弥漫性较低级别（Diffuse lower-grade）胶质瘤的整合基因组研究
【Ref: Cancer Genome Atlas Research Network. N Engl J Med. 2015 Jun 25;372(26):2481-98. doi: 10.1056/NEJMoa1402121. Epub 2015 Jun 10.】
由弥漫性低级别（Diffuse low-grade）和间变级别胶质瘤（Diffuse intermediate-grade gliomas）合称的弥漫性较低级别胶质瘤（Diffuse lower-gradegliomas），属WHO II 和III级胶质瘤。因临床表现的高度可变性，无法以病理学分级来精确地预测其预后，部分肿瘤可能一直处于静息状态，而部分可以迅速地进展为胶质母细胞瘤。因此，病理学诊断的结果具有不准确性。最近，有关研究报道分子学病理检测IDH、TP53和ATRX基因突变及染色体臂1p/19q共缺失等已作为较低级别胶质瘤生物学标记物。
癌症基因组图谱研究网络的成员、美国埃默里大学医院Winship癌症研究所病理学和医学实验室Daniel J. Brat等最近在2015年6月的《N Engl J Med》发表论文，论述弥漫性较低级别胶质瘤的整合基因组分析，为临床医生介绍肿瘤分子学病理诊断的重要性。
该项研究中收集293例成人较低级别胶质瘤外显子测序、DNA拷贝数、DNA甲基化、信使RNA表达、microRNA表达以及靶蛋白表达数据；并将这些数据和患者的临床资料进行整合分析。采用CoC聚类分析方法将患者分为CoC 1，CoC2和CoC3三大类（图1）。分析结果，发现CoC分类和IDH-1p/19q状态密切相关。
图1. 293例较低级别胶质瘤CoC聚类分析。
IDH野生型较低级别胶质瘤富集在CoC聚类中的信使RNA族R2、microRNA族Mi3、DNA 甲基化族M4和DNA拷贝数族C2。IDH突变、1p/19q共缺失在较低级别胶质瘤中富集于R3、M2、M3和C3。IDH突变、1p/19q非共缺失在较低级别胶质瘤中富集于R1、M5、C1和Mi1。
患者的预后分析中，发现依据IDH、TP53及1p/19q分子学病理分型比传统组织病理学更为准确地判断患者的生存时间。其中IDH突变，1p/19q共缺失的患者预后最好（图2），这些病人还往往伴有 CIC、FUBP1、NOTCH1和TERT启动子区突变。几乎所有的IDH突变，1p/19q非共缺失的患者都伴有TP53突变（94%）和ATRX失活（86%）。另外，在大部分IDH野生较低级别胶质瘤中，患者的遗传改变和临床生物学行为与原发性胶质母细胞瘤患者高度相似（图3）。
图2. 基于IDH-1p/19q状态的预后分析。
作者指出，整合基因组多维数据可以将较低级别胶质瘤分为三大类，证实分子学病理诊断比常规病理学诊断具有更好的判断预后的价值。IDH突变的较低级别胶质瘤常伴有1p/19q共缺失或TP53突变。IDH未突变的大部分较低级别胶质瘤在分子学和临床生物学行为中与原发胶质母细胞瘤高度相似。
（复旦大学附属华山医院Eric编译，德国科隆大学医学院神经外科郑锋博士审校，《神外资讯》编辑部主编、复旦大学附属华山医院陈衔城教授终审）
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