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蛋白组学生信分析及组学整合思路【医药加网课】

实时直播

2020年4月10日(周五)19:00

医药加平台直播间

蛋白组学生信分析及组学整合思路

01课 程 简介

    

蛋白质组学proteomics研究是接基因组学研究后的生命科学发展的一个大方向之一。蛋白质的结构和功能最终直接影响着生命活动的变化,基因转录水平的研究只能在一定程度上反映基因表达产物的变化,而真正发挥功能的蛋白要经过转录后加工、翻译调控以及翻译后加工等许多步骤和调控才能形成,因而对蛋白质的直接研究才能真实的解释各种生命现象

常见的蛋白组学测序由iTRAQ技术,它可以同时检测几千个蛋白的表达。有些生物医药的研究人员做了蛋白质组学数据,但是会遇到一些问题:

蛋白组学的研究方法有哪些

iTRAQ技术蛋白质组学报告怎样解读?

怎样获得关键靶标蛋白?

蛋白质组学与转录组或基因组或代谢组如何整合?



项目类型

题目

金额

面上项目

基于转录组学和蛋白质组学研究鹿茸“健骨”功效的分子机制

56

面上项目

基于卵泡液蛋白质组学的痰湿型PCOS不孕中医证候学研究

55

面上项目

基于nano LC-MS/MS技术草酸影响猪苓菌核形成的乙酰化修饰蛋白质组学研究

55

面上项目

基于SILAC的分泌蛋白质组学技术研究绞股蓝总苷在治疗肝损伤进程中的作用机理

55

地区科学基金项目

基于iTRAQ蛋白质组学及网络药理学技术的九节抗抑郁机制研究

34

地区科学基金项目

基于活性肌酐探针导向的蛋白质组学系统筛选肌酐肾小管转运体

34

青年科学基金项目

基于代谢/蛋白质组学技术及组学间系统生物信息学交联分析探讨艾灸干预AS多靶点效应机制

21

青年科学基金项目

基于iTRAQ定量蛋白质组学和网络药理学探究药食同源方YH0618减少阿霉素导致脱发的分子机制研究

21

青年科学基金项目

基于药物蛋白质组学与多靶点超滤筛选研究匙羹藤干预餐后高血糖的作用机制与活性物质基础

20

青年科学基金项目

基于药物代谢组学和蛋白质组学的防己治疗类风湿关节炎体内药效物质和作用机制研究

20

面上项目

基于定量化学蛋白质组技术的临床共价药物靶标全景式分析

55


基于以上的问题,我们开设了这节理论与实践的课程,这次课程基于项目申请和文献发表的角度,给大家介绍蛋白质组学分析及与其他组学整合分析思路



医药加宋伟老师公开课计划表

网课

标题

概述

基于生信工具方法指导项目申请的思路

第01节

转录组高通量数据分析思路

第02节

疾病公共数据库GEO挖掘分析

第03节

非编码RNA生信分析及ceRNA策略思路

第04节

癌症数据库TCGA分析思路

第05节

多组学整合分析思路

第06节

lncRNA测序或芯片高通量数据生信分析思路

第07节

单细胞测序简介及生信分析思路

第08节

中药网络药理学分析思路

第09节

m6A甲基化测序分析思路

第10节

代谢组学简介及生信分析思路

第11节

蛋白组学简介及生信分析思路

第12节

肠道菌群16s测序分析思路

第13

待定(根据学员的需求及提议)

02讲师简介

主讲人:宋伟

 

研究成果:参与完成了近百篇软件著作权和发明专利的撰写和申请;肺癌、胰腺癌、骨肉瘤、胃癌等数据库的分析和构建;完成个体基因检测流程和无创唐筛流程的开发。

 

研究方向:有十多年的生信分析经验,擅长方向有转录组测序分析、芯片数据分析、疾病机理研究分析、疾病预后与基因关联分析、项目分析思路设计以及个性化分析等,精通perl、R等编程语言。

 

培训经历在全国上海、北京、广州、沈阳、济南、武汉等城市举办过几十场培训班。培训的对象有:医生、学生、科研工作者、生信爱好者等。

培训方向:《测序与芯片数据分析》、《生物信息学的魅力》、《公共数据挖掘分析》、《TCGA&GEO数据库挖掘》、《cytoscape网络图构建与美化》、《生信与临床医学的关系》、《生信实用工具培训》、《非编码RNA生信挖掘及ceRNA分析》、《R语言培训》等



03观看方式

1、关注《医药加平台》公众号。


2、后台回复“蛋白组学




您的需求:

如果您是做【肿瘤/m6a/单细胞测序/表观遗传/骨】等方向的,并需要发一篇高水平的文章,需要个性化课题设计与指导服务




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医药加科研大咖的简介

专家一:美国大学正教授,

至今发表SCI论文37篇,其中包括Cell 通信作者1篇 (2019),第一作者1篇, Nature 通信作者1篇 (2017),Molecular Cell 通信作者2篇和Nature Communication 通信作何2篇。累计IF近320分。其中2007年作为第一作者发表的Cell论文, 单篇引用573次, 是自发表以来色素研究领域引用次数最高的论文。


专家二:中科院研究员,长期从事单细胞多组学方面的项目研究,目前已在Nature等杂志发表文章四十多篇,承担国家科技部、国家自然基金委和重点研发计划等多项课题。


专家三:曾在海外从事微⽣态与营养健康相关研究10余年,主要涉及肠道菌群,肠道炎症反应、肠癌发病机制等,具备深厚的理论研究及实验操作经验。近年来在Journal of Clinical Investigation, Nucleic Acids Research, PNAS, Cell Metabolism, Gastroenterology 等国际权威期刊发表SCI学术论文31 篇,总影响因100~200



此外医药加专家库资源集中了上百位高水平国自然专家,方向有:各种肿瘤,神经科学,中医药,骨科,心脑血管,免疫,药理, 单细胞,m6a,基因编辑,眼科,非编码RNA,组织胚胎,微生物组,呼吸病,蛋白代谢组,肿瘤药学,干细胞,生物信息,中西医结合,内分泌等方向


更多科研大咖也在不断新增中。。。 




医药加平台简介医药加平台创立于2016年上海遐永医药科技有限公司),采用线上网络课堂与线下培训相结合的方式,整合资源,构建平台,为广大科研人员,医生、医学生提供整体完善的科研培训。目前已覆盖受众40余万科研人员。
医药加平台已经聘请了上百位各研究领域的专家(以医学,生命科学教授为主),都具有丰富的课题设计指导高水平论文指导国自然项目评审经验医药加金牌学习班招聘高水平课题指导专家 医药加金牌学习班自开办以来,已经成功举办了几百期,培训了全国(包涵港、澳、台地区)及加拿大、丹麦、澳大利亚等国家超过千家科研单位的近万名学员。良好的课堂氛围和讲师耐心的课后跟进,获得了学员的交口称赞。医药加金牌学习班,是让学员们真正能够学以致用,在科研上更上一层楼的学习班。 2017-2019年医药加学习班全年数据:金牌学习班场次:350+培训出的学员人次:9000+开设金牌课程数量:20门+开班城市:北京,上海,广州,深圳,南京,成都,武汉,长春,哈尔滨大连,昆明医药加网络课堂参与人次:10万人次培训合作单位有:中科院,北大,清华,交大,浙大,复旦,南大,山大,吉大,武大,协和,首都医科等各地医科大学,全国各省中医药大学,以及全国各省市三甲医院。





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