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Ⅱ、Ⅲ级胶质瘤的基因突变全景图和克隆体系

2015-08-10 Eric 神外资讯

Ref: Suzuki H, et al. Nat Genet. 2015 May;47(5):458-68. doi: 10.1038/ng.3273. Epub 2015 Apr 13.


传统观点认为,WHOⅡ、Ⅲ级胶质瘤进展较为缓慢,但多数可演变为恶性胶质瘤。目前的研究发现此类肿瘤中存在IDH1和其他基因的突变,可是对其分子学发病机制的了解并不完全。日本名古屋医科大学神经外科Suzuki H根据Ⅱ、Ⅲ级胶质瘤的两个大规模高通量测序数据,描绘Ⅱ、Ⅲ级胶质瘤基因突变的全景图、信号通路变化以及检测驱动基因(图1)。研究论文发表在2015年5月的Nat Genet杂志上。



图1. Ⅱ、Ⅲ级胶质瘤DNA拷贝数改变情况。

通过多维数据整合分析,Ⅱ、Ⅲ级胶质瘤可以分为三类不同的肿瘤亚型(图2)。每一个亚型具有不同的基因突变和临床特点(图3)。


图2. 根据日本JPN以及美国TCGA数据库绘制的Ⅱ、Ⅲ级胶质瘤基因突变全景图和3个亚型分类。

研究证实Ⅱ、Ⅲ级胶质瘤中常见的基因突变,包括IDH1、TERT启动子 TP53、ATRX、CIC、FUBP1以及1p和19q共缺失。根据IDH、TP53以及1p/19基因的变化情况,Ⅱ、Ⅲ级胶质瘤可分为:第1类:IDH基因突变和1p/19q共缺失;可伴TERT启动子突变,伴或不伴CIC和/或 FUBP1突变。第2类:存在IDH基因突变但不伴1p/19q共缺失,可伴TP53基因突变;并经常性有ATRX突变,但罕有CIC或FUBP1突变。第3类:即IDH基因野生型肿瘤,约占20.6%的Ⅱ、Ⅲ级胶质瘤,其中2/3为级胶质瘤,特别是间变性星形细胞瘤通常进展迅速,预后类似GBM。


图3. Ⅱ、Ⅲ级胶质瘤亚型和病理分型对预后的影响,总体而言,第3类Ⅱ、Ⅲ级胶质瘤预后较差。

通过不同等位基因之间的共存突变基因推断,基因突变存在时间顺序,并且在驱动克隆选择的基因突变中表现为功能交互。进一步通过连续样本和多点取材样本分析发现,肿瘤内部有着高度时间和空间异质性(图4)。这可能由复杂、有序的多克隆选择和进化所决定。


图4. Ⅱ、Ⅲ级胶质瘤内部存在时间和空间异质性和克隆进化。


(复旦大学附属华山医院Eric编译,复旦大学附属华山医院宋剑平博士审校,《神外资讯》编辑部主编、复旦大学附属华山医院陈衔城教授终审)


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