通过CSF来源的环流肿瘤DNA测序分析脑干胶质瘤的分子谱
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【Ref: Pan C, et al. Acta Neuropathol. 2018 Nov 20. doi: 10.1007/s00401-018-1936-6. [Epub ahead of print]】
脑干胶质瘤是一组分子异质性疾病。因为肿瘤位于重要功能区，所能采取的治疗手段非常有限；难以安全地切除，即使活检也具挑战性，因此常规分子谱（molecular profiling）的分析和制定个性化的治疗方案受到限制。首都医科大学天坛医院神经外科的Changcun Pan等通过收集脑干胶质瘤患者的脑脊液（CSF），对在CSF中环流肿瘤DNA（circulating tumor DNA，ctDNA）进行测序，并作肿瘤分子谱分析，结果发表在2018年11月的《Acta Neuropathol》在线上。
该研究纳入57例脑干胶质瘤患者；所有CSF标本均在切除肿瘤之前采集；52例（91.2%）在手术中直接收集CSF、2例（3.5%）经脑室-腹腔分流术和3例（5.3%）通过腰穿获得。接着对CSF源性ctDNA进行胶质瘤相关基因的深度测序，同时与血液中的肿瘤DNA配对（图1）。在47例（82.5%）CSF来源的ctDNA标本中，发现一个或一个以上肿瘤基因突变。在37例原发性肿瘤内有一个或一个以上基因突变的患者中，36例（97.3%）CSF来源的ctDNA中确有基因突变存在；原发性肿瘤的所有突变基因在31例（83%）CSF中均检测到，34例（91.9%）发现半数以上突变基因。10例原发性肿瘤基因突变阴性的患者中，3例（30%）可在CSF中检测到体细胞的改变。采用血浆ctDNA检测基因突变的敏感性显著差于CSF来源ctDNA（38%比100%）。
图1. 使用CSF来源ctDNA测序基因的流程示意图。a.脑干肿瘤分布情况，大部分肿瘤位于桥脑或延髓；b.ctDNA进入CSF；c.CSF来源ctDNA的收集方法：脑室-腹腔分流术中或腰穿；d.对于特定的患者，采集外周血分离血浆ctDNA。
研究表明，CSF来源的ctDNA深度测序是检测脑干肿瘤特异性基因突变的一种可靠技术，可以替代脑干肿瘤活检术进行分子谱分析。
组稿
陈灵朝 医师
复旦大学附属华山医院
编译
严贵忠 医师
兰州大学第二医院
审校
王知秋 教授
复旦大学附属华山医院
终审
陈衔城 教授
《神外资讯》主编
复旦大学附属华山医院