davis博士最近进行的第二次RA调查,强调了计算生物学家和临床医生之间在解决医学复杂问题方面的重要合作关系。目前,他们正共同开发一套新的数据驱动工具,以帮助RA的早期发现、诊断、预后和治疗。因此,研究人员计划研究将他们的发现转化为新的生物指标和疗法的方法。
“最终,我们的研究表明,改变肠道微生物群以提高临床疗效,可能有望成为未来治疗RA的方法,”Sung博士说。“这可能会彻底改变我们对患者的护理方法。”
参考资料:
https://genomemedicine.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13073-021-00957-0
注:本文旨在介绍医学研究进展,不能作为治疗方案参考。如需获得健康指导,请至正规医院就诊。
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