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多组学联合网络药理学及实验验证研讨会

腾讯会议网络会议室  2022年12月10-11




课程背景及简介:

传统中药历史悠久,在治疗复杂慢性疾病方面具有独到的疗效和较小的毒副作用。但中药存在成分复杂、机制不清的问题,阻碍了中药的现代化和国际化。中药的物质基础和作用机理,尚需应用现代医学和生物科学技术,进行深入的研究。近年来,将系统生物学的思想和方法应用于中药研究中,正成为一种新的趋势。中药网络药理学已发展成为一个新的交叉学科,它将网络科学、生物信息学、计算机科学和数学等学科的方法结合到中药药理的研究中,从分子水平和分子网络调控的背景中阐明中药的作用机理。尤其是,将转录组、蛋白质组、代谢组等多组学技术与网络药理学研究方法相结合,打破了传统的中药复方机制研究的瓶颈,使得原先难以定性的机制得以预测和验证。
本次学习班将邀请长期从事多组学及网络药理学研究的专业人士, 结合个人实践经验和最新的《网络药理学评价方法指南》, 带领广大学员,共同学习将多组学和网络药理学的研究方法用于中药复方研究。讲课内容涉及网络药理学的数据获取、分析方法、实验验证方法、论文撰写、项目设计等方面。通过大量实际案例,介绍多组学结合网络药理学在中药复方研究中的思路及操作。



课程内容、目标与特色:

本次课程以SCI文章为案例主线,逐一详细剖析,全程电脑实战教学。理论与实践相结合,老师将以最简单易懂的方式,既介绍网络生物学、中药网络药理学的研究路线、发展状况和最新前沿进展,又介绍具体的数据库、工具和软件的使用,并在课堂上进行上机指导。本学习班全部采用免费数据库和在线分析工具,学员不需要编写程序。


授课老师:

赵老师,多年从事生物信息学及中药网络药理学方面的研究, 发表生物信息学、网络药理学及中药复方相关SCI数十篇,含多篇5分以上的文章,主持多项国家自然基金和省部级科研课题,获得多项省部级科研及教学奖项。讲课效果好,获得学员好评。


适合对象:

各级医院临床医生、药师、科研单位研究人员、高校硕/博士研究生、对中药复方、组学数据分析、网络药理学感兴趣的广大师生(尤其适合初学者和无基础的学员,无需任何编程基础)。

会议时间:2022年9月3-4日

会议地点:腾讯会议网络会议室

主办方:上海循掘生物科技中心


收费标准

会务费用:3000元/人

优惠政策

1. 提前报名并付款的,可以预先拿到学习资料

2. 三人组团报名,每人优惠100元

3. 四人组团报名,每人优惠200元,

4. 五人组团报名缴费,额外带一人免费注册同价值学习班!

5、可额外缴纳500元,作为复听费用(复听同样的课程)

可开具正规会务费发票,提供纸质盖章邀请函

报名方式:

    

    计算机辅助药物设计(分子对接)网络学习班

                    【12月24-25日】

医药加科研培训中心,12月24-25日  腾讯会议


近年来,随着计算机科学及相关基础学科的发展与进步,基于计算机图形学、数据库技术、人工智能等新技术的药物分子设计手段正日臻成熟,不断取得突破性进展,有力推动药物设计领域日趋完善。这不仅为新药创制事业提供了新利器,更有效加速了新药成功开发的概率、缩短新药上市周期,更好地满足临床需求。

计算机辅助药物设计(computer-aided drug design,CADD)通过计算机模拟等计算方法,预测药物与受体生物大分子之间的关系,设计和优化先导化合物。这种方法大大加快了新药设计的速度,节省了药物发现的人力和物力,使药物学家能够以理论为指导,有目的地开发新药。同时,在药物机制的研究中,在用实验方法验证药物与受体的相互作用之前,通常会用分子对接的方法预测药物与靶标的结合,以节省实验花费。计算机辅助药物设计已经成为新药开发、药物机制研究中重要的研究手段之一。

一、时间地点:12月24-25日腾讯会议

二、学习目标:

本课程系统讲解计算机辅助药物设计的关键技术,配合案例解析边讲边练,使学员能运用模拟软件针对每个技术点进行上机操作。学习班全部采用免费数据库、免费软件、和在线分析工具,学员不需要编写程序。适合零基础学员,做到课程学完,就能独立进行蛋白质结构同源建模、分子对接、虚拟筛选等计算分析。

三、授课方式:

本学习班全程在线电脑实战教学,90%以上为上机指导操作,无繁琐的理论授课。建立专属班级交流平台,学员学完后可以继续在班级群与老师同学交流问题,巩固学习内容。

四、参会对象

各级医院临床医生、药师、科研单位研究人员、高校老师、硕/博士研究生、对计算机辅助药物设计感兴趣的广大师生(尤其适合初学者和无基础的学员,无需任何基础,也无需学习任何编程语言)。

五、主讲专家:

本次主讲老师是生物信息学博士,大学教授, 从事计算生物学、生物信息学方向研究十余年,主持参与了多项国家自然基金项目,发表数十篇SCI论文,含多篇5分以上的文章。讲课效果好,深得学员好评。

课程安排:


时间

授课内容

第1天

9:00-12:00

1. 分子对接基础知识

2. 分子结构文件的获取和处理

  •   化合物结构的获取

  •   化合物ADMET性质预测

  •   多肽结构的获取

  •   蛋白结构的获取

  •   蛋白结构的同源建模

  •   不同格式结构文件的转换

  • 软件介绍

  •   蛋白对象的操作、展现、隐藏、标记、测量

  •   分子对接结果的美化展示

13:30-17:00

1. 配体-受体结合位点可视化分析工具介绍

2. 用AutoDock及autoDock vina进行小分子与蛋白对接

  •   准备工作

  •   准备受体文件

  •   准备配体文件

  •   确定对接盒子

  •   蛋白受体格点计算

  •   设置对接参数

  •   用AutoDock作分子对接

  •   结果查看与分析

  •   用AutoDock vina 作对接

  •   确定对接盒子的其他方法

第2天

9:00-12:00

    1.  用AutoDock Vina 作虚拟筛选

    1. l  蛋白活性口袋的预测

    2. l  化合物的下载与处理

    3. l  AutoDock vina 进行一对多或多对多的对接

    4. l  计算redocking多个pose的RMSD

    2.  金属酶蛋白与小分子对接

    1. l  用AutoDock4Zn作对接的方法

    用AotoDock vina作对接的方法

13:30-17:00

  1. 1.  蛋白-多肽对接

  2. l  用免费在线平台作对接

  3. l  用ADCP作对接—结合位点已知的情况

  4. l  用ADCP作对接—结合位点未知的情况

  5. l  用autoDock vina 作对接

  6. 2.  蛋白-蛋白对接

用免费在线平台作对接


备注:自带笔记本电脑,安装WINDOWS 64位操作系统。


学习费用

学费 3000元/每位(两天集中网络授课,互动性好,可开发票,可回放)


优惠政策

1. 疫情过后,可补差价参加医药加线下同名班

2. 参加过网络药理学习班的老学员可半价

3. 办理了SCI或者国自然VIP年卡的学员免费参加

 

报名方式:


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