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【国家基金委通知】基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制重大研究计划2017年度项目指南

2017-05-21 国家基金委 免疫细胞研究bioworld

本通知转自:国家基金委官网

国家自然科学基金委员会现发布“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”重大研究计划2017年度项目指南,请申请人及依托单位按项目指南中所述的要求和注意事项申报。

非编码RNA是由基因组转录产生的一类不同于mRNA的遗传信息分子。对真核细胞中非编码RNA及其基因的发掘和功能研究,有可能揭示一个由非编码RNA介导的遗传信息传递方式和表达调控网络,从不同于蛋白质编码基因的角度注释和阐明基因组的结构与功能,深入阐明生命活动的本质和规律。

  一、科学目标

  本重大研究计划以重要模式生物为对象,进行多学科相互交叉,整合多种技术和方法,发现基因信息传递过程中新的非编码RNA,研究非编码RNA的生成和代谢,及其参与重要生命活动的生物学功能,为发现新的功能分子元件及由其引发的新的生命活动规律提供关键信息。

  二、核心科学问题

  围绕基因组中非编码RNA及其基因的系统发现和功能鉴定,非编码RNA介导的基因表达调控等生命科学研究的国际前沿领域,深入系统地开展非编码RNA功能及调控机制的研究。

  三、2017年度重点资助研究方向

  本年度是本重大研究计划启动的第4年,将继续鼓励申请人围绕“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”重大研究计划中四个主要研究方向自主选题申报项目,在同行专家评审的基础上对项目进行择优支持。

  (一)发现与遗传信息传递相关的新的非编码RNA,特别是长非编码RNA及其功能;

  (二)与遗传信息传递相关的非编码RNA的生成、加工、修饰及代谢;

  (三)非编码RNA与其他重要生物分子的相互作用、网络及其结构基础;

  (四)非编码RNA研究的新方法、新技术。

  四、2017年度资助计划

  2017年度本重大研究计划拟安排资助直接费用3500万元。拟资助培育项目20项,直接费用的平均资助强度为100万元/项,资助期限为3年,申请书中研究期限应填写“2018年1月1日--2020年12月31日”;拟资助重点支持项目5项,直接费用的平均资助强度为300万元/项,资助期限为4年,申请书中研究期限应填写“2018年1月1日--2021年12月31日”。

  五、申报要求及注意事项

  (一)申请条件。

  本重大研究计划项目申请人应当具备以下条件:

  1.具有承担基础研究课题的经历;

  2.具有高级专业技术职务(职称)。

  在站博士后研究人员以及正在攻读研究生学位的人员不得申请。

  (二)限项规定。

  1.具有高级专业技术职务(职称)的人员,申请(包括申请人和主要参与者)和正在承担(包括负责人和主要参与者)以下类型项目总数合计限为3项:面上项目、重点项目、重大项目、重大研究计划项目(不包括集成项目和战略研究项目)、联合基金项目、青年科学基金项目、地区科学基金项目、优秀青年科学基金项目、国家杰出青年科学基金项目、重点国际(地区)合作研究项目、直接费用大于200万元/项的组织间国际(地区)合作研究项目(仅限作为申请人申请和作为负责人承担,作为参与者不限)、国家重大科研仪器研制项目(含承担科学仪器基础研究专款项目和国家重大科研仪器设备研制专项项目)、优秀国家重点实验室研究项目,以及资助期限超过1年的应急管理项目。

  优秀青年科学基金项目和国家杰出青年科学基金项目申请时不限项;正式接收申请到国家自然科学基金委员会作出资助与否决定之前,以及获资助后,计入限项。

  2.申请人(不含参与者)同年只能申请1项重大研究计划项目。上一年度获得重大研究计划项目资助的项目负责人(不包括集成项目和战略研究项目),本年度不得作为申请人申请重大研究计划项目。

  (三)申请注意事项。

  1.申请书报送日期为2017年6月19日至23日16时。

  2.本重大研究计划项目申请书采用在线方式撰写。对申请人具体要求如下:

  (1)申请人在填报申请书前,应当认真阅读本项目指南和《2017年度国家自然科学基金项目指南》中申请须知和限项申请规定的相关内容,不符合项目指南和相关要求的申请项目不予受理。

  (2)本重大研究计划旨在紧密围绕核心科学问题,将对多学科相关研究进行战略性的方向引导和优势整合,成为一个项目集群。申请人应根据本重大研究计划拟解决的具体科学问题和项目指南公布的拟资助研究方向,自行拟定项目名称、科学目标、研究内容、技术路线和相应的研究经费等。

  (3)申请人登录科学基金网络信息系统https://isisn.nsfc.gov.cn/(没有系统账号的申请人请向依托单位基金管理联系人申请开户),按照撰写提纲及相关要求撰写申请书。

  (4)申请书中的资助类别选择“重大研究计划”,亚类说明选择“培育项目”或“重点支持项目”,附注说明选择“基因信息传递过程中非编码RNA的调控作用机制”,根据申请的具体研究内容选择相应的申请代码。以上选择不准确或未选择的项目申请将不予受理。

  培育项目和重点支持项目的合作研究单位不得超过2个。

  (5)申请人应当按照重大研究计划申请书的撰写提纲撰写申请书,应突出有限目标和重点突破,明确对实现研究计划总体目标和解决核心科学问题的贡献。

  如果申请人已经承担与本重大研究计划相关的其他科技计划项目,应当在申请书正文的“研究基础与工作条件”部分论述申请项目与其他相关项目的区别与联系。

  (6)申请人应当认真阅读《2017年度国家自然科学基金项目指南》中预算编报须知的内容,严格按照《国家自然科学基金资助项目资金管理办法》、《关于国家自然科学基金资助项目资金管理有关问题的补充通知》(财科教〔2016〕19号)以及《国家自然科学基金项目资金预算表编制说明》的要求,认真如实编报《国家自然科学基金项目资金预算表》。

  (7)申请人完成申请书撰写后,在线提交电子申请书及附件材料,下载打印最终PDF版本申请书,并保证纸质申请书与电子版内容一致。

  (8)申请人应及时向依托单位提交签字后的纸质申请书原件以及其他特别说明要求提交的纸质材料原件等附件。

  3.依托单位应对本单位申请人所提交申请材料的真实性、完整性和合规性进行审核;对申请人申报预算的目标相关性、政策相符性和经济合理性进行审核,并在规定时间内将申请材料报送国家自然科学基金委员会。具体要求如下:

  (1)应在规定的项目申请截止日期(2017年6月23日16时)前提交本单位电子版申请书及附件材料,并统一报送经单位签字盖章后的纸质申请书原件(一式一份)及要求报送的纸质附件材料。

  (2)提交电子版申请书时,应通过信息系统逐项确认。

  (3)报送纸质申请材料时,还应包括本单位公函和申请项目清单,材料不完整的不予接收。

  (4)可将纸质申请材料直接送达或邮寄至国家自然科学基金委员会项目材料接收工作组。采用邮寄方式的,请在项目申请截止时间前(以发信邮戳日期为准)以快递方式邮寄,以免延误申请,并在信封左下角注明“重大研究计划项目申请材料”。

  4.申请书由国家自然科学基金委员会项目材料接收工作组负责接收,材料接收工作组联系方式如下:

  通讯地址:北京市海淀区双清路83号国家自然科学基金委员会项目材料接收工作组(行政楼101房间)

  邮  编:100085

  联系电话:010-62328591

  5.本重大研究计划咨询方式:

  国家自然科学基金委员会生命科学部三处

  联系电话:010-62327213

  (四)其他注意事项。

  1.为实现重大研究计划总体科学目标和多学科集成,获得资助的项目负责人应当承诺遵守相关数据和资料管理与共享的规定,项目执行过程中应关注与本重大研究计划其他项目之间的相互支撑关系。

  2.为加强项目的学术交流,促进项目群的形成和多学科交叉与集成,本重大研究计划将每年举办一次资助项目的年度学术交流会,并将不定期地组织相关领域的学术研讨会。获资助项目负责人有义务参加本重大研究计划指导专家组和管理工作组所组织的上述学术交流活动。






上海莫寅元教授 2017 lncRNA技术研讨班第二轮通知

虽然近年来 lncRNA 的研究成为生物医学领域的大热门,陆续有新的 lncRNA 序列被报道,但是绝大多数 lncRNA 的功能和作用机制仍不清楚。


本课程将结合 CRISPR/Cas9 基因编辑技术与 lncRNA 两大研究热点,分析如何使用已建立的 CRISPR/Cas9 lncRNA library 寻找疾病模型或信号通路中起关键性调控作用的 lncRNA,以及如何进一步开展后续的 lncRNA 功能和作用机制研究。


本次课程将从背景介绍、研究思路、案例分析三个方面,系统、全面并深入浅出地介绍和分析 lncRNA 的研究策略,内容涵盖实验方案设计、研究手段运用以及具体案例分析及有关 lncRNA 研究必备实验方法的操作要点。



授课对象


适合生物、医学领域的科研工作人员



讲师简介




莫寅元教授:1956 年出生杭州,1982 年毕业于浙江大学。1991 年获美国华盛顿州立大学植物病理博士学位。1992~1994 年在美国华盛顿州了大学微生物博士后研究。


曾就职于孟菲斯 St. Jude 儿童研究医院、芝加哥伊利诺州大学。参与美国 CDMRP 项目,NIH 项目和我国国家自然项目评选。


现为密西西比大学医学中心癌症研究院药理、毒理学教授,癌症项目主要负责人。主要研究 mirRNA 和长非编码 RNA 在肿瘤发生、发展中的作用及药物的抵抗。


下面列出莫教授关于LncRNA方面的研究成果:

 LncRNAs impact various aspects of tumorigenesis through regulation of gene expression. It is well known now that the human genome is actively transcribed. However, protein-coding genes account for only 2% and the rest are non-coding RNAs, including microRNAs and long non-coding RNAs. Recently, our research has extended to long non-coding RNAs (lncRNAs). We have shown that several lncRNAs are dysregulated in cancer and they impact tumor cell growth, invasion and metastasis because they can regulate gene expression through various mechanisms. For instance, Linc-RoR functions as a p53 repressor in response to DNA damage. Importantly, p53 can induce Linc-RoR and other lncRNAs such Loc285194, providing evidence that these lncRNAs are associated with the p53 pathway, serving as p53 regulators or p53 targets. Our recent study suggests that AK023948 promotes AKT activity through interaction with DHX9 and p85.

 

Citations based on Google Scholar

 

·         Liu Q, Huang J, Zhou N, Zhang Z, Zhang A, Lu Z, Wu F, Mo YY. LncRNA loc285194 is a p53-regulated tumor suppressor. Nucleic Acids Res. 2013 May 1;41(9):4976-87. 144 citations*.

·         Zhang A, Zhou N, Huang J, Liu Q, Fukuda K, Ma D, Lu Z, Bai C, Watabe K, Mo YY. The human long non-coding RNA-RoR is a p53 repressor in response to DNA damage. Cell Res. 2013 Mar;23(3):340-50. 110 citations*.

·         Zhang Z, Zhu Z, Watabe K, Zhang X, Bai C, Xu M, Wu F, Mo YY. Negative regulation of lncRNA GAS5 by miR-21. Cell Death Differ. 2013 Nov;20(11):1558-68. 109 citations*.

·         Huang J, Zhou N, Watabe K, Wu F, Xu M, Mo YY. Long non-coding RNA UCA1 promotes breast tumor growth by suppression of p27 (Kip1). Cell Death & Diseases. 2014 Jan 23. e1008. 117 citations*

·         Zhang A, Xu M, Mo YY. Role of the lncRNA-p53 regulatory network in cancer. J Mol Cell Biol. 2014 Jun;6(3):181-91.

·         Zhang A, Zhao JC, Kim J, Fong KW, Yang YA, Chakravarti D, Mo YY, Yu J. LncRNA HOTAIR Enhances the Androgen-Receptor-Mediated Transcriptional Program and Drives Castration-Resistant Prostate Cancer. Cell Rep. 2015 Oct 6;13(1):209-21

·         Huang J, Zhang A, Ho TT, Zhang Z, Zhou N, Ding X, Zhang X, Xu M, Mo YY. Linc-RoR promotes c-Myc expression through hnRNP I and AUF1. Nucleic Acids Res. 2016 Apr 20;44(7):3059-69

·         Koirala P, Huang J, Ho TT, Wu F, Ding X, Mo YY. LncRNA AK023948 is a positive regulator of AKT. Nat Commun. 2017 Feb 8;8:14422. doi: 10.1038/ncomms14422. PubMed PMID: 28176758.

 

课程概要


  • 什么是 lncRNA?


  • 如何去寻找疾病或信号通路中关键的调控性 lncRNA?


  • 如何利用 CRISPR/Cas9 lncRNA library 筛选疾病或信号通路中关键的调控性 lncRNA?


  • 如何验证筛选出的 lncRNA 的可靠性


  • 实验方案和课题设计

  • 具体案例分享




课程安排


第一天




9:00~10:20 Introduction

Discovery of lncRNAs
Characteristics of lncRNAs
Significance of lncRNAs
Classification of lncRNAs
LncRNA-mediated gene regulation
How to select lncRNAs of your interest
Database search (lncRNA targets; TCGA; and Lncipedia etc)


10:40~12:00 CRISPR/Cas9 basics

How CRISPR/Cas9 works
gRNA design (online programs)
sgRNA vs dual gRNAs
LncRNA KO, gene silencing and gene activation
Generation of KO or gene activation libraries
Rescue
Genome browser 


14:00~15:20 Screening approaches

CRISPR/Cas9-based library screening
Direct screening
Reporter assisted screening
Types of reporters
Target validation


15:40~15:10 Examples of screening


15:10~16:00 Q&A,consultation for project design



第二天上午




莫教授具体案例分享课程

第二天上午莫教授做1.5小时具体的案例分享,再安排学员们与莫教授互动交流。莫教授会给有兴趣的学员做单独指导 lncRNA 文库筛选与实验设计



上海 lncRNA 研讨班2017 年 5 月 27 日~5 月 28 日上海中兴和泰酒店会议厅(上海市浦东张江高科科苑路 866)相关介绍


主办方:医药加平台,上海遐永医药科技有限公司


酒店推荐:上海中兴和泰酒店


收费标准


1700 元每位,优惠措施:5 月 20号之前确认报名及转账的优惠 200 元,可以开正规会务发票,纸质邀请函(盖章)。 


注册费包含电子版教材、午餐等费用,但不包括住宿费和晚餐。 


3人组团参会,领队人可以免费注册!


报名方式:


长按识别下面二维码, 填写报名登记表 

电话:021-50327163

金老师:17701825941

王老师:13818765978
QQ:583940292
邮箱:m17701825941@vip.163.com


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