领先一代,硕果累累,国内首个4D蛋白组平台奇迹一周年,“后浪”强势养成
本文由景杰学术团队原创解读
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又是一年红五月!在这个特别的5月,国内首个“4D蛋白质组学平台”迎来了创立一周年的纪念日。
在2019年5月,首批4D蛋白质组学质谱仪TimsTOF Pro入驻景杰生物并开展样本分析工作,受到领域内学者与同行的广泛关注。在过去的一年间,依托于“4D蛋白质组学平台”,全新一代的4D蛋白质组学技术得到了快速发展和应用,已完成超过5000个样本的定量分析,陆续开发推出的4D修饰蛋白质组学、4D-DIA等技术,也一次又一次刷新蛋白质组学分析的极限。
那么,相比传统蛋白质组学,4D蛋白质组学这个“后浪”到底有多牛?
领先一代
经历了数十年的发展,蛋白质组学技术从二维凝胶电泳,到基于质谱的蛋白质组学,取得了长足的进步。2018年底,离子淌度分离概念的引入使得蛋白质组学进入了4D新时代。
4D蛋白质组学是在传统3D分离即保留时间(retention time)、质荷比(m/z)、离子强度(intensity)这三个维度的基础之上增加了第四个维度--离子淌度(mobility)的分离,进而大幅度的提高扫描速度和检测灵敏度,带来蛋白质组学在鉴定深度、检测周期、定量准确性等性能的全面提升。其中新引入的离子淌度,主要是根据分子的形状和截面进行分离,能够有效降低“混合谱图”的比例。
“4D蛋白质组学”,自2018年横空出世便备受瞩目。2019年,曾因卓越的性能荣膺EuPA年度最佳技术奖(欧洲蛋白质组学协会),也是2019年ASMS(美国质谱年会)上最受关注的新技术。
▲ 4D蛋白组平台timsTOF Pro因在超高灵敏度、高通量4D蛋白质组学研究上的杰出表现,荣膺EuPA最佳技术奖。
除了硬件上的升级,4D蛋白质组学还获得世界蛋白质组领域顶尖科学家Matthias Mann教授团队( Max Planck Institute, Martinsried)、Ruedi Aebersold教授团队(IMSB at ETH Zuerich)联袂打Call,开发新的定量技术与分析方法,全面提升蛋白质鉴定能力、检测灵敏度和数据完整性。
▲ 世界蛋白质组领域顶尖科学家Matthias Mann教授、Ruedi Aebersold教授等团队合作开发4D-DIA技术
硕果累累
2019年5月,随国际著名分析仪器制造商Bruker全球执行副总裁 Rohan A. Thakur博士的来访,蛋白质组学与修饰组学分析行业领跑者景杰生物(PTM BIO)与Bruker联合宣布:首批全球顶级质谱仪timsTOF Pro正式入住驻景杰生物,并开展样本分析工作。
▲ Bruker全球执行副总裁Rohan A. Thakur博士到访景杰生物(左三:Bruker全球执行副总裁 Rohan A. Thakur博士,左二:景杰生物CEO 程仲毅博士)
景杰生物一直致力于推动蛋白质组学技术与运用的发展,在过去的一年间,依托于“4D蛋白质组学平台”,景杰生物陆续开发推出全新4D-LFQ技术、4D修饰蛋白质组学、4D-DIA、4D-FFPE等技术,进一步突破蛋白质组学研究现有瓶颈。项目累计蛋白组鉴定平均深度>6000/sample、磷酸化平均鉴定深度>10000/sample、2-羟基异丁酰化平均鉴定深度>20000/sample,再度引领蛋白组学高精度分析,树立行业新标准。
▲ 景杰生物陆续开发推出全新4D-LFQ技术、4D修饰蛋白质组学、4D-DIA、4D-FFPE等技术,持续引领推动4D蛋白质组学的发展。
4D蛋白组学精彩内容:
重磅!Matthias Mann发文,基于捕获离子淌度的新一代4D 蛋白质组学
划时代4D-DIA技术,重新定义蛋白质组学分析极限
ASMS亮点: Matthias Mann和Reudi Aebersold组联合发布4D-LFQ新的解决方案——diaPASEF
最新进展: Jurgen Cox研究组公布支持4D label-free定量的MaxQuant软件新版本
系列专访
专访Matthias Mann教授:4D蛋白质组学在临床蛋白组学中的应用前景
专访Ruedi Aebersold 教授:视频详解新一代4D-DIA技术
专访牛津大学Roman Fischer:探索临床蛋白质组学分析的第四维度
专访马普所Jürgen Cox教授:临床蛋白组学和计算生物化学