蛋白组学生信分析及组学整合思路【医药加网课】
实时直播
2020年4月10日(周五)19:00
医药加平台直播间
《蛋白组学生信分析及组学整合思路》
蛋白质组学(proteomics)研究是接基因组学研究后的生命科学发展的一个大方向之一。蛋白质的结构和功能最终直接影响着生命活动的变化,基因转录水平的研究只能在一定程度上反映基因表达产物的变化,而真正发挥功能的蛋白要经过转录后加工、翻译调控以及翻译后加工等许多步骤和调控才能形成,因而对蛋白质的直接研究才能真实的解释各种生命现象。
常见的蛋白组学测序由iTRAQ技术,它可以同时检测几千个蛋白的表达。有些生物医药的研究人员做了蛋白质组学数据,但是会遇到一些问题:
蛋白组学的研究方法有哪些?
iTRAQ技术蛋白质组学报告怎样解读?
怎样获得关键靶标蛋白?
蛋白质组学与转录组或基因组或代谢组如何整合?
项目类型 | 题目 | 金额 |
面上项目 | 基于转录组学和蛋白质组学研究鹿茸“健骨”功效的分子机制 | 56 |
面上项目 | 基于卵泡液蛋白质组学的痰湿型PCOS不孕中医证候学研究 | 55 |
面上项目 | 基于nano LC-MS/MS技术草酸影响猪苓菌核形成的乙酰化修饰蛋白质组学研究 | 55 |
面上项目 | 基于SILAC的分泌蛋白质组学技术研究绞股蓝总苷在治疗肝损伤进程中的作用机理 | 55 |
地区科学基金项目 | 基于iTRAQ蛋白质组学及网络药理学技术的九节抗抑郁机制研究 | 34 |
地区科学基金项目 | 基于活性肌酐探针导向的蛋白质组学系统筛选肌酐肾小管转运体 | 34 |
青年科学基金项目 | 基于代谢/蛋白质组学技术及组学间系统生物信息学交联分析探讨艾灸干预AS多靶点效应机制 | 21 |
青年科学基金项目 | 基于iTRAQ定量蛋白质组学和网络药理学探究药食同源方YH0618减少阿霉素导致脱发的分子机制研究 | 21 |
青年科学基金项目 | 基于药物蛋白质组学与多靶点超滤筛选研究匙羹藤干预餐后高血糖的作用机制与活性物质基础 | 20 |
青年科学基金项目 | 基于药物代谢组学和蛋白质组学的防己治疗类风湿关节炎体内药效物质和作用机制研究 | 20 |
面上项目 | 基于定量化学蛋白质组技术的临床共价药物靶标全景式分析 | 55 |
基于以上的问题,我们开设了这节理论与实践的课程,这次课程基于项目申请和文献发表的角度,给大家介绍蛋白质组学分析及与其他组学整合分析思路。
医药加宋伟老师公开课计划表
网课 | 标题 |
概述 | 基于生信工具方法指导项目申请的思路 |
第01节 | 转录组高通量数据分析思路 |
第02节 | 疾病公共数据库GEO挖掘分析 |
第03节 | 非编码RNA生信分析及ceRNA策略思路 |
第04节 | 癌症数据库TCGA分析思路 |
第05节 | 多组学整合分析思路 |
第06节 | lncRNA测序或芯片高通量数据生信分析思路 |
第07节 | 单细胞测序简介及生信分析思路 |
第08节 | 中药网络药理学分析思路 |
第09节 | m6A甲基化测序分析思路 |
第10节 | 代谢组学简介及生信分析思路 |
第11节 | 蛋白组学简介及生信分析思路 |
第12节 | 肠道菌群16s测序分析思路 |
第13节 | 待定(根据学员的需求及提议) |
主讲人:宋伟
研究成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。
研究方向:有十多年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。
培训经历:在全国上海、北京、广州、沈阳、济南、武汉等城市举办过几十场培训班。培训的对象有:医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。
培训方向:《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《公共数据挖掘分析》、《TCGA&GEO数据库挖掘》、《cytoscape网络图构建与美化》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《非编码RNA生信挖掘及ceRNA分析》、《R语言培训》等
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一定的实验条件与相匹配的科研经费
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3. 生信数据挖掘分析服务。
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专家一:美国大学正教授,
至今发表SCI论文37篇,其中包括Cell 通信作者1篇 (2019),第一作者1篇, Nature 通信作者1篇 (2017),Molecular Cell 通信作者2篇和Nature Communication 通信作何2篇。累计IF近320分。其中2007年作为第一作者发表的Cell论文, 单篇引用573次, 是自发表以来色素研究领域引用次数最高的论文。
专家二:中科院研究员,长期从事单细胞多组学方面的项目研究,目前已在Nature等杂志发表文章四十多篇,承担国家科技部、国家自然基金委和重点研发计划等多项课题。
专家三:曾在海外从事微⽣态与营养健康相关研究10余年,主要涉及肠道菌群,肠道炎症反应、大肠癌发病机制等,具备深厚的理论研究及实验操作经验。近年来在Journal of Clinical Investigation, Nucleic Acids Research, PNAS, Cell Metabolism, Gastroenterology 等国际权威期刊发表SCI学术论文31 篇,总影响因100~200。
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